TPS6-like | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 732.394 bits (396), Expect = 0.000e+0
Identity = 408/414 (98.55%), Postives = 408/414 (98.55%), Query Frame = 1

Query:      456 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 869
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Sbjct:    27470 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATCATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTACTGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCAATTTCAACACAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 27883

HSP 2 Score: 529.262 bits (286), Expect = 7.430e-148
Identity = 288/289 (99.65%), Postives = 288/289 (99.65%), Query Frame = 1

Query:     1497 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
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Sbjct:    36725 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 37013

HSP 3 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.711e-137
Identity = 370/420 (88.10%), Postives = 370/420 (88.10%), Query Frame = 1

Query:      456 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 869
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Sbjct:    17986 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGATGATCTAAAACATATATTCAGGTG 18405

HSP 4 Score: 481.249 bits (260), Expect = 2.110e-133
Identity = 268/272 (98.53%), Postives = 268/272 (98.53%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1498
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Sbjct:    36053 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTTGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAACAACATCATCGG 36324

HSP 5 Score: 460.936 bits (249), Expect = 2.749e-127
Identity = 255/258 (98.84%), Postives = 255/258 (98.84%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
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Sbjct:    26374 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 26631

HSP 6 Score: 436.93 bits (236), Expect = 4.633e-120
Identity = 272/289 (94.12%), Postives = 272/289 (94.12%), Query Frame = 1

Query:     1497 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
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Sbjct:    20671 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAA-GTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAA--AAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACA 20956

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.010e-111
Identity = 224/225 (99.56%), Postives = 224/225 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      861 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
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Sbjct:    27968 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191

HSP 8 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.233e-93
Identity = 244/272 (89.71%), Postives = 244/272 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1498
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Sbjct:    19805 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 20076

HSP 9 Score: 340.904 bits (184), Expect = 3.737e-91
Identity = 215/230 (93.48%), Postives = 215/230 (93.48%), Query Frame = 1

Query:      857 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
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Sbjct:    18496 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 10 Score: 331.671 bits (179), Expect = 2.249e-88
Identity = 195/202 (96.53%), Postives = 195/202 (96.53%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 202
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Sbjct:    25762 GTATTTTTTAGACCAAAATTATATACTAATTATAATATTATTAATAAT--GGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTT-GTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 25960

HSP 11 Score: 303.971 bits (164), Expect = 4.903e-80
Identity = 190/202 (94.06%), Postives = 190/202 (94.06%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 202
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Sbjct:    13115 GTATTTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 13313

HSP 12 Score: 300.278 bits (162), Expect = 6.342e-79
Identity = 232/265 (87.55%), Postives = 232/265 (87.55%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATAT--T-AATAATCCT-A--ATT-ATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
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Sbjct:    15859 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTAAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTT-GAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATTAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 16122

HSP 13 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.392e-65
Identity = 142/144 (98.61%), Postives = 142/144 (98.61%), Query Frame = 1

Query:     1084 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1227
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Sbjct:    28326 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATATCTTAAGAAAACG 28469

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 3.057e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1084 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1227
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Sbjct:    19312 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 19455

[Close]

BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 732.394 bits (396), Expect = 0.000e+0
Identity = 408/414 (98.55%), Postives = 408/414 (98.55%), Query Frame = 1

Query:      456 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 869
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Sbjct:  2528610 AGAAATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2529023

HSP 2 Score: 523.722 bits (283), Expect = 3.457e-146
Identity = 287/289 (99.31%), Postives = 287/289 (99.31%), Query Frame = 1

Query:     1497 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
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Sbjct:  2530869 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 2531157

HSP 3 Score: 497.869 bits (269), Expect = 2.095e-138
Identity = 271/272 (99.63%), Postives = 271/272 (99.63%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1498
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Sbjct:  2530193 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACAATGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2530464

HSP 4 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.261e-135
Identity = 369/420 (87.86%), Postives = 369/420 (87.86%), Query Frame = 1

Query:      456 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 869
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Sbjct:  2519050 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2519469

HSP 5 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.655e-124
Identity = 274/289 (94.81%), Postives = 274/289 (94.81%), Query Frame = 1

Query:     1497 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
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Sbjct:  2521799 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACA 2522087

