MN967474.1 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: CM010795.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 765.633 bits (414), Expect = 0.000e+0
Identity = 419/421 (99.52%), Postives = 419/421 (99.52%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879385 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17878965

HSP 2 Score: 699.154 bits (378), Expect = 0.000e+0
Identity = 407/421 (96.67%), Postives = 407/421 (96.67%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17858534 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17858114

HSP 3 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.169e-170
Identity = 395/427 (92.51%), Postives = 395/427 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920019 TATTTTACAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17919593

HSP 4 Score: 549.575 bits (297), Expect = 5.557e-154
Identity = 297/297 (100.00%), Postives = 297/297 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17877917 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 17877621

HSP 5 Score: 516.336 bits (279), Expect = 5.637e-144
Identity = 291/297 (97.98%), Postives = 291/297 (97.98%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857131 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 17856835

HSP 6 Score: 510.796 bits (276), Expect = 2.622e-142
Identity = 290/297 (97.64%), Postives = 290/297 (97.64%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17913510 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 17913214

HSP 7 Score: 505.256 bits (273), Expect = 1.220e-140
Identity = 276/277 (99.64%), Postives = 276/277 (99.64%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879736 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 17879461

HSP 8 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.660e-132
Identity = 271/277 (97.83%), Postives = 271/277 (97.83%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858882 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 17858607

HSP 9 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.071e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878261 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 17878011

HSP 10 Score: 449.856 bits (243), Expect = 5.798e-124
Identity = 266/277 (96.03%), Postives = 266/277 (96.03%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 17920369 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 17920094

HSP 11 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.703e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 17857461 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17857211

HSP 12 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.703e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 17913845 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17913595

HSP 13 Score: 412.923 bits (223), Expect = 7.608e-113
Identity = 223/223 (100.00%), Postives = 223/223 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878861 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17878639

HSP 14 Score: 385.223 bits (208), Expect = 1.658e-104
Identity = 219/224 (97.77%), Postives = 219/224 (97.77%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAA-ATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858017 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAGATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTAAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 17857794

HSP 15 Score: 377.837 bits (204), Expect = 2.775e-102
Identity = 217/223 (97.31%), Postives = 217/223 (97.31%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17919478 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGA--CAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17919258

HSP 16 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.916e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878552 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 17878412

HSP 17 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.312e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 17919173 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 17919033

HSP 18 Score: 231.952 bits (125), Expect = 2.286e-58
Identity = 136/141 (96.45%), Postives = 136/141 (96.45%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 17857707 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGG-ATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 17857568

HSP 19 Score: 198.712 bits (107), Expect = 2.319e-48
Identity = 107/107 (100.00%), Postives = 107/107 (100.00%), Query Frame = 1

Query:       54 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 160
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879915 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 17879809

HSP 20 Score: 171.012 bits (92), Expect = 5.055e-40
Identity = 102/107 (95.33%), Postives = 102/107 (95.33%), Query Frame = 1

Query:       54 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 160
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920563 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 17920457

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000461.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 638.214 bits (345), Expect = 1.153e-180
Identity = 401/427 (93.91%), Postives = 401/427 (93.91%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5016 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 4590

HSP 2 Score: 516.336 bits (279), Expect = 5.637e-144
Identity = 291/297 (97.98%), Postives = 291/297 (97.98%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     3600 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 3304

HSP 3 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.717e-134
Identity = 272/277 (98.19%), Postives = 272/277 (98.19%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5370 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 5095

HSP 4 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.482e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct:     3938 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 3688

HSP 5 Score: 394.457 bits (213), Expect = 2.756e-107
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4475 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTAAA-TATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 4254

HSP 6 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.357e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct:     4168 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 4028

HSP 7 Score: 171.012 bits (92), Expect = 5.055e-40
Identity = 102/107 (95.33%), Postives = 102/107 (95.33%), Query Frame = 1

Query:       54 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 160
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5546 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 5440

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004076.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.757e-129
Identity = 269/277 (97.11%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:    48408 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 48133

HSP 2 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.482e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 825
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:    48062 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 47643

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: CM010798.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.482e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 825
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 32384505 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 32384086

HSP 2 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.482e-125
Identity = 269/280 (96.07%), Postives = 269/280 (96.07%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 32384855 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 32384577

HSP 3 Score: 156.239 bits (84), Expect = 1.416e-35
Identity = 104/114 (91.23%), Postives = 104/114 (91.23%), Query Frame = 1

Query:      219 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAA 332
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 11512295 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGTAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 11512408

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.539e-39
Identity = 106/114 (92.98%), Postives = 106/114 (92.98%), Query Frame = 1

Query:      219 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAA 332
                |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 14673360 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACAGATAAATAATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 14673247

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004600.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 161.779 bits (87), Expect = 3.042e-37
Identity = 105/114 (92.11%), Postives = 105/114 (92.11%), Query Frame = 1

Query:      219 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAA 332
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct:    20374 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 20261


