TPS23 | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: CM010796.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 5, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 736.087 bits (398), Expect = 0.000e+0
Identity = 398/398 (100.00%), Postives = 398/398 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 52164437 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 52164834

HSP 2 Score: 682.534 bits (369), Expect = 0.000e+0
Identity = 389/398 (97.74%), Postives = 389/398 (97.74%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 52205747 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATAAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTT--TCTATTACAAT-CATGCACAAAAAGGA-CTTAGTGAAGTGAGCAGGT 52205354

HSP 3 Score: 625.288 bits (338), Expect = 8.677e-177
Identity = 378/398 (94.97%), Postives = 378/398 (94.97%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 52215618 TGCAGATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGAAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGGTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATACGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTACACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 52215221

HSP 4 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.272e-135
Identity = 279/287 (97.21%), Postives = 279/287 (97.21%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 52166556 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACAAACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 52166842

HSP 5 Score: 475.709 bits (257), Expect = 9.248e-132
Identity = 277/287 (96.52%), Postives = 277/287 (96.52%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 52203092 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 52202806

HSP 6 Score: 460.936 bits (249), Expect = 2.589e-127
Identity = 259/263 (98.48%), Postives = 259/263 (98.48%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
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Sbjct: 52162545 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACG--AA-ATGGATTTAGAATTTCTTCTG 52162804

HSP 7 Score: 429.543 bits (232), Expect = 7.302e-118
Identity = 246/253 (97.23%), Postives = 246/253 (97.23%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 52165707 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52165959

HSP 8 Score: 412.923 bits (223), Expect = 7.354e-113
Identity = 223/223 (100.00%), Postives = 223/223 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 52164919 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 52165141

HSP 9 Score: 392.61 bits (212), Expect = 9.581e-107
Identity = 241/255 (94.51%), Postives = 241/255 (94.51%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAG--TTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 52204545 GTTTAAGGAATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCATGTTTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52204291

HSP 10 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.446e-106
Identity = 219/223 (98.21%), Postives = 219/223 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 52205269 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTACTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 52205047

HSP 11 Score: 315.051 bits (170), Expect = 2.133e-83
Identity = 248/287 (86.41%), Postives = 248/287 (86.41%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 52211401 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 52211115

HSP 12 Score: 294.738 bits (159), Expect = 2.779e-77
Identity = 242/279 (86.74%), Postives = 242/279 (86.74%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTC 392
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Sbjct: 52206688 GTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGGGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACATCATGTTTCTGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 52206410

HSP 13 Score: 291.044 bits (157), Expect = 3.595e-76
Identity = 201/223 (90.13%), Postives = 201/223 (90.13%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 52214642 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 52214420

HSP 14 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.819e-67
Identity = 200/229 (87.34%), Postives = 200/229 (87.34%), Query Frame = 1

Query:     1170 TTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 52214032 TTTG-ATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 52213805

HSP 15 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.311e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 1146
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Sbjct: 52165470 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTACGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 52165610

HSP 16 Score: 228.258 bits (123), Expect = 2.859e-57
Identity = 129/132 (97.73%), Postives = 129/132 (97.73%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 132
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Sbjct: 52162308 ATGTTCACTCAAATCTTAGCATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 52162439

HSP 17 Score: 226.412 bits (122), Expect = 1.028e-56
Identity = 241/293 (82.25%), Postives = 241/293 (82.25%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-TT--GAT---------GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
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Sbjct: 52216411 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAATTTTGATCTTCTTAAGGATGAAGAGTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 52216119

HSP 18 Score: 206.098 bits (111), Expect = 1.340e-50
Identity = 129/138 (93.48%), Postives = 129/138 (93.48%), Query Frame = 1

Query:     1009 TGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 1146
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Sbjct: 52204784 TGGGATATAAACTGTGTGGATACACTCAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACCGAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 52204647

HSP 19 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.778e-41
Identity = 124/139 (89.21%), Postives = 124/139 (89.21%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 1144
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Sbjct: 52214323 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 52214185

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: CM010792.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 725.007 bits (392), Expect = 0.000e+0
Identity = 396/398 (99.50%), Postives = 396/398 (99.50%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 72025058 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGTGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGATGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 72025455

HSP 2 Score: 636.368 bits (344), Expect = 4.009e-180
Identity = 380/398 (95.48%), Postives = 380/398 (95.48%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 72051749 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCTACACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTAACCGAGTTTTTGGCAAGGAAAAAAGAATACCATGATGACGATGATCCATTATCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTTCATGCAAGGCATTTTATTTCGATATATGAAAAAGATGATTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 72052146

HSP 3 Score: 625.288 bits (338), Expect = 8.677e-177
Identity = 378/398 (94.97%), Postives = 378/398 (94.97%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 72111027 TGCAGATATATTTAAAAAATTCAAAGATGAGGATGGCAACTTTAAAAAATGTTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACAACTAAAAGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCACGATGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATATCGTGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATACTAAGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTTAATCTATTACAATCCCTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 72110630

