TPS50 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: CM010792.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 678.841 bits (367), Expect = 0.000e+0
Identity = 380/386 (98.45%), Postives = 380/386 (98.45%), Query Frame = 1

Query:      286 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT-GGT 670
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:  8269935 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCTCAATTGAGCTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTTGGT 8270320

HSP 2 Score: 595.741 bits (322), Expect = 6.421e-168
Identity = 363/382 (95.03%), Postives = 363/382 (95.03%), Query Frame = 1

Query:      286 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 667
                |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8583774 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATTCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCA--AACTACCTTCTCACGA-G--CTT-TTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 8583399

HSP 3 Score: 531.109 bits (287), Expect = 1.837e-148
Identity = 289/290 (99.66%), Postives = 289/290 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1301 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8272318 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 8272607

HSP 4 Score: 531.109 bits (287), Expect = 1.837e-148
Identity = 289/290 (99.66%), Postives = 289/290 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1301 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8580335 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 8580046

HSP 5 Score: 496.022 bits (268), Expect = 6.699e-138
Identity = 280/286 (97.90%), Postives = 280/286 (97.90%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 286
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||
Sbjct:  8269325 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGCTATTTTATAGCATGTG 8269610

HSP 6 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.410e-137
Identity = 341/378 (90.21%), Postives = 341/378 (90.21%), Query Frame = 1

Query:      290 TATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 667
                |||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| || |||||||
Sbjct:   791680 TATTCGACAAGTACAAGAATGAAAAAGGAAAATTTAAAGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTGCACAAATGAGAGTTCATGGAGAGAAAATACTAGACGAAGCACTTATCTTTACAACTACTCATCTTGAATCCTCAGTTAAAACATGTCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTATCATCAACTACCTTCTCATGAGGAGATTCTTTTAACACTTGCTAAATTAGATTTCAACTTGCTTCAAAAACTACATCAAAAGGAACTAAGTTACATAACGAGGT 792057

HSP 7 Score: 468.323 bits (253), Expect = 1.460e-129
Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 255/256 (99.61%), Query Frame = 1

Query:     1047 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1302
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8271751 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 8272006

HSP 8 Score: 455.396 bits (246), Expect = 1.137e-125
Identity = 274/286 (95.80%), Postives = 274/286 (95.80%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 286
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct:  8584387 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGA-GAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAACAATAA---CAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAA---CCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 8584109

HSP 9 Score: 446.163 bits (241), Expect = 6.843e-123
Identity = 251/256 (98.05%), Postives = 251/256 (98.05%), Query Frame = 1

Query:     1047 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1302
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8581980 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAAATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 8581725

HSP 10 Score: 420.31 bits (227), Expect = 4.148e-115
Identity = 267/286 (93.36%), Postives = 267/286 (93.36%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 286
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   790490 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATC-TAAT--TGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 790772

HSP 11 Score: 396.303 bits (214), Expect = 6.990e-108
Identity = 214/214 (100.00%), Postives = 214/214 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8270937 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 8271150

HSP 12 Score: 396.303 bits (214), Expect = 6.990e-108
Identity = 214/214 (100.00%), Postives = 214/214 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8582769 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 8582556

HSP 13 Score: 309.511 bits (167), Expect = 9.368e-82
Identity = 169/170 (99.41%), Postives = 169/170 (99.41%), Query Frame = 1

Query:      878 ATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 1047
                ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8271469 ATATATATTTACTTAATTAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 8271638

HSP 14 Score: 233.798 bits (126), Expect = 5.800e-59
Identity = 157/172 (91.28%), Postives = 157/172 (91.28%), Query Frame = 1

Query:      876 ATATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 1047
                ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct:  8582264 ATATACATATTTACTTAATTAATATGAT--GATCATTAGGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 8582095

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: AGQN03009317.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 009322F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 536.649 bits (290), Expect = 3.947e-150
Identity = 290/290 (100.00%), Postives = 290/290 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1301 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5748 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 6037