HSP 6 Score: 420.31 bits (227), Expect = 4.666e-115
Identity = 248/258 (96.12%), Postives = 248/258 (96.12%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2527515 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATC--AATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2527770

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.010e-111
Identity = 224/225 (99.56%), Postives = 224/225 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      861 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
                ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2529109 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

HSP 8 Score: 346.444 bits (187), Expect = 8.032e-93
Identity = 244/272 (89.71%), Postives = 244/272 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1498
                |||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2520934 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACC-GTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2521204

HSP 9 Score: 342.75 bits (185), Expect = 1.039e-91
Identity = 220/237 (92.83%), Postives = 220/237 (92.83%), Query Frame = 1

Query:      851 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
                |||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:  2519552 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 10 Score: 320.591 bits (173), Expect = 4.868e-85
Identity = 193/202 (95.54%), Postives = 193/202 (95.54%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 202
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2526903 GTATTTTTTAGACCAAAATTATATACTAATTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2527101

HSP 11 Score: 316.897 bits (171), Expect = 6.297e-84
Identity = 234/264 (88.64%), Postives = 234/264 (88.64%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
                ||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2516928 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2517191

HSP 12 Score: 296.584 bits (160), Expect = 8.204e-78
Identity = 189/202 (93.56%), Postives = 189/202 (93.56%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 202
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Sbjct:  2514191 GTATTTTATAGACCAAAAATATATACTA--TATAATATTA-T--TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2514387

HSP 13 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.478e-64
Identity = 141/144 (97.92%), Postives = 141/144 (97.92%), Query Frame = 1

Query:     1084 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1227
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2529471 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTCTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGGAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2529614

HSP 14 Score: 213.485 bits (115), Expect = 8.499e-53
Identity = 135/145 (93.10%), Postives = 135/145 (93.10%), Query Frame = 1

Query:     1084 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 1228
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Sbjct:  2520436 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 2520580

HSP 15 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.115e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      865 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
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Sbjct:  3143570 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: AGQN03000042.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.711e-39
Identity = 110/120 (91.67%), Postives = 110/120 (91.67%), Query Frame = 1

Query:       65 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTC 184
                ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||
Sbjct:   178236 GATAATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 178117


Match Name	Summary
AGQN03003403.1	E-Value: 7.430e-148, PID: 98.55 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 3.457e-146, PID: 98.55 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000042.1	E-Value: 6.711e-39, PID: 91.67 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-70835_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 628.981 bits (340), Expect = 9.392e-179
Identity = 350/355 (98.59%), Postives = 350/355 (98.59%), Query Frame = 1

Query:      472 TTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAG 826
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Sbjct:      628 TTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAG 982

HSP 2 Score: 401.843 bits (217), Expect = 2.229e-110
Identity = 226/230 (98.26%), Postives = 226/230 (98.26%), Query Frame = 1

Query:     1498 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGT-TCTCAAG 1726
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
Sbjct:      982 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGGCTCTCAAG 1211

HSP 3 Score: 285.504 bits (154), Expect = 2.342e-75
Identity = 221/253 (87.35%), Postives = 221/253 (87.35%), Query Frame = 1

Query:      515 ATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGC 761
                ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct:       11 ATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGC 263


Match Name	Summary
PKGMv1-70835_t	E-Value: 9.392e-179, PID: 98.59 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 765.633 bits (414), Expect = 0.000e+0
Identity = 414/414 (100.00%), Postives = 414/414 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      456 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 869
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Sbjct:  2034629 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2035042

HSP 2 Score: 534.802 bits (289), Expect = 1.569e-149
Identity = 289/289 (100.00%), Postives = 289/289 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1497 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2036943 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 2037231

HSP 3 Score: 503.409 bits (272), Expect = 4.425e-140
Identity = 272/272 (100.00%), Postives = 272/272 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1498
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2036267 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2036538

HSP 4 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.663e-137
Identity = 370/420 (88.10%), Postives = 370/420 (88.10%), Query Frame = 1

Query:      456 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 869
                ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||   |||| | | || ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2020238 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2020657

HSP 5 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.682e-132
Identity = 258/258 (100.00%), Postives = 258/258 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2029273 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2029530

HSP 6 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.626e-124
Identity = 274/289 (94.81%), Postives = 274/289 (94.81%), Query Frame = 1