HSP 4 Score: 531.109 bits (287), Expect = 1.946e-148
Identity = 287/287 (100.00%), Postives = 287/287 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72028033 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 72028319

HSP 5 Score: 503.409 bits (272), Expect = 4.242e-140
Identity = 282/287 (98.26%), Postives = 282/287 (98.26%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 72053905 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAACTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAATTTTTGAAGCCAACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 72054191

HSP 6 Score: 481.249 bits (260), Expect = 1.988e-133
Identity = 262/263 (99.62%), Postives = 262/263 (99.62%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72023112 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGAAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 72023374

HSP 7 Score: 468.323 bits (253), Expect = 1.547e-129
Identity = 253/253 (100.00%), Postives = 253/253 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72027212 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 72027464

HSP 8 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.422e-111
Identity = 242/253 (95.65%), Postives = 242/253 (95.65%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 72053047 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGCAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 72053299

HSP 9 Score: 401.843 bits (217), Expect = 1.592e-109
Identity = 221/223 (99.10%), Postives = 221/223 (99.10%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72025539 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTCTTGAAGAACTTGAGATCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 72025761

HSP 10 Score: 396.303 bits (214), Expect = 7.406e-108
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72052230 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCGATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 72052452

HSP 11 Score: 324.284 bits (175), Expect = 3.545e-86
Identity = 185/190 (97.37%), Postives = 185/190 (97.37%), Query Frame = 1

Query:      203 ATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTC 392
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72050757 ATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTTTACGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 72050946

HSP 12 Score: 291.044 bits (157), Expect = 3.595e-76
Identity = 201/223 (90.13%), Postives = 201/223 (90.13%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 72110059 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTGTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGTCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 72109837

HSP 13 Score: 278.118 bits (150), Expect = 2.799e-72
Identity = 230/270 (85.19%), Postives = 230/270 (85.19%), Query Frame = 1

Query:     1414 TATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
                ||||| |||||||| ||  | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||
Sbjct: 72108321 TATGATGAACATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAATTTAATAAGCTTATAAATAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCATCCATATTACTTAGGGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATACTGTTGCTGCTTTGTTAATTGATCCCATT 72108052

HSP 14 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.302e-70
Identity = 202/229 (88.21%), Postives = 202/229 (88.21%), Query Frame = 1

Query:     1170 TTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 72109442 TTTG-ATGAAGCTCGATGGTTGAATAGTGGACGTATCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTACTATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATAAAAACTAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 72109215

HSP 15 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.321e-60
Identity = 131/132 (99.24%), Postives = 131/132 (99.24%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 132
                ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72022868 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 72022999

HSP 16 Score: 228.258 bits (123), Expect = 2.859e-57
Identity = 137/143 (95.80%), Postives = 137/143 (95.80%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAA--GATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 1146
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 72026975 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAATGATTGTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAG-AACATACAGAGTTCATTATGCAAA-GAAGCG 72027115

HSP 17 Score: 217.178 bits (117), Expect = 6.189e-54
Identity = 133/141 (94.33%), Postives = 133/141 (94.33%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 1146
                |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72052817 AGGTGGGATATAAATTGTGTGGATACACTGAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAACAATACAAAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 72052957

HSP 18 Score: 200.558 bits (108), Expect = 6.233e-49
Identity = 175/206 (84.95%), Postives = 175/206 (84.95%), Query Frame = 1

Query:      198 TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGAT---------GAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || ||||||||||||||||||  ||||         |||||||| ||  |||||||  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||
Sbjct: 72111722 TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATATTTTTGATCTTCTTAAGGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGGTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 72111517

HSP 19 Score: 189.479 bits (102), Expect = 1.349e-45
Identity = 122/132 (92.42%), Postives = 122/132 (92.42%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 132
                |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72045420 ATGTCCACTCAAATCTTAGCATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAATCATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 72045551

HSP 20 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.778e-41
Identity = 124/139 (89.21%), Postives = 124/139 (89.21%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 1144
                |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72109737 AGGTGGGATATAAATTGTATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 72109599

HSP 21 Score: 111.919 bits (60), Expect = 3.004e-22
Identity = 62/63 (98.41%), Postives = 62/63 (98.41%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA 194
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 72045654 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGA 72045716

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004425.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004429F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 484.943 bits (262), Expect = 1.537e-134
Identity = 349/391 (89.26%), Postives = 349/391 (89.26%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 780
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Sbjct:    66430 TGCAGATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 66043

HSP 2 Score: 147.006 bits (79), Expect = 8.235e-33
Identity = 104/115 (90.43%), Postives = 104/115 (90.43%), Query Frame = 1

Query:      671 ATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAA-----GTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 780
                |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct:     9031 ATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAATTAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCTTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 8917

