TPS12 | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 797.026 bits (431), Expect = 0.000e+0
Identity = 431/431 (100.00%), Postives = 431/431 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      501 AGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGT 931
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Sbjct:  3142598 AGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGT 3143028

HSP 2 Score: 544.035 bits (294), Expect = 2.725e-152
Identity = 294/294 (100.00%), Postives = 294/294 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1540 GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 1833
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Sbjct:  3145585 GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 3145878

HSP 3 Score: 501.562 bits (271), Expect = 1.663e-139
Identity = 274/275 (99.64%), Postives = 274/275 (99.64%), Query Frame = 1

Query:      229 TATA-AGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAG 502
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Sbjct:  3141857 TATACAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAG 3142131

HSP 4 Score: 470.169 bits (254), Expect = 4.690e-130
Identity = 254/254 (100.00%), Postives = 254/254 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1287 GTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATG 1540
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Sbjct:  3144966 GTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATG 3145219

HSP 5 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.711e-119
Identity = 235/235 (100.00%), Postives = 235/235 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGG 235
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Sbjct:  3140931 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGG 3141165

HSP 6 Score: 411.077 bits (222), Expect = 2.883e-112
Identity = 222/222 (100.00%), Postives = 222/222 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      927 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:  3143569 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790

HSP 7 Score: 261.498 bits (141), Expect = 3.073e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1147 AGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACG 1287
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Sbjct:  3144387 AGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACG 3144527

HSP 8 Score: 183.939 bits (99), Expect = 6.842e-44
Identity = 181/222 (81.53%), Postives = 181/222 (81.53%), Query Frame = 1

Query:      927 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:  2519567 AAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 9 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.145e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      928 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:  2529112 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 183.939 bits (99), Expect = 6.842e-44
Identity = 181/222 (81.53%), Postives = 181/222 (81.53%), Query Frame = 1

Query:      927 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:    18504 AAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 2 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.145e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      928 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:    27971 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191


Match Name	Summary
CM010790.2	E-Value: 2.725e-152, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03003403.1	E-Value: 6.842e-44, PID: 81.53 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
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Match Name	Summary
There are no matches against Genbank for this mRNA.

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 797.026 bits (431), Expect = 0.000e+0
Identity = 431/431 (100.00%), Postives = 431/431 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      501 AGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGT 931
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Sbjct:  2397968 AGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGT 2397538

HSP 2 Score: 544.035 bits (294), Expect = 2.677e-152
Identity = 294/294 (100.00%), Postives = 294/294 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1540 GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 1833
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Sbjct:  2394976 GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 2394683

HSP 3 Score: 501.562 bits (271), Expect = 1.634e-139
Identity = 274/275 (99.64%), Postives = 274/275 (99.64%), Query Frame = 1

Query:      229 TATA-AGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAG 502
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Sbjct:  2398709 TATACAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAG 2398435

HSP 4 Score: 470.169 bits (254), Expect = 4.608e-130
Identity = 254/254 (100.00%), Postives = 254/254 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1287 GTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATG 1540
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Sbjct:  2395595 GTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATG 2395342

HSP 5 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.681e-119
Identity = 235/235 (100.00%), Postives = 235/235 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGG 235
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Sbjct:  2399639 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGG 2399405

HSP 6 Score: 411.077 bits (222), Expect = 2.833e-112
Identity = 222/222 (100.00%), Postives = 222/222 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      927 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:  2396997 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776

HSP 7 Score: 261.498 bits (141), Expect = 3.019e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1147 AGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACG 1287
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Sbjct:  2396178 AGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACG 2396038

HSP 8 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.125e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      928 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:  2035141 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 9 Score: 172.859 bits (93), Expect = 1.455e-40
Identity = 179/222 (80.63%), Postives = 179/222 (80.63%), Query Frame = 1

Query:      927 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:  2020755 AAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

[Close]

BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.770e-39
Identity = 178/222 (80.18%), Postives = 178/222 (80.18%), Query Frame = 1

Query:      927 AAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1148
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Sbjct:   196606 AAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 2.677e-152, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]
NW_022060378.1	E-Value: 6.770e-39, PID: 80.18 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 3386.03 bits (1833), Expect = 0.000e+0
Identity = 1833/1833 (100.00%), Postives = 1833/1833 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 1833
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Sbjct:       42 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 1874

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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030644560.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 1718.5 bits (930), Expect = 0.000e+0
Identity = 932/933 (99.89%), Postives = 932/933 (99.89%), Query Frame = 1

Query:        1 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGG 933
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Sbjct:       42 TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAAATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTACTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAATCATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGATGG 974

HSP 2 Score: 1269.77 bits (687), Expect = 0.000e+0
Identity = 687/687 (100.00%), Postives = 687/687 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1147 AGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 1833
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Sbjct:      969 AGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT 1655

[Close]

BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 843.193 bits (456), Expect = 0.000e+0
Identity = 1195/1547 (77.25%), Postives = 1195/1547 (77.25%), Query Frame = 1