HSP 2 Score: 473.863 bits (256), Expect = 3.139e-131
Identity = 256/256 (100.00%), Postives = 256/256 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1047 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1302
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5200 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 5455

HSP 3 Score: 388.917 bits (210), Expect = 1.170e-105
Identity = 213/214 (99.53%), Postives = 213/214 (99.53%), Query Frame = 1

Query:      664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4414 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATC-TTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 4626

HSP 4 Score: 287.351 bits (155), Expect = 4.389e-75
Identity = 165/170 (97.06%), Postives = 165/170 (97.06%), Query Frame = 1

Query:      878 ATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 1047
                ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4915 ATATATATTTACTTAATTAATATGATATGATCATCAGGTGGGATATTTTTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 5084

HSP 5 Score: 248.571 bits (134), Expect = 2.071e-63
Identity = 141/144 (97.92%), Postives = 141/144 (97.92%), Query Frame = 1

Query:      528 TCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT-GGT 670
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:     3654 TCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTTGGT 3797

HSP 6 Score: 65.753 bits (35), Expect = 2.239e-8
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1556 TCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 TCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 35


Match Name	Summary
CM010792.2	E-Value: 6.421e-168, PID: 98.45 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03009317.1	E-Value: 3.947e-150, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 009322F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-63016_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 974.305 bits (527), Expect = 0.000e+0
Identity = 707/782 (90.41%), Postives = 707/782 (90.41%), Query Frame = 1

Query:       96 GACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTGAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |     | ||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       72 GACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTC---ATAACAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAA------------------GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCA----------G-----T-CC--TT-A-CTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCA--AACTACCTTCTCACGA---GCTT-TTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACG----------AGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 793

HSP 2 Score: 512.642 bits (277), Expect = 8.774e-144
Identity = 279/280 (99.64%), Postives = 279/280 (99.64%), Query Frame = 1

Query:     1311 AAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      804 AAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1083

HSP 3 Score: 117.459 bits (63), Expect = 8.038e-25
Identity = 66/67 (98.51%), Postives = 66/67 (98.51%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATG 67
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct:        7 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAG-AGAAATTACTTCATG 72

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-22562_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 656.681 bits (355), Expect = 0.000e+0
Identity = 485/537 (90.32%), Postives = 485/537 (90.32%), Query Frame = 1

Query:      341 GTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |     | ||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      377 GTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCA----------G-----T-CC--TT-A-CTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACC---------------------AGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACG----------AGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 862

HSP 2 Score: 453.549 bits (245), Expect = 5.394e-126
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCG 251
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct:      127 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCG 377

HSP 3 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.509e-124
Identity = 242/242 (100.00%), Postives = 242/242 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1349 AGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1136 AGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1377

HSP 4 Score: 278.118 bits (150), Expect = 3.484e-73
Identity = 150/150 (100.00%), Postives = 150/150 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1048 TTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTT 1197
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      919 TTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTT 1068

HSP 5 Score: 130.386 bits (70), Expect = 1.032e-28
Identity = 70/70 (100.00%), Postives = 70/70 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1234 CCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGT 1303
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1069 CCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGT 1138

HSP 6 Score: 84.2195 bits (45), Expect = 8.152e-15
Identity = 45/45 (100.00%), Postives = 45/45 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      913 AGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAA 957
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      874 AGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAA 918

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-12839_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 388.917 bits (210), Expect = 1.543e-106
Identity = 250/269 (92.94%), Postives = 250/269 (92.94%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGG 269
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||
Sbjct:       10 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATC-TAAT--TGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGG 275


Match Name	Summary
PKGMv1-63016_t	E-Value: 8.774e-144, PID: 90.41 Description: No definition line [more]
PKGMv1-22562_t	E-Value: 5.394e-126, PID: 90.32 Description: No definition line [more]
PKGMv1-12839_t	E-Value: 1.543e-106, PID: 92.94 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: NC_044377.1
Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 673.301 bits (364), Expect = 0.000e+0
Identity = 379/386 (98.19%), Postives = 379/386 (98.19%), Query Frame = 1