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: AGQN03002522.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 002526F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.526e-134
Identity = 349/391 (89.26%), Postives = 349/391 (89.26%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 780
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Sbjct:   105176 TGCAGATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC---CA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 105562

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: AGQN03007528.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 007533F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 189.479 bits (102), Expect = 1.349e-45
Identity = 200/249 (80.32%), Postives = 200/249 (80.32%), Query Frame = 1

Query:     1435 GAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct:    16848 GAATGTTACATGAAGCAATATGGCGTATCAGAAGAAGAAGCATGTGATGAAATGAATAGGCGAGTGGTTATTGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTCTGAAACCAACTGAAGCAGCTTCACCTATATTAGTTCGTGCTCTGAATCTTGCTAGGGTTATAGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATAACTATACACAAGTTGGAAAAGTCACTAAAGATAGTGTTGCTGTCTTGCTCATTGATCCAATT 16600

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: CM010799.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 7, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.778e-41
Identity = 181/224 (80.80%), Postives = 181/224 (80.80%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 22557733 AGGTGGTGGAAAGA-GCATGAGTTTGCAAAGAAATTTCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACAGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTAGCCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATGCAAAGGT 22557511

HSP 2 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.778e-41
Identity = 181/224 (80.80%), Postives = 181/224 (80.80%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 47133503 AGGTGGTGGAAAGA-GCATGAGTTTGCAAAGAAATTTCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACAGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTAGCCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACAAAAGCAATGCAAAGGT 47133725

HSP 3 Score: 161.779 bits (87), Expect = 2.941e-37
Identity = 165/203 (81.28%), Postives = 165/203 (81.28%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTC 987
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Sbjct: 22530333 AGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTC 22530132

HSP 4 Score: 159.932 bits (86), Expect = 1.058e-36
Identity = 166/204 (81.37%), Postives = 166/204 (81.37%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGT-TTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTC 987
                ||||||||| ||| | || || |||| | | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||  |  ||||||||  |||||  |||| |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || |||
Sbjct: 47154083 AGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATT-GG-GTGTTATTATGAACCCAAATACT-CTGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTC 47154282

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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: CM010793.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 3, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.778e-41
Identity = 182/225 (80.89%), Postives = 182/225 (80.89%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
                ||||||||||||||| || || |||| | ||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || |||| ||| ||  |||||| |   ||||||||  || ||| |||| |||| || || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| || |  | |||||||||||||
Sbjct: 42308296 AGGTGGTGGAAAGAA-CATGACTTTGCAAACAAATTCCCTTTTGCAAGGGATAGAATGGTGGAATTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTTTGAGCCGAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTTTAGCCAAAGTCATTGCCTTCGCCTCAATCATTGATGATATTTATGATGCATATGGTACAATTGATGAGCTTGAGCTTCTTACCAAA-GCAATTGAAAGGT 42308074


Match Name	Summary
CM010796.2	E-Value: 8.677e-177, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 5, whole genome shotgun sequence [more]
CM010792.2	E-Value: 4.009e-180, PID: 99.50 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004425.1	E-Value: 1.537e-134, PID: 89.26 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004429F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03002522.1	E-Value: 5.526e-134, PID: 89.26 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 002526F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03007528.1	E-Value: 1.349e-45, PID: 80.32 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 007533F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010799.2	E-Value: 3.778e-41, PID: 80.80 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 7, whole genome shotgun sequence [more]
CM010793.2	E-Value: 3.778e-41, PID: 80.89 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 3, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-774_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 854.272 bits (462), Expect = 0.000e+0
Identity = 462/462 (100.00%), Postives = 462/462 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1195 AGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATT 1656
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Sbjct:       22 AGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATT 483

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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-66359_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 754.553 bits (408), Expect = 0.000e+0
Identity = 430/441 (97.51%), Postives = 430/441 (97.51%), Query Frame = 1

Query:     1181 CTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATG 1621
                ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      374 CTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATG 814

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-776_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 503.409 bits (272), Expect = 5.595e-141
Identity = 282/287 (98.26%), Postives = 282/287 (98.26%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1280 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAACTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAATTTTTGAAGCCAACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1566

HSP 2 Score: 361.217 bits (195), Expect = 3.563e-98
Identity = 211/219 (96.35%), Postives = 211/219 (96.35%), Query Frame = 1

Query:     1180 GCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct:     1006 GCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGCAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 1224

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-66366_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 481.249 bits (260), Expect = 2.621e-134
Identity = 280/290 (96.55%), Postives = 280/290 (96.55%), Query Frame = 1

Query:     1394 ACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      578 ACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 867