Query:      153 TATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGA-ACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACG--AT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTT-TCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AA-TTTCC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTG-T--TACAA--A-AGATGCCATA-A-ATTT---A---CT-GGAATTAGG---TTATCCACCCATAATTTACCATGCA-T-CCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAAT-GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGA 1670
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Sbjct:      239 TATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTT--A-CAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAA-A-AGA-TGTTAGTTGAGATGGAA---AACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATA-T--GTTAATATTA---ATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGAT-AGAA--AACATCAA-AAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTC-AAAA--AC-TA-C-ACTATAATGATATCAGAGC-AAA-AAA--A--GTTA--A-TGATTGATAATGATTATGATTATGATAT-CGA--AGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTG-TTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCA--CAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATC-ATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGA 1744

[Close]

BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 791.486 bits (428), Expect = 0.000e+0
Identity = 1282/1693 (75.72%), Postives = 1282/1693 (75.72%), Query Frame = 1

Query:      161 GAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTA-CTC--CGGTAA---TATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTT-AAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGAT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGAT-T-TATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTG-AAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AATTT-CC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTAT---CCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGG-TGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAA---TGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACA-ATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGG--ACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCC 1829
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Sbjct:      121 GAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTT---TCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAA-AG-GA-TGCTAGTTGAGATGGAA---AACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAAT-TATTTCAAGGACGAG---ACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGT-G-G-TGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC--A-CAATAATGA-TATCAGAGCAAAATAAA--TTGATGATTAAT-AATAATTATGATTATTATTACAATAT-TGA--AGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAG-AAAAAA-CAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATG-ATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATA-AAGAGATTTT-TGAATGTT-TGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGAT--GGA-T-TAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACA-G-TTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCC 1774

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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 784.1 bits (424), Expect = 0.000e+0
Identity = 1283/1696 (75.65%), Postives = 1283/1696 (75.65%), Query Frame = 1

Query:      161 GAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTA-CTC--CGGTAA---TATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAG-A-A-ATTTTCAATGTGTTT-AAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGAT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGAT-T-TATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTG-AAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AATTT-CC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTAT---CCACCCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGG-TGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAA---TGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACA-ATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGG--ACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCC 1829
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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 732.394 bits (396), Expect = 0.000e+0
Identity = 1176/1550 (75.87%), Postives = 1176/1550 (75.87%), Query Frame = 1

Query:      153 TATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATT---ATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAAC--GAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAA-TCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGC--GAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTG-AAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-A-ATTTCC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTT-ACAAAAGATGCCA-TA--AA-----TTTAC---TG----GAATTAGGTTAT--CCAC-CCATAATTTACCATGCATCCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAAT-GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGA 1670
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Sbjct:      207 TATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTT--A-CAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAA-A-AGA-TGTTAATTGAGATGGAA---AATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATA-T--ATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGAT---AGGAAAAATCAA--AACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTC-AATATCT---AAAGAAC-TA-C-ATTATAATGATATCACAAGAAAGAAA-GTTAATGATTGAT-AATGATAATGATTATGATTATGATAT-CGA--AATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATG-ATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACA-GTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATC-ATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGA 1724

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BLAST of TPS12 vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 645.601 bits (349), Expect = 0.000e+0
Identity = 847/1085 (78.06%), Postives = 847/1085 (78.06%), Query Frame = 1

Query:      161 GAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTA-CTC--CGGTAA---TATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAG-A-A-ATTTTCAATGTGTTT-AAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGAT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGAT-T-TATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTG-AAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGG 1231
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Match Name	Summary
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XM_030644560.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.89 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X2, mRNA [more]
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Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


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IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 282..607
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 102..281 e-value: 2.3E-183 score: 612.2
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TPS12

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, PK-clones109 (TMM50 minvalue)

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

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Sequences

Sequence	TTGGGAGTTCATCAATTTTCTCCACTTTCATTAATCCTTAATACTACAAA ATTAGCAAGAGCAAGTACATTATCAAGTGCTTGCTACCCCATCCAATGTA CTATGGTCAATAGTACAAATATTACTAATAATACTACTATATTTGATAAT CATATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGA TTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAA GTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAG ATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAG ACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATG AAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCC ACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCA AGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAA GAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCA TTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTC AATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGATGGAGCGAAACA AACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTA TTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATC AGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATT CTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATA TATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACT TGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTAT GGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATG TCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGT TTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGAT GGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTC TTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACA CCAAAATTTCCTCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCT GTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCA ACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGAT TATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATG CCATAAATTTACTGGAATTAGGTTATCCACCCATAATTTACCATGCATCC ATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAA AAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTG TTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTA TGGAAGGAAATAAATAATGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAA ACAATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATAT ATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGA ATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCCTTCT
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Sequence Length

1833

Sequence Checksum

fd205f59de41350bea416d0ffe6f7eee

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS12
Identifier	TPS12
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:42
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:42