MN967481.1 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004076.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 787.793 bits (426), Expect = 0.000e+0
Identity = 431/433 (99.54%), Postives = 431/433 (99.54%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGT 817
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    48062 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGT 47630

HSP 2 Score: 573.582 bits (310), Expect = 3.286e-161
Identity = 313/314 (99.68%), Postives = 313/314 (99.68%), Query Frame = 1

Query:     1422 GGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCC-ATTTGAACCATATTAA 1734
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct:    41195 GGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCCCATTTGAACCATATTAA 40882

HSP 3 Score: 505.256 bits (273), Expect = 1.216e-140
Identity = 276/277 (99.64%), Postives = 276/277 (99.64%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    48408 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 48133

HSP 4 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.063e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1173 GTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGG 1423
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    41852 GTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGG 41602

HSP 5 Score: 414.77 bits (224), Expect = 2.108e-113
Identity = 227/228 (99.56%), Postives = 227/228 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      810 TGTA-AGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGT 1036
                |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    46717 TGTATAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGT 46490

HSP 6 Score: 263.345 bits (142), Expect = 8.079e-68
Identity = 142/142 (100.00%), Postives = 142/142 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1032 AAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACG 1173
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    45593 AAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACG 45452

HSP 7 Score: 235.645 bits (127), Expect = 1.761e-59
Identity = 127/127 (100.00%), Postives = 127/127 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 127
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    48605 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 48479

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: CM010798.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 787.793 bits (426), Expect = 0.000e+0
Identity = 431/433 (99.54%), Postives = 431/433 (99.54%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGT 817
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32384505 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGT 32384073

HSP 2 Score: 568.042 bits (307), Expect = 1.529e-159
Identity = 312/314 (99.36%), Postives = 312/314 (99.36%), Query Frame = 1

Query:     1422 GGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCC-ATTTGAACCATATTAA 1734
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 32377177 GGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATATTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCCCATTTGAACCATATTAA 32376864

HSP 3 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.404e-135
Identity = 275/280 (98.21%), Postives = 275/280 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAAT---GCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32384855 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 32384577

HSP 4 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.467e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1173 GTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGG 1423
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32377815 GTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTACTTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGTTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGG 32377565

HSP 5 Score: 403.69 bits (218), Expect = 4.563e-110
Identity = 225/228 (98.68%), Postives = 225/228 (98.68%), Query Frame = 1

Query:      810 TGTA-AGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGT 1036
                |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32382566 TGTATAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTTTTATGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGT 32382339

HSP 6 Score: 263.345 bits (142), Expect = 8.079e-68
Identity = 142/142 (100.00%), Postives = 142/142 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1032 AAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACG 1173
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32381440 AAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACG 32381299

HSP 7 Score: 235.645 bits (127), Expect = 1.761e-59
Identity = 127/127 (100.00%), Postives = 127/127 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 127
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32385064 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 32384938

HSP 8 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.516e-39
Identity = 106/114 (92.98%), Postives = 106/114 (92.98%), Query Frame = 1

Query:      186 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAA 299
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 11512295 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGTAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 11512408

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: CM010795.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.233e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17858882 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 17858607

HSP 2 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.737e-129
Identity = 269/277 (97.11%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17879736 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 17879461

HSP 3 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.467e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 17879385 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 17878978

HSP 4 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.078e-123
Identity = 364/421 (86.46%), Postives = 364/421 (86.46%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTT-GCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 17858534 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATCATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGA-CTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 17858127

HSP 5 Score: 433.236 bits (234), Expect = 5.819e-119
Identity = 263/277 (94.95%), Postives = 263/277 (94.95%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct: 17920369 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 17920094

HSP 6 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.123e-108
Identity = 357/424 (84.20%), Postives = 357/424 (84.20%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||| ||| |||| || |||
Sbjct: 17920019 TATTTTACAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAA 17919606

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000461.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.737e-129
Identity = 269/277 (97.11%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:     5370 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 5095

HSP 2 Score: 431.39 bits (233), Expect = 2.093e-118
Identity = 363/424 (85.61%), Postives = 363/424 (85.61%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:     5016 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 4603

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 178.399 bits (96), Expect = 3.010e-42
Identity = 108/114 (94.74%), Postives = 108/114 (94.74%), Query Frame = 1

Query:      186 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAA 299
                |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 14673360 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACAGATAAATAATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 14673247

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004600.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 172.859 bits (93), Expect = 1.401e-40
Identity = 107/114 (93.86%), Postives = 107/114 (93.86%), Query Frame = 1

Query:      186 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAA 299
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct:    20374 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 20261


Match Name	Summary
AGQN03004076.1	E-Value: 3.286e-161, PID: 99.54 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010798.2	E-Value: 1.529e-159, PID: 99.54 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence [more]
CM010795.2	E-Value: 1.233e-130, PID: 97.47 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000461.1	E-Value: 5.737e-129, PID: 97.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 3.010e-42, PID: 94.74 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004600.1	E-Value: 1.401e-40, PID: 93.86 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-61665_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1321.47 bits (715), Expect = 0.000e+0
Identity = 785/813 (96.56%), Postives = 785/813 (96.56%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACAT---ATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCT 810
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAA------------GAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCT------------GTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCT 789