HSP 2 Score: 363.064 bits (196), Expect = 9.907e-99
Identity = 339/406 (83.50%), Postives = 339/406 (83.50%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAG--T-ATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTG-TCAACAACAA-AA--GGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAA-GAGAAATATTTGGAGATTA--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCA 396
                |||| ||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||   ||  | || ||  |||| | |||   ||| |  |||  ||||  |  ||||  |    || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||   || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:        1 ATGTCCACTCAAATCTTAGCATCATCATCATCTTCAAATGAAAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACAATTCTTACATTACAATATTTCAGAACAAGATTTG-GTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTT-A-GAAGGGAAATATTTGG--AGAATCATCAATA--TCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACATCATGTTTCTGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTCGGCA 399

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-66368_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 267.038 bits (144), Expect = 7.991e-70
Identity = 188/210 (89.52%), Postives = 188/210 (89.52%), Query Frame = 1

Query:     1444 ATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGAT 1653
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Sbjct:        1 ATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGAT 210

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-80524_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 243.031 bits (131), Expect = 1.347e-62
Identity = 389/509 (76.42%), Postives = 389/509 (76.42%), Query Frame = 1

Query:      482 AAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCAT-T-TCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTC 987
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Sbjct:       20 AAGCTTCACACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAA-G-GCTATT-GTG--GCAAATAG-------T-AA-A-GATCATCCATTATCACATCAAATATCCAAAGCCTTGGAAAGGCCACTAAGAATGACCTTAGAGAGGCTTCATGCTAGG--TTTTATATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAAGTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA------A--T--T-G--AGCAT--GAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGAAAACTTCTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTC 496


Match Name	Summary
PKGMv1-774_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 100.00 Description: No definition line [more]
PKGMv1-66359_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.51 Description: No definition line [more]
PKGMv1-776_t	E-Value: 5.595e-141, PID: 98.26 Description: No definition line [more]
PKGMv1-66366_t	E-Value: 2.621e-134, PID: 96.55 Description: No definition line [more]
PKGMv1-66368_t	E-Value: 7.991e-70, PID: 89.52 Description: No definition line [more]
PKGMv1-80524_t	E-Value: 1.347e-62, PID: 76.42 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: NC_044377.1
Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 713.927 bits (386), Expect = 0.000e+0
Identity = 394/398 (98.99%), Postives = 394/398 (98.99%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 77957142 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGT 77957539

HSP 2 Score: 691.767 bits (374), Expect = 0.000e+0
Identity = 390/398 (97.99%), Postives = 390/398 (97.99%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 77998471 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATAAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTACGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATGTATGCACAAAAAGGAACTTAGTGAAGTGAGCAGGT 77998074

HSP 3 Score: 542.189 bits (293), Expect = 8.832e-152
Identity = 362/396 (91.41%), Postives = 362/396 (91.41%), Query Frame = 1

Query:      396 AGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAA-GAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 78008320 AGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGACCGAGTTTTTGGCAAAGAAAAAAAGAACACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATGTTCATGCTAAGCATTTCATTTCGATATGTGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCCAGATTTTAATCTACTACAATCCCAGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 78007925

HSP 4 Score: 525.569 bits (284), Expect = 8.895e-147
Identity = 358/395 (90.63%), Postives = 358/395 (90.63%), Query Frame = 1

Query:      396 AGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGT 790
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Sbjct: 78019509 AGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCTTCACATTTGAGTTGTGTTGTAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGATTGAGTTTTTGGCAAAGACAAAAGATCACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCAAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCTAAGCATTTTATTTCGACGTATGAAAAAGATGCCTCACATAATAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAGAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGT 78019115

HSP 5 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.197e-135
Identity = 279/287 (97.21%), Postives = 279/287 (97.21%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 77959274 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACAAACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 77959560

HSP 6 Score: 479.403 bits (259), Expect = 7.024e-133
Identity = 348/391 (89.00%), Postives = 348/391 (89.00%), Query Frame = 1

Query:      393 TGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 780
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Sbjct: 78969939 TGCAGATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 78969552

HSP 7 Score: 475.709 bits (257), Expect = 9.086e-132
Identity = 277/287 (96.52%), Postives = 277/287 (96.52%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 77995812 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTTGAATGCTATATGATTGAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGAAGCCAACTCAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACTAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 77995526

HSP 8 Score: 448.01 bits (242), Expect = 1.981e-123
Identity = 256/263 (97.34%), Postives = 256/263 (97.34%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
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Sbjct: 77955179 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAATTAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCAATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTACAATTTCTTCTG 77955441

HSP 9 Score: 429.543 bits (232), Expect = 7.174e-118
Identity = 246/253 (97.23%), Postives = 246/253 (97.23%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
                ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 77958419 GTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAG 77958671

HSP 10 Score: 392.61 bits (212), Expect = 9.413e-107
Identity = 241/255 (94.51%), Postives = 241/255 (94.51%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAG--TTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 77997265 GTTTAAGGAATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCATGTTTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 77997011

HSP 11 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.385e-106
Identity = 219/223 (98.21%), Postives = 219/223 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 77957624 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTAGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAATCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 77957846