Query:      286 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT-GGT 670
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 69295517 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCTCAATTGAGCTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATTACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTTGGT 69295132

HSP 2 Score: 612.361 bits (331), Expect = 6.264e-173
Identity = 365/382 (95.55%), Postives = 365/382 (95.55%), Query Frame = 1

Query:      286 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 667
                |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69217682 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATTCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 69217301

HSP 3 Score: 531.109 bits (287), Expect = 1.804e-148
Identity = 289/290 (99.66%), Postives = 289/290 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1301 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69214212 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 69213923

HSP 4 Score: 525.569 bits (284), Expect = 8.395e-147
Identity = 288/290 (99.31%), Postives = 288/290 (99.31%), Query Frame = 1

Query:     1301 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69293126 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 69292837

HSP 5 Score: 496.022 bits (268), Expect = 6.582e-138
Identity = 280/286 (97.90%), Postives = 280/286 (97.90%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 286
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||
Sbjct: 69296127 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGCTATTTTATAGCATGTG 69295842

HSP 6 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.384e-132
Identity = 338/378 (89.42%), Postives = 338/378 (89.42%), Query Frame = 1

Query:      290 TATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 667
                |||| | ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||| || |||||||
Sbjct: 77746775 TATTCGACAAGTACAAGAATGAAAATGAAAAATTTAAAGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTGCACAAATGAGAGTTCATGGAGAGAAAATACTAGACGAAGCACTTATCTTTACAACTACTCATCTTGAATCCTCAGTTAAAACATGTCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTATCATCAACTACCTTCTCATGAGGAGATTCTTTTAATACTTGCTAAACTAGATTTCAACCTGCTTCAAAAACTACATCAAAAGGAACTAAGTTACATAACGAGGT 77747152

HSP 7 Score: 468.323 bits (253), Expect = 1.435e-129
Identity = 255/256 (99.61%), Postives = 255/256 (99.61%), Query Frame = 1

Query:     1047 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1302
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69293693 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 69293438

HSP 8 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.445e-124
Identity = 273/286 (95.45%), Postives = 273/286 (95.45%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 286
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 69218311 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAACAATAA---CAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAA---CCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 69218032

HSP 9 Score: 446.163 bits (241), Expect = 6.723e-123
Identity = 251/256 (98.05%), Postives = 251/256 (98.05%), Query Frame = 1

Query:     1047 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1302
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69215873 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAAATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 69215618

HSP 10 Score: 420.31 bits (227), Expect = 4.075e-115
Identity = 267/286 (93.36%), Postives = 267/286 (93.36%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 286
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77745570 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATC-TAAT--TGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 77745852

HSP 11 Score: 396.303 bits (214), Expect = 6.867e-108
Identity = 214/214 (100.00%), Postives = 214/214 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69216664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 69216451

HSP 12 Score: 396.303 bits (214), Expect = 6.867e-108
Identity = 214/214 (100.00%), Postives = 214/214 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 877
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69294507 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAT 69294294

HSP 13 Score: 309.511 bits (167), Expect = 9.203e-82
Identity = 169/170 (99.41%), Postives = 169/170 (99.41%), Query Frame = 1

Query:      878 ATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 1047
                ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69293975 ATATATATTTACTTAATTAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 69293806

HSP 14 Score: 233.798 bits (126), Expect = 5.698e-59
Identity = 157/172 (91.28%), Postives = 157/172 (91.28%), Query Frame = 1

Query:      876 ATATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 1047
                ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 69216158 ATATACATATTTACTTAATTAATATGAT--GATCATTAGGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 69215989


Match Name	Summary
NC_044377.1	E-Value: 6.264e-173, PID: 98.19 Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: XM_030622484.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695419), mRNA

HSP 1 Score: 2676.92 bits (1449), Expect = 0.000e+0
Identity = 1547/1590 (97.30%), Postives = 1547/1590 (97.30%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTGAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |  |   ||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      127 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGCTATTTTATAGCATGTGAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCTCAATTGAGCTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATTACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGT-T--AG--AA-------------------AGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1692