Query:     1497 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
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Sbjct:  2022990 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACA 2023278

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 9.923e-112
Identity = 224/225 (99.56%), Postives = 224/225 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      861 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
                ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2035138 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 8 Score: 374.144 bits (202), Expect = 3.620e-101
Identity = 202/202 (100.00%), Postives = 202/202 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 202
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2028643 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2028844

HSP 9 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.194e-93
Identity = 244/272 (89.71%), Postives = 244/272 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1498
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Sbjct:  2022123 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2022394

HSP 10 Score: 342.75 bits (185), Expect = 1.021e-91
Identity = 220/237 (92.83%), Postives = 220/237 (92.83%), Query Frame = 1

Query:      851 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
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Sbjct:  2020740 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

HSP 11 Score: 316.897 bits (171), Expect = 6.187e-84
Identity = 234/264 (88.64%), Postives = 234/264 (88.64%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
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Sbjct:  2018107 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2018370

HSP 12 Score: 303.971 bits (164), Expect = 4.817e-80
Identity = 190/202 (94.06%), Postives = 190/202 (94.06%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 202
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Sbjct:  2015352 GTATTTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2015550

HSP 13 Score: 267.038 bits (144), Expect = 6.320e-69
Identity = 144/144 (100.00%), Postives = 144/144 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1084 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1227
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Sbjct:  2035501 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2035644

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 3.003e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1084 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1227
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Sbjct:  2021626 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2021769

HSP 15 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.096e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      865 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
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Sbjct:  2396996 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 333.517 bits (180), Expect = 6.143e-89
Identity = 217/235 (92.34%), Postives = 217/235 (92.34%), Query Frame = 1

Query:      852 AAAACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1085
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Sbjct:   196619 AAAATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385

HSP 2 Score: 316.897 bits (171), Expect = 6.187e-84
Identity = 239/270 (88.52%), Postives = 239/270 (88.52%), Query Frame = 1

Query:      200 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-AT--ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 457
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Sbjct:   197696 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 197427

HSP 3 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.940e-67
Identity = 230/270 (85.19%), Postives = 230/270 (85.19%), Query Frame = 1

Query:     1227 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1496
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Sbjct:   193681 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 193430

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: NC_044373.1
Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 172.859 bits (93), Expect = 1.417e-40
Identity = 111/120 (92.50%), Postives = 111/120 (92.50%), Query Frame = 1

Query:       65 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTC 184
                ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||
Sbjct: 70056723 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 70056604


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 1.569e-149, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]
NW_022060378.1	E-Value: 6.143e-89, PID: 92.34 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044373.1	E-Value: 1.417e-40, PID: 92.50 Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 3297.39 bits (1785), Expect = 0.000e+0
Identity = 1785/1785 (100.00%), Postives = 1785/1785 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1785
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Sbjct:      117 GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA 1901

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 2429.46 bits (1315), Expect = 0.000e+0
Identity = 1639/1797 (91.21%), Postives = 1639/1797 (91.21%), Query Frame = 1

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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 1943.8 bits (1052), Expect = 0.000e+0
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Query:      107 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-A-T-ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATA 1781
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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1930.87 bits (1045), Expect = 0.000e+0
Identity = 1501/1713 (87.62%), Postives = 1501/1713 (87.62%), Query Frame = 1

Query:      107 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-A-T-ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATA 1781
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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 1334.4 bits (722), Expect = 0.000e+0
Identity = 1010/1146 (88.13%), Postives = 1010/1146 (88.13%), Query Frame = 1

Query:      107 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-A-T-ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1227
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BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 843.193 bits (456), Expect = 0.000e+0
Identity = 1195/1547 (77.25%), Postives = 1195/1547 (77.25%), Query Frame = 1