HSP 12 Score: 385.223 bits (208), Expect = 1.575e-104
Identity = 218/223 (97.76%), Postives = 218/223 (97.76%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 77997989 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTATACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATATTGTTTGGCAAGAAATATTTTACTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 77997767

HSP 13 Score: 315.051 bits (170), Expect = 2.096e-83
Identity = 248/287 (86.41%), Postives = 248/287 (86.41%), Query Frame = 1

Query:     1397 AGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct: 78004115 AGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 78003829

HSP 14 Score: 294.738 bits (159), Expect = 2.731e-77
Identity = 242/279 (86.74%), Postives = 242/279 (86.74%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTC 392
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Sbjct: 77999412 GTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGGGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGGCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTGCAACCAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACATCATGTTTCTGATCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGAATTTCTTC 77999134

HSP 15 Score: 285.504 bits (154), Expect = 1.643e-74
Identity = 200/223 (89.69%), Postives = 200/223 (89.69%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 78007359 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAACATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGT 78007137

HSP 16 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.289e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 1146
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Sbjct: 77958182 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTACGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 77958322

HSP 17 Score: 252.265 bits (136), Expect = 1.667e-64
Identity = 176/196 (89.80%), Postives = 176/196 (89.80%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTG 982
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Sbjct: 78018536 AGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAATATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTTTTGAAGAAGTTG 78018341

HSP 18 Score: 248.571 bits (134), Expect = 2.156e-63
Identity = 198/229 (86.46%), Postives = 198/229 (86.46%), Query Frame = 1

Query:     1170 TTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAG 1398
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Sbjct: 78006739 TTTG-ATGAAGCTGGATGGTTGAATAGTGGACATGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTTA--ATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAG 78006514

HSP 19 Score: 231.952 bits (125), Expect = 2.171e-58
Identity = 242/293 (82.59%), Postives = 242/293 (82.59%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-T--TGAT---------GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
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Sbjct: 78008755 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 78008463

HSP 20 Score: 231.952 bits (125), Expect = 2.171e-58
Identity = 242/293 (82.59%), Postives = 242/293 (82.59%), Query Frame = 1

Query:      132 GTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-T--TGAT---------GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTG 394
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Sbjct: 78019944 GTATTGTCAACAAGAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCATCATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCTG 78019652

HSP 21 Score: 224.565 bits (121), Expect = 3.634e-56
Identity = 125/127 (98.43%), Postives = 125/127 (98.43%), Query Frame = 1

Query:        6 CACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 132
                ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77933209 CACTCAAATCTTAGTATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 77933335

HSP 22 Score: 213.485 bits (115), Expect = 7.865e-53
Identity = 205/248 (82.66%), Postives = 205/248 (82.66%), Query Frame = 1

Query:      151 GTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-TTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAA-AACCA-A-TA-TTG-ATG-ATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTT 391
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Sbjct: 78976625 GTTGAAGAATTGAAAGAAGTGGTAAGAAAGGAGATATTTGGAGAATTATTA-TGTGATGATTGGAATAATCGATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCCTATCATTTTGAGAGTGAAATACAAAATGAGCTTCAACACATTTACAACATTAATGATAATAATTTCAAACATGAAACTTTGCATGATGCTTCTATTCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATATAGGGTTTCTT 78976379

HSP 23 Score: 211.638 bits (114), Expect = 2.829e-52
Identity = 132/141 (93.62%), Postives = 132/141 (93.62%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCG 1146
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Sbjct: 77997507 AGGTGGGATATAAACTGTGTGGATACACTCAATCAAGAATATATGCAAACATTTTATAAGGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACCGAGTTCATTATGCAAAAGCAGCG 77997367

HSP 24 Score: 195.019 bits (105), Expect = 2.849e-47
Identity = 123/132 (93.18%), Postives = 123/132 (93.18%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 132
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Sbjct: 78008984 ATGTCCACTCAAATCTTAGCATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 78008853

HSP 25 Score: 183.939 bits (99), Expect = 6.167e-44
Identity = 121/132 (91.67%), Postives = 121/132 (91.67%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 132
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Sbjct: 78020182 ATGTCCACTCAAATCTTAGCATCATCATCTTCAAATGAAAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACAATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTG 78020051

HSP 26 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.727e-39
Identity = 123/139 (88.49%), Postives = 123/139 (88.49%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 1144
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Sbjct: 78007030 AGGTGGGATATAAATTGCATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAG 78006892

HSP 27 Score: 165.472 bits (89), Expect = 2.234e-38
Identity = 174/216 (80.56%), Postives = 174/216 (80.56%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAAT 1001
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Sbjct: 76640276 AGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCAAGCAAGAAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCCAAGCAAT 76640062