HSP 2 Score: 996.464 bits (539), Expect = 0.000e+0
Identity = 548/552 (99.28%), Postives = 548/552 (99.28%), Query Frame = 1

Query:     1174 TGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCC-ATTTGA 1724
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct:      790 TGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTACTTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGTTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATATTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCCCATTTGA 1341

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51510_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 811.799 bits (439), Expect = 0.000e+0
Identity = 582/647 (89.95%), Postives = 582/647 (89.95%), Query Frame = 1

Query:      126 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTT-GCTAAACTAGATTTTAAC 771
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |    |    | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || | ||||
Sbjct:       27 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGT-T-TTCA-ATG----C----C-TTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACT---TGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATCATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGA-CTTCGCTAAACTTGACTATAAC 648

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51512_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 473.863 bits (256), Expect = 4.522e-132
Identity = 377/434 (86.87%), Postives = 377/434 (86.87%), Query Frame = 1

Query:      371 ATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:        1 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG--GTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACT---TGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 420

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51519_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 374.144 bits (202), Expect = 4.718e-102
Identity = 222/232 (95.69%), Postives = 222/232 (95.69%), Query Frame = 1

Query:      146 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATT 377
                |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct:      569 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATT 800

HSP 2 Score: 353.83 bits (191), Expect = 6.146e-96
Identity = 302/354 (85.31%), Postives = 302/354 (85.31%), Query Frame = 1

Query:      422 AAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAAC 771
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | ||||
Sbjct:      809 AAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAAC 1152


Match Name	Summary
PKGMv1-61665_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 96.56 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51510_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 89.95 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51512_t	E-Value: 4.522e-132, PID: 86.87 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51519_t	E-Value: 4.718e-102, PID: 95.69 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044376.1
Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 787.793 bits (426), Expect = 0.000e+0
Identity = 431/433 (99.54%), Postives = 431/433 (99.54%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGT 817
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23502420 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGT 23501988

HSP 2 Score: 573.582 bits (310), Expect = 3.229e-161
Identity = 313/314 (99.68%), Postives = 313/314 (99.68%), Query Frame = 1

Query:     1422 GGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCC-ATTTGAACCATATTAA 1734
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23494939 GGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCCCATTTGAACCATATTAA 23494626

HSP 3 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.327e-135
Identity = 275/280 (98.21%), Postives = 275/280 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAAT---GCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23502770 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23502492

HSP 4 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.212e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23624336 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23624061

HSP 5 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.027e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1173 GTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGG 1423
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23495597 GTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGG 23495347

HSP 6 Score: 462.783 bits (250), Expect = 7.292e-128
Identity = 365/420 (86.90%), Postives = 365/420 (86.90%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||    | |||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 23641323 TATTTTGCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 23640913

HSP 7 Score: 455.396 bits (246), Expect = 1.220e-125
Identity = 267/277 (96.39%), Postives = 267/277 (96.39%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23641678 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23641403

HSP 8 Score: 455.396 bits (246), Expect = 1.220e-125
Identity = 267/277 (96.39%), Postives = 267/277 (96.39%), Query Frame = 1

Query:      118 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 394
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23664673 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23664398

HSP 9 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.042e-123
Identity = 364/421 (86.46%), Postives = 364/421 (86.46%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTT-GCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 23623988 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATAATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGA-CTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 23623581

HSP 10 Score: 436.93 bits (236), Expect = 4.420e-120
Identity = 364/424 (85.85%), Postives = 364/424 (85.85%), Query Frame = 1

Query:      386 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 804
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 23664319 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 23663906

HSP 11 Score: 409.23 bits (221), Expect = 9.635e-112
Identity = 226/228 (99.12%), Postives = 226/228 (99.12%), Query Frame = 1

Query:      810 TGTA-AGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGT 1036
                |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23500476 TGTATAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGT 23500249

HSP 12 Score: 263.345 bits (142), Expect = 7.938e-68
Identity = 142/142 (100.00%), Postives = 142/142 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1032 AAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACG 1173
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23499342 AAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACG 23499201

HSP 13 Score: 235.645 bits (127), Expect = 1.730e-59
Identity = 127/127 (100.00%), Postives = 127/127 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 127
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23502979 ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 23502853


Match Name	Summary
NC_044376.1	E-Value: 3.229e-161, PID: 99.54 Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652072.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA

HSP 1 Score: 3160.74 bits (1711), Expect = 0.000e+0
Identity = 1725/1731 (99.65%), Postives = 1725/1731 (99.65%), Query Frame = 1

Query:        8 CAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACAT---ATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATT-CCATTTGAACCATATTAA 1734
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct:      137 CAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTTGTTCTTCACTTCCATTCCCATTTGAACCATATTAA 1867

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652515.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA

HSP 1 Score: 1417.5 bits (767), Expect = 0.000e+0
Identity = 1380/1675 (82.39%), Postives = 1380/1675 (82.39%), Query Frame = 1