Match Name	Summary
CM010795.2	E-Value: 1.169e-170, PID: 99.52 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000461.1	E-Value: 1.153e-180, PID: 93.91 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004076.1	E-Value: 5.757e-129, PID: 97.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010798.2	E-Value: 4.482e-125, PID: 86.67 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 6.539e-39, PID: 92.98 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004600.1	E-Value: 3.042e-37, PID: 92.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51512_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1483.98 bits (803), Expect = 0.000e+0
Identity = 856/877 (97.61%), Postives = 856/877 (97.61%), Query Frame = 1

Query:      864 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      429 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT-------------------T--GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1284

HSP 2 Score: 789.64 bits (427), Expect = 0.000e+0
Identity = 432/434 (99.54%), Postives = 432/434 (99.54%), Query Frame = 1

Query:      404 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 837
                ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTC--AGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 432

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51510_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1014.93 bits (549), Expect = 0.000e+0
Identity = 613/642 (95.48%), Postives = 613/642 (95.48%), Query Frame = 1

Query:      159 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 800
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       27 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCA-------ATC--C---TGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 656

HSP 2 Score: 955.838 bits (517), Expect = 0.000e+0
Identity = 537/547 (98.17%), Postives = 537/547 (98.17%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      765 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1311

HSP 3 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.423e-47
Identity = 106/107 (99.07%), Postives = 106/107 (99.07%), Query Frame = 1

Query:      951 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:      657 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 763

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-61665_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 859.812 bits (465), Expect = 0.000e+0
Identity = 682/780 (87.44%), Postives = 682/780 (87.44%), Query Frame = 1

Query:       61 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACT---TGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 825
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |    |    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | |    |  |   ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:       31 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACT-C----C----A-A--GAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGT-T-TTCA-ATG----C--T---TTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 783

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51517_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 660.374 bits (357), Expect = 0.000e+0
Identity = 373/381 (97.90%), Postives = 373/381 (97.90%), Query Frame = 1

Query:     1360 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 381

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51519_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 497.869 bits (269), Expect = 2.693e-139
Identity = 322/347 (92.80%), Postives = 322/347 (92.80%), Query Frame = 1

Query:      455 AAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 795
                |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      809 AAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 1155

HSP 2 Score: 431.39 bits (233), Expect = 2.770e-119
Identity = 303/332 (91.27%), Postives = 303/332 (91.27%), Query Frame = 1

Query:      863 AAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct:     1156 AAAGGCTACCATTTGCT--AGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT----T-----------------GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1464

HSP 3 Score: 388.917 bits (210), Expect = 1.691e-106
Identity = 228/237 (96.20%), Postives = 228/237 (96.20%), Query Frame = 1

Query:      179 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTC 415
                |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct:      569 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTC 805


Match Name	Summary
PKGMv1-51512_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.61 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51510_t	E-Value: 1.423e-47, PID: 95.48 Description: No definition line [more]
PKGMv1-61665_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.44 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51517_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.90 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51519_t	E-Value: 2.693e-139, PID: 92.80 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044376.1
Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 736.087 bits (398), Expect = 0.000e+0
Identity = 416/424 (98.11%), Postives = 416/424 (98.11%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGAT---CTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641323 TATTTTGCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23640900

HSP 2 Score: 693.614 bits (375), Expect = 0.000e+0
Identity = 406/421 (96.44%), Postives = 406/421 (96.44%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23623988 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATAATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23623568

HSP 3 Score: 632.674 bits (342), Expect = 5.270e-179
Identity = 400/427 (93.68%), Postives = 400/427 (93.68%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 838
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664319 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23663893

HSP 4 Score: 527.415 bits (285), Expect = 2.558e-147
Identity = 293/297 (98.65%), Postives = 293/297 (98.65%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23639848 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 23639552

HSP 5 Score: 516.336 bits (279), Expect = 5.538e-144
Identity = 291/297 (97.98%), Postives = 291/297 (97.98%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23662905 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 23662609

HSP 6 Score: 510.796 bits (276), Expect = 2.576e-142
Identity = 290/297 (97.64%), Postives = 290/297 (97.64%), Query Frame = 1

Query:     1444 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23622580 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 23622284

HSP 7 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.595e-137
Identity = 274/277 (98.92%), Postives = 274/277 (98.92%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641678 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23641403

HSP 8 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.613e-132
Identity = 271/277 (97.83%), Postives = 271/277 (97.83%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23624336 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23624061

HSP 9 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.216e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664673 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23664398

HSP 10 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.404e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      419 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 825
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 23502420 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 23502001

HSP 11 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.404e-125
Identity = 269/280 (96.07%), Postives = 269/280 (96.07%), Query Frame = 1

Query:      151 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 427
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23502770 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23502492

HSP 12 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.404e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640192 GTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 23639942

HSP 13 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.533e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23663239 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23662989

HSP 14 Score: 436.93 bits (236), Expect = 4.435e-120
Identity = 246/251 (98.01%), Postives = 246/251 (98.01%), Query Frame = 1

Query:     1194 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1444
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23622915 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23622665

HSP 15 Score: 412.923 bits (223), Expect = 7.474e-113
Identity = 223/223 (100.00%), Postives = 223/223 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23663778 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23663556