HSP 28 Score: 158.086 bits (85), Expect = 3.738e-36
Identity = 179/225 (79.56%), Postives = 179/225 (79.56%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGT 1009
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Sbjct: 76709312 AGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGGAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAA-GCAATTCAAAGGT 76709090

HSP 29 Score: 147.006 bits (79), Expect = 8.091e-33
Identity = 104/115 (90.43%), Postives = 104/115 (90.43%), Query Frame = 1

Query:      671 ATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAA-----GTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 780
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Sbjct: 78946167 ATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAATTAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCTTGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 78946053


Match Name	Summary
NC_044377.1	E-Value: 8.832e-152, PID: 98.99 Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030622631.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase-like (LOC115695574), mRNA

HSP 1 Score: 2896.67 bits (1568), Expect = 0.000e+0
Identity = 1642/1678 (97.85%), Postives = 1642/1678 (97.85%), Query Frame = 1

Query:        6 CACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct:        6 CACTCAAATCTTAGTATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGATTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGGTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAATTAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCAATTCGATTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTACAATTTCTTCT---GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAACTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTAGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTTTAATCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGCTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTACGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTAAGGGATTAGTCCGATCTCATTTGGATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGACTCATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGATAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTAGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTGTGATGCCAACTGAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTGTAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACAAACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1680

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030654009.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115724669), mRNA

HSP 1 Score: 1929.02 bits (1044), Expect = 0.000e+0
Identity = 1496/1714 (87.28%), Postives = 1496/1714 (87.28%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-T--TGA-----T----GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAG-AAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTAAGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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Sbjct:        1 ATGTCCACTCAAATCTTAGCATCATCATCTTCAAATGACAACCCAAATAAAATTGTTCGTCCTACAAAAACATTTCATCCACATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAGGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGAATCATCAATATCATCATCAGCTTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAATCTGAAATAGAAAATATGATAGAACAAATCTACAACAAAACCAATAGTGATGATTTTCTCAAAGATGAAGATTTGCATGATGTTTCCTTGTGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATTTAGGGTTTCTTCT---GATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAAGATGGCAACTTTAAAAAATATTTGGTAAGTGATACTCTTGGTTTGCTTAGCCTATATGAAGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACTTGACCGAGTTTTTGGC-AAGAAAAAAAGAACACTATGATGACGATGATTTCTTGTCAAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGACCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATGTTCATGCTAAGCATTTCATTTCGATATGTGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGCCAGATTTTAATCTACTACAATCCCAGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAATCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAAACTTTGTACAAAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGCTCTATCTTTGGATGTTAGGAGTCTATTATGAACCCCAATACTCTTTGGCAAGAAACATTTTAGCCAAAATCATAGCTTTTTCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGAACATTTGAAGAACTTGAACTCCTAACTCAAGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGCATTGATACACTCAATCAAGAATATTTGAAAACATTTTATAAGGATCTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAAGTGCTTACAAAAGAAGAAACTTATAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGTGTTTAAAGAGTTAATCCGATCATATTTTGATGAAGCTGGATGGTTGAATAGTGGACATGTCCCAAATTTTGAAGAGTACATGGAATTTGCAACCATTAATTGTGGTNNTAATATGTTGATAGTGAGTTCTTTGGTTGGAATGAAAACAAGTATTGTAACCAAAGATGTTTTTGAGTGGCTCTCCAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTATTATTTGTAGGCTCATGGATGACATAGCTGAACACAAGTTTGAGAAAGACAAATATGATGAAGATTCTGCCATTGAATCGTATATGATGCAACATGGTGTTTGTGAAGAAGAAGCCTATGATGAACTCAATAAGCTTATAATTAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCAACTAAATTAGCTTCACCCATATTACTTCGTGTTCTTAATTTTTCTAGGGTTATGGATCTTCTCTACAAAAATGGTGATGGTTTTACACATGTTGGAAAAGTCACCAAAGATTCTGTTGCTGCTTTGCTAATTGATCCCATT 1710

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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030653866.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1297.47 bits (702), Expect = 0.000e+0
Identity = 1371/1696 (80.84%), Postives = 1371/1696 (80.84%), Query Frame = 1

Query:       10 CAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAA-CAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-TTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACA--AA-ACCAAT-A-TT-GATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAGATG-TTTTG-AATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTAAGGGATTAGTTCA-ATCTCATTT-GAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGGTTACTACATGTTGATA-CTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACT---AATATTGTAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGAGCATCTGTTACTATTTGTAGGCTA-ATGGATGACATAGCCGAACACAAGTTTGAGGAAGATGATTA-TGAGGAAC-ATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTGAACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATAATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGTAGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATCTTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAAGATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT 1683
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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030622635.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115695577), mRNA