Query:      123 TATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTT--A-CAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAA-A-AGA-TGTTAGTTGAGATGGAA---AACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATA-T--GTTAATATTA---ATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGAT-AGAA--AACATCAA-AAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTC-AAAA--AC-TA-C-ACTATAATGATATCAGAGC-AAA-AAA--A--GTTA--A-TGATTGATAATGATTATGATTATGATATCG-A--AGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTG-TTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCA--CAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATC-ATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGA 1628
                |||| || || |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| | | ||||||| || ||||  | || |||  | |||||||| | | | |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||  |||| || |  | ||||||||   |||| |||||||||||||| || ||||  |||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||| | ||  ||  ||||   || | |  | |||  | ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||| | |||||||||||  | ||||||||  ||| | |||   |||||||| ||||  || || | ||||| | |  ||  |||| ||| |||  |   |||  | | | |||| ||||| ||||| || ||||   |  | |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||| ||  |||||||| |||  |||||||| || |||||| | |||| |||||| |||||||| | | |||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||    |||||| |||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||  || |||| || ||   ||||||| ||||| ||   |||  | ||||| ||  ||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||  |   || ||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||  |||||||| |||  || |||  |||||||| || |||||||||| | ||   |||||  |  |  |||||  | | || | | | | ||||   |   || |||||  ||   ||||||  |||| |||   ||  || | |||| ||  ||||| ||||| |||| |||| |||||| |   || ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |  ||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||| |||||| ||||  ||||||||| || ||||||||
Sbjct:      194 TATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGA-ACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACG--AT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTT-TCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AA-TTTCC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTG-T--TACAA--A-AGATGCCATA-A-ATTT---A---CT-GGAATTAGG---TTATCCACCCATAATTTACCATGCA-T-CCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAAT-GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGA 1711

[Close]

BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030640479.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.367e-40
Identity = 107/115 (93.04%), Postives = 107/115 (93.04%), Query Frame = 1

Query:       65 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCA 179
                ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct:      116 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCA 2

[Close]

BLAST of TPS6-like vs. Genbank
Match Name: XM_030640478.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.367e-40
Identity = 107/115 (93.04%), Postives = 107/115 (93.04%), Query Frame = 1

Query:       65 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCA 179
                ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct:      116 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCA 2


Match Name	Summary
XM_030645439.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 100.00 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA [more]
XM_030645438.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 91.21 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA [more]
XM_030629489.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.78 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030629488.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.62 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030629490.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.13 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030644559.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 77.25 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030640479.1	E-Value: 1.367e-40, PID: 93.04 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030640478.1	E-Value: 1.367e-40, PID: 93.04 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_H_REGION	Signal peptide H-region	coord: 8..18
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None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION	Signal peptide C-region	coord: 19..27
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE	Signal Peptide	coord: 1..27
None	No IPR available	SIGNALP_EUK	SignalP-noTM	SignalP-noTM	coord: 1..27 score: 0.646
None	No IPR available	SIGNALP_EUK	SignalP-noTM	SignalP-noTM	coord: 1..23 score: 0.475
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..23
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 24..43
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 4..23
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None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 43..592
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 43..592
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 40..40
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None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..16
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 17..39
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 11..33
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 54..211 e-value: 8.3E-45 score: 152.8
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 266..539 e-value: 8.2E-96 score: 320.4
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 276..593 e-value: 1.0E-115 score: 388.0
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 261..591
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 54..275 e-value: 2.7E-66 score: 225.2
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 51..261

TPS6-like

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAA TGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTG TGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAG CCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAA GGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAA AGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGAT ACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTC TATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTAT ATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTA CCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAA ACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTT CTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTC ACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAA GTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATG CCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGG TTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGA GTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATC TAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTG AATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAAT AAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTAT TTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTG GATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAAT GATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACA ATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCC ATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTT CTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAG AATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTG CATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAA AGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTC ACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAG GAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGA AAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAA ATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCA TTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCA ACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTT CATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACA
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Sequence

GTATTTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAA
TGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTG
TGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAG
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GGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAA
AGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGAT
ACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTC
TATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTAT
ATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTA
CCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAA
ACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTT
CTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTC
ACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAA
GTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATG
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TTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGA
GTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATC
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AAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTAT
TTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTG
GATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAAT
GATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACA
ATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCC
ATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTT
CTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAG
AATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTG
CATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAA
AGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTC
ACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAG
GAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGA
AAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAA
ATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCA
TTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCA
ACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTT
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Sequence Length

1785

Sequence Checksum

11e4f6e2bc245ef83d4d14d210736336

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS6-like
Identifier	TPS6-like
Time Accessioned	Friday, April 26, 2024 - 14:03
Time Last Modified	Friday, April 26, 2024 - 14:03