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: XM_030621835.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase (LOC115694741), mRNA

HSP 1 Score: 2505.18 bits (1356), Expect = 0.000e+0
Identity = 1517/1590 (95.41%), Postives = 1517/1590 (95.41%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTGAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATATATATATTTACTTAATAAATATGATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1590
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |  |   ||                   ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      163 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTC---ATAACAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATTCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGT-T--AG--AA-------------------AGGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAAATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1722

[Close]

BLAST of TPS50 vs. Genbank
Match Name: XM_030622624.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695567), mRNA

HSP 1 Score: 1068.48 bits (578), Expect = 0.000e+0
Identity = 782/882 (88.66%), Postives = 782/882 (88.66%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTGAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTC--GCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATATA 880
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||| ||  | |||  ||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| ||  | || || ||||| || ||| || | || || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||
Sbjct:      133 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATC-TAAT--TGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGGTTATAATATTGCATGTGACATATTCGACAAGTACAAGAATGAAAATGAAAAATTTAAAGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTGCACAAATGAGAGTTCATGGAGAG-A-AAATACTAGACGAAGCACTTATCTTTACAACTACTCATCTTGAATCCTCAGTTAAAACATGTCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTATCATCAACTACCTTCTCATGAGGAGATTCTTTTAATACTTGCTAAACTAGATTTCAACCTGCTTCAAAAACTACATCAAAAGGAACTAAGTTACATAACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGATTACAAAAGTAAGCATTCATTTATAAAAGACAGAATAGTGGAGTGCTATTTCTGGGTTTATGGAGTGTTTTTTGAGGCAGAAACTTCCCAAATCAGACTAATAATCACCAAATTAATTGCTATTCTCACAATAATTGATGATGCTTATGATAGCTTTGGTACACTTGAAGAACTAGAGCCTTTTACTCAAGCA-ATA 1008


Match Name	Summary
XM_030622484.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.30 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695419), mRNA [more]
XM_030621835.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 95.41 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase (LOC115694741), mRNA [more]
XM_030622624.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.66 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695567), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 4..168 e-value: 2.7E-49 score: 167.5
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 209..530 e-value: 6.7E-107 score: 359.1
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 194..530
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 6..208 e-value: 6.6E-66 score: 223.5
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 199..477 e-value: 1.7E-93 score: 312.8
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 3..530
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF42		coord: 3..530
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 25..44
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..24
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 45..64
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 65..65
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 36..58
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 4..23
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 30..62
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..29
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 2..24
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 11..192

TPS50

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAA GAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACAC TTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAA AATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCT TCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTC GGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTGAGGTATTTGCCAAA TATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCG AGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAG AAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTA GTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGC CCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTT ACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACC CTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATT GAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAAT CTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTA TATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGAT TTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTG AAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATATATATATTTACTTAATAAATAT GATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTA CATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAG AATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGGTTG CAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAA ATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTG GATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTA ACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTAT ACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACA AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAG TGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACT TAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCT ATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTA CGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAAC ATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC
Sequence Length	1590
Sequence Checksum	ecb8fcc735caa3983ea736d9dbf9e7a4

Sequence

AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAA
GAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACAC
TTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAA
AATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCT
TCATCATGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGATTTC
GGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATATTGCATGTGAGGTATTTGCCAAA
TATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCG
AGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAG
AAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAATCCTTA
GTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGC
CCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTT
ACATATCACTTTACCATCAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACC
CTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATT
GAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAAT
CTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTA
TATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGAT
TTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTG
AAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATATATATATTTACTTAATAAATAT
GATATGATTATCAGGTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTA
CATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAG
AATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGGTTG
CAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAA
ATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTG
GATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTA
ACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTAT
ACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACA
AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAG
TGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACT
TAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCT
ATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTA
CGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAAC
ATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC

Sequence Length

1590

Sequence Checksum

ecb8fcc735caa3983ea736d9dbf9e7a4

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS50
Identifier	TPS50
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:52
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:52