HSP 1 Score: 1162.66 bits (629), Expect = 0.000e+0
Identity = 890/1012 (87.94%), Postives = 890/1012 (87.94%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-------------T--T-A--TTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAATA-T--TGA-----T----GATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTG 982
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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030653867.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 717.62 bits (388), Expect = 0.000e+0
Identity = 654/782 (83.63%), Postives = 654/782 (83.63%), Query Frame = 1

Query:       10 CAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAA-CAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGA-TTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGCATTTACAACA--AA-ACCAAT-A-TT-GATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGG---CGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 780
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Sbjct:       60 CAAATCTTAGCAACCTCATCCAAAAATGACAATATACATAAAATTGTTCGGCCAACAACAAATTATCATCCTTCTATTTGGGGAGACCGATTTTTGCATTACGATATTCCAAAAGAAGAATTGAATTATAAACAAGGCCAA-GTTGAAGAATTGAAAGAAGTGGTAAGAAAGGAGATATTTGGAGAATTATTA-TGTGATGATTGGAATAATCGATTGAAGTTAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCCTATCATTTTGAGAGTGAAATACAAAATGAGCTTCAACACATTTACAACATTAATGATAATAATTTCAAACATGAAACTTTGCATGATGCTTCTATTCGGTTTAGACTTCTACGACAACATGGATATAGGGTTTCTT-T--AGATATATTTGACAAGTTCAAAGATGAGAATGGCAACTTTAAAGAATGTTTGGCGAGTGACACCGTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAGGCCTCACATTTGAGTTGTGTTGGAGAAAATTTACTAGATGAAGCCCTTTCTTTCACTACCAAACACCTAACTGAATTTTTGGAAAATAATAAAAAAGAACACC--CCA-ATGATGATCCATTATCAAAGGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTGAATCTCCATGCAAGGTATTTCATTTCAATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGCTACAACTTGCAAAGTTAGATTTCAATCTATTACAATCCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAA 833

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BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030622957.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 479.403 bits (259), Expect = 5.239e-134
Identity = 892/1195 (74.64%), Postives = 892/1195 (74.64%), Query Frame = 1

Query:       44 CAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGA-AAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAAT-AT--TGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAG-A-TGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTAAGGGA-TTAGTTCAATCTCATTT-GAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGATACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGA 1228
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Sbjct:      117 CAAA-ATTATTGCTCGTCCAACAACAAAATTTCACCCTTCTATTTGGGGTGATCGATTCCTCCATTACAATATTTCAGAACAAGACTTGGTTTGCAAACAAGAAAAAGTTGAAGAATTAATACAAGTTGT---AA-AGAAAGA----GATATTATCTTCA-AAT-CAT-G----ATCAATTGAAGTTGATTGACAATCTCCAACGTTTGGGATTATCATATCATTTTGAGAGTGAAATTGAGAAAT-TGTTGGAA--CAATTA-AGTATCACTCATCATCAAAATCATCATGATCTACATGATGCTTCTCTTTGGTTTAGATTATTAAGACAACATGGATTTA--ATGT-TTCATCAAGTATATTTGAAAAATTCAAAGACGAGGAAGGTAACTTTAAAGAAAGCCTAATAACCGATGTTCCAGGTTTGCTTAGCTTGTATGAGGCTTCGCACTTGAGTTATGTTGGAGAAAGCATACTAGATGAAGCACTTGCTTTCACAACCACTCACCTTAA-G-GCTATT-GTG--GCAAATAG-------T-AA-A-GATCATCCATTATCACATCAAATATCCATAGTCCTGCATAGGCCTCTAAGAAAGACCATAGAGAGGCTTCATGCTAGGTTTTACATCTCAATCTATGAAAAGGATGCCTCTCATAACAAACTATTGCTAGAGCTTGCAAAGTTAGACTTCAATCTACTTCAATGTTTCCACAAAAAGGAACTTAGTGAAATTACGAGGTGGTGG-AAGGAGCATGAGTTTGCAAAGAAATTCCCTTTTGCAAGAGATAGGATGGTGGAACTGTATTTTTGGATATTGGGTGTATATTATGAACCCAAATACTCTCGAGCAAGGAAGCTTTTAACCAAAGTCATTGCATTGACCTCAATCACTGATGATATTTATGATGCATATGGTACTATTGATGAGCTTCAGCTTCTTACCAAA-GCAATTCAAAGGTGGGACATAAATTGTATGGATAAACTTAAGCAAGAATATTTAAAGACATATTATAAGGTAATGTTG-G-ATTCTTATGAAGAATTTGAAAAGGAGCTTAAAAAGGAAGAATTATACAAACTTGAGTATGCAAAAGAAGAGATGAAAAGAATTA-TTGGAGGTTATTTTGAA-GAAGCTCGATGGTTGAATGAAGGATATTTCCCAAGCTTCGATGAGCATTTGA 1267

[Close]

BLAST of TPS23 vs. Genbank
Match Name: XM_030622958.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X2, mRNA

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Identity = 835/1114 (74.96%), Postives = 835/1114 (74.96%), Query Frame = 1