HSP 16 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.477e-111
Identity = 222/223 (99.55%), Postives = 222/223 (99.55%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640785 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23640563

HSP 17 Score: 385.223 bits (208), Expect = 1.629e-104
Identity = 218/223 (97.76%), Postives = 218/223 (97.76%), Query Frame = 1

Query:      835 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1057
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23623471 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 23623249

HSP 18 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.865e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640476 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 23640336

HSP 19 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.201e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct: 23663470 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCG 23663330

HSP 20 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.342e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:     1054 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1194
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 23623162 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 23623022

HSP 21 Score: 183.939 bits (99), Expect = 6.379e-44
Identity = 103/105 (98.10%), Postives = 103/105 (98.10%), Query Frame = 1

Query:       56 CAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 160
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641865 CAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 23641761

HSP 22 Score: 171.012 bits (92), Expect = 4.967e-40
Identity = 102/107 (95.33%), Postives = 102/107 (95.33%), Query Frame = 1

Query:       54 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 160
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664850 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 23664744


Match Name	Summary
NC_044376.1	E-Value: 5.270e-179, PID: 98.11 Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652514.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA

HSP 1 Score: 3020.39 bits (1635), Expect = 0.000e+0
Identity = 1671/1688 (98.99%), Postives = 1671/1688 (98.99%), Query Frame = 1

Query:       56 CAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACC---ATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      117 CAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1804

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652515.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA

HSP 1 Score: 2857.89 bits (1547), Expect = 0.000e+0
Identity = 1639/1685 (97.27%), Postives = 1639/1685 (97.27%), Query Frame = 1

Query:       56 CAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      135 CAATATTCAAAGAACAACCGGAAGCAATTGTCCGACGATCAGGAAACTACAAACCCACGTTGTGGGATGCTCATTTTTTCAAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATAATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1819

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652513.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA

HSP 1 Score: 2856.04 bits (1546), Expect = 0.000e+0
Identity = 1645/1693 (97.16%), Postives = 1645/1693 (97.16%), Query Frame = 1

Query:       54 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1740
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      112 TCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA 1804

[Close]

BLAST of MN967474.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030652072.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA

HSP 1 Score: 1386.11 bits (750), Expect = 0.000e+0
Identity = 1354/1647 (82.21%), Postives = 1354/1647 (82.21%), Query Frame = 1

Query:       61 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACT---TGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCA--GTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTA-TCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGA--AAATGAAA-GCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1680
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||  |||| |  || |  |||| | | |||| |||| || | ||| | | |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||| ||| | || |||||| ||||||||    | || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| |   ||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  |  || || ||| ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||   ||  |||| || | ||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| ||| || ||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| |  ||        |||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||   |||||||  ||| ||||| |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      160 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1797


Match Name	Summary
XM_030652514.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.99 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA [more]
XM_030652515.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.27 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA [more]
XM_030652513.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.16 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA [more]
XM_030652072.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 82.21 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 256..521 e-value: 3.3E-94 score: 315.2
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 40..224 e-value: 3.9E-48 score: 163.7
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 76..250 e-value: 8.3E-190 score: 633.4
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 39..561 e-value: 8.3E-190 score: 633.4
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 251..577
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 29..578
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 29..578
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 36..247

Cannabis sativa cultivar Purple Kush terpene synthase 31 mRNA
complete cds

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGGGAGAGCGGCCGCCAGATCTTCCGGATGGCTCGAGTTTTTCAGCAAG ATATCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCA ACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTC ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGA TGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTG AACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAAT CAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTG GAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGAC AATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGAC GAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGT ATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAG ATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACG AGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGT GAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAA GATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGAT ATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA GTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTT CTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATT TTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAG AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATAT ATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATT GAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGAT ATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCC TCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGT GATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACA CATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAA TACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACA GAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTC AGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAAC TTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAG GGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGA AGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTC AAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATG TACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGAC CAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA
Sequence Length	1740
Sequence Checksum	cbe2b11399c6d8a15a69032eac3a823a

Sequence

ATGGGAGAGCGGCCGCCAGATCTTCCGGATGGCTCGAGTTTTTCAGCAAG
ATATCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCA
ACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTC
ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGA
TGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTG
AACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAAT
CAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTG
GAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGAC
AATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGAC
GAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGT
ATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAG
ATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACG
AGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGT
GAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAA
GATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGAT
ATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA
GTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTT
CTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATT
TTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAG
AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATAT
ATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATT
GAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGAT
ATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCC
TCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGT
GATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACA
CATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAA
TACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACA
GAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTC
AGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAAC
TTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAG
GGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGA
AGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTC
AAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATG
TACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGAC
CAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATTTAA

Sequence Length

1740

Sequence Checksum

cbe2b11399c6d8a15a69032eac3a823a

Summary

Resource Type	mRNA
Accession	MN967474.1
Organism	Cannabis sativa L.
Name	MN967474.1
Identifier	MN967474.1
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 10:02
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 10:02