Query:        9 AGGACTAATCTCCA---CTACTAC--T-TTCAAAGAACAACC---AGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTT-GCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATA-GACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGC-TCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1665
                |||| |||||||||    ||||||  | ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||  |||| |  || |||| |  | | |||| |||| || | ||| ||| |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||  ||| | || |||||| ||||||||   ||  || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| |  |||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || |||||||  ||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  |  || || ||| ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||  || | ||| ||||||||| |  |   |||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| |||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |  ||      | |||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||   |||||||  ||| || || |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      112 AGGAGTAATCTCCAGTAGTACTACAATATTCAAAGAACAACCGGAAGCAATTGTCCGACGATCAGGAAACTACAAACCCACGTTGTGGGATGCTCATTTTTTCAAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACT---TGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATAATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGA-CTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTG-GC-ATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGAT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGGGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAAT-GAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTA-TCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAA-CTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGA--AAATGAAA-GCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1759

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652513.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA

HSP 1 Score: 1399.03 bits (757), Expect = 0.000e+0
Identity = 1361/1652 (82.38%), Postives = 1361/1652 (82.38%), Query Frame = 1

Query:       31 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAAT-ACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGC-TCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAG--TCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1665
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||  |||| |  || |||| |  | | |||| |||| || | ||| | | |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||| ||| | || |||||| |||||||| |   | || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |  |||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  |  || || ||| ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||  || | ||| ||||||||| |  |   |||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| ||| || ||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| || |  |  | |   |||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||   |||||||  ||| ||||| |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      119 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTG-GC-ACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAAC-TGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTA-TCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAA-CTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGA--AAATGAAA-GCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAG-TCAAA-GCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1744

[Close]

BLAST of MN967481.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652514.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA

HSP 1 Score: 1386.11 bits (750), Expect = 0.000e+0
Identity = 1352/1645 (82.19%), Postives = 1352/1645 (82.19%), Query Frame = 1

Query:       31 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGAGTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAAT-ACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1665
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||    | |||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||  |||| |  || |||| |  | | |||| |||| || | ||| | | |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||| ||| | || |||||| |||||||| |   | || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| |   ||| |||||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  |  || | | || ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||   ||  |||| || | ||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| ||| || ||||  ||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| |  ||        |||||||  |||||||  ||||||||| || |||| ||||| |||||   |||||||  ||| ||||| |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      122 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACT---TGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTG-GC-ACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAAC-TGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTA-TCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGA--AAATGAAAGT-CGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1744


Match Name	Summary
XM_030652072.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.65 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA [more]
XM_030652515.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 82.39 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA [more]
XM_030652513.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 82.38 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA [more]
XM_030652514.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 82.19 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 249..515 e-value: 3.9E-98 score: 328.0
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 29..215 e-value: 2.0E-49 score: 167.9
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 28..553 e-value: 4.3E-197 score: 657.5
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 245..573
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 65..243 e-value: 4.3E-197 score: 657.5
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 18..573
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 18..573
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 26..238

Cannabis sativa cultivar Purple Kush terpene synthase 5 mRNA
complete cds

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, FN-clones109 (TMM50 minvalue)

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, PK-clones109 (TMM50 minvalue)

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAAT AGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTA TCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATC AATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAA TCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATAT CTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAAT AATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCA TTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTT TCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAG GATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAG GGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCA AACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCAT GATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCT TCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATA TGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAA CTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCT TAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTAC CCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTT AAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGG TCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTG ATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACG ATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAA TGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCA TTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATG TTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATA CATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATC TTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTG CTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGT TGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTA AATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAAT GGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAA TGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTG CCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGAT GGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTT GTTCTTCACTTCCATTCCATTTGAACCATATTAA
Sequence Length	1734
Sequence Checksum	975aafc41ad58debee77fef051c5af06

Sequence

ATGATTACAGGACTAATCTCCACTACTACTTTCAAAGAACAACCAGCAAT
AGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTA
TCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATC
AATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAA
TCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATAT
CTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAAT
AATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCA
TTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTT
TCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAG
GATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAG
GGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCA
AACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCAT
GATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCT
TCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATA
TGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAA
CTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCT
TAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTAC
CCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCTTATGGAGTGTGGGAGTT
AAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCCGAAAAATGCTCACAAAGATGGG
TCAATTGGTAACCTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTG
ATGAGCTAAGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACG
ATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAA
TGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCA
TTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATG
TTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATA
CATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACCCTTAATTCTAGTCAATC
TTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTG
CTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGT
TGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTA
AATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAAT
GGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAA
TGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTG
CCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGAT
GGGGTTGGTACTAATTTTGATCATTACACAAAAGATGGAATCATTTCCTT
GTTCTTCACTTCCATTCCATTTGAACCATATTAA

Sequence Length

1734

Sequence Checksum

975aafc41ad58debee77fef051c5af06

Summary

Resource Type	mRNA
Accession	MN967481.1
Organism	Cannabis sativa L.
Name	MN967481.1
Identifier	MN967481.1
Time Accessioned	Saturday, December 21, 2024 - 13:10
Time Last Modified	Saturday, December 21, 2024 - 13:10