Query:       44 CAAATATAATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGATTCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAGGTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTATTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTTTGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGA-AAATAAGCTTCAATGCATTTACAACAAAACCAAT-AT--TGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTATTCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATATATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTAAGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTGTGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACCTAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCATTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCTAGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCTCACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTACAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGAATCA-GATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAATTGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCAAGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATATTTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAG-TTCCTAACTCATGCAATTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATGCAAACATTTTATAAAG-A-TGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACTGCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTT 1149
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XM_030622635.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.94 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase-like (LOC115695577), mRNA [more]
XM_030653867.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 83.63 Description: PREDICTED: Cannabis sativa alpha-humulene synthase (LOC115724563), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030622957.1	E-Value: 5.239e-134, PID: 74.64 Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030622958.1	E-Value: 4.079e-130, PID: 74.96 Description: PREDICTED: Cannabis sativa germacrene-A synthase (LOC115695866), transcript variant X2, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
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IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 68..234 e-value: 9.8E-183 score: 610.1
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None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF42		coord: 10..561
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IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 26..235

TPS23

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGTTCACACAAATCTTAGTATCATTATCTTCAAATGACAACCCAAATAT AATTGTTCGTCCTACAAAAAAATTCCACCCAAATATTTGGGGAGAACGAT TCTTACATTACAACATTTCACAACAAGATTTGTATTGTCAACAACAAAAG GTTGAGGAATTAAAAGAAGTGGTTAGAAGAGAAATATTTGGAGATTATTA TTATGATGCTTGGAAAAATCAATTGAAGATAATTGATGTGGTAGAACGTT TGGGATTGTCTTATCATTTTGAAACTGAAATAGAAAATAAGCTTCAATGC ATTTACAACAAAACCAATATTGATGATGAAGATTTACACCATGTTTCTAT TCGATTTAGACTTCTACGGCAACATGGATTTAGAATTTCTTCTGCAGATA TATTTGAAAAATTCAAAGATGAGGATGGGAACTTTAAAAAATGCTTGGTA AGTGATACCCTTGGTTTGCTTAGCTTATATGAAGCCTCACATTTGAGCTG TGTTGGAGAAAATATACTTGATGAAGCACTTGCTTTCACAACAACACACC TAAATGAGTTTTTGGCGAAGAAAAAAGAACACCATGAAGACGATGATCCA TTATCGAAAGAAATATCTCGAGCCCTAGAGAGGCCCTTAAGAAAGACCCT AGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCT CACATAACAAAGTATTGTTACAACTTGCAAAATTAGATTTTAATCTATTA CAATGCATGCACAAAAAGGAGCTTAGTGAAGTCAGCAGGTGGTGGAAAGA ATCAGATTTTGTACACAAATTTCCATTTGCAAGAGATAGGATTGTGGAAT TGTACCTTTGGATATTAGGAGTTTATTATGAACCCCAATACTGTTTGGCA AGAAATATTCTAGTCAAAATCATAGCTTTGGCCTCAATTGCTGATGATAT TTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAA TTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATG CAAACATTTTATAAAGATGTTTTGAATTGTTATGAAGAGTTTGAGCAACT GCTAGAAAAAGAAGAAACATACAGAGTTCATTATGCAAAAGAAGCGTTTA AGGGATTAGTTCAATCTCATTTGAATGAAGCTCGATGTTTGCATAGAGGA TACATCCCAAGTTTTGAAGAGTACTTGAAATTTGCTTTGGGTAATTGTGG TTACTACATGTTGATACTAAGCTCTTTGGTTGGAATGAAAACTAATATTG TAACAAAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTCGAAAGATCGAAAGATTATTAGA GCATCTGTTACTATTTGTAGGCTAATGGATGACATAGCCGAACACAAGTT TGAGGAAGATGATTATGAGGAACATTCAGCAGTGGAATGCTATATGATTG AACATGGCGTTTGTGAAGAGGAAGCCTATGATGAACTGAATAAGCTAATA ATGAATGCATGGAAAGAAATAAATGAAGAGTTTTTGAAGCCTACTAAAGT AGCTTCACCTATATTACTTCGTGCTCTTAACTTTTCAAGGGTTATGGATC TTATTTTCAAATTTGGAGATGGTTATACACACGTTGGAAAAATCACCAAA GATATTGTTGCTGCTTTGCTTATTCATCCAATT
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Sequence

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AGTAAATCTTCATGCAAGGCATTTCATTTCGATATATGAAAAAGATGCCT
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TTATGATGCATATGGTACACTTGAAGAACTTGAGTTCCTAACTCATGCAA
TTGAAAGGTGGGATATAAATTGTGTAGATAAACTGAATCAGGAATATATG
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Sequence Length

1683

Sequence Checksum

2cd67d7f69e86cfda8e189daf411dd26

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS23
Identifier	TPS23
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:39
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:39