TPS38 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000461.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 771.173 bits (417), Expect = 0.000e+0
Identity = 424/427 (99.30%), Postives = 424/427 (99.30%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5016 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 4590

HSP 2 Score: 538.495 bits (291), Expect = 1.171e-150
Identity = 293/294 (99.66%), Postives = 293/294 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     3600 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 3307

HSP 3 Score: 499.716 bits (270), Expect = 5.527e-139
Identity = 275/277 (99.28%), Postives = 275/277 (99.28%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5370 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 5095

HSP 4 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.016e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     3938 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 3688

HSP 5 Score: 405.537 bits (219), Expect = 1.240e-110
Identity = 222/223 (99.55%), Postives = 222/223 (99.55%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4475 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATT-AAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 4254

HSP 6 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.146e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4168 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 4028

HSP 7 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.752e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5551 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 5440

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: CM010795.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 749.013 bits (405), Expect = 0.000e+0
Identity = 420/427 (98.36%), Postives = 420/427 (98.36%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920019 TATTTTACAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17919593

HSP 2 Score: 632.674 bits (342), Expect = 5.223e-179
Identity = 400/427 (93.68%), Postives = 400/427 (93.68%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |   |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17858534 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--C---ATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17858114

HSP 3 Score: 632.674 bits (342), Expect = 5.223e-179
Identity = 400/427 (93.68%), Postives = 400/427 (93.68%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879385 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17878965

HSP 4 Score: 532.955 bits (288), Expect = 5.450e-149
Identity = 292/294 (99.32%), Postives = 292/294 (99.32%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17913510 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17913217

HSP 5 Score: 527.415 bits (285), Expect = 2.535e-147
Identity = 291/294 (98.98%), Postives = 291/294 (98.98%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857131 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17856838

HSP 6 Score: 516.336 bits (279), Expect = 5.488e-144
Identity = 289/294 (98.30%), Postives = 289/294 (98.30%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17877917 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17877624

HSP 7 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.590e-132
Identity = 271/277 (97.83%), Postives = 271/277 (97.83%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879736 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 17879461

HSP 8 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.205e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858882 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 17858607

HSP 9 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.606e-129
Identity = 269/277 (97.11%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 17920369 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 17920094

HSP 10 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.365e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857461 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17857211

HSP 11 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.365e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 17878261 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 17878011

HSP 12 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.365e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17913845 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17913595

HSP 13 Score: 396.303 bits (214), Expect = 7.460e-108
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878861 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17878639

HSP 14 Score: 394.457 bits (213), Expect = 2.683e-107
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17919478 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGA--CAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17919258

HSP 15 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.471e-106
Identity = 220/224 (98.21%), Postives = 220/224 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAA-ATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858017 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAGATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTAAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 17857794

HSP 16 Score: 248.571 bits (134), Expect = 2.211e-63
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857707 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGG-ATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 17857568

HSP 17 Score: 244.878 bits (132), Expect = 2.860e-62
Identity = 138/141 (97.87%), Postives = 138/141 (97.87%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 17878552 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 17878412

HSP 18 Score: 244.878 bits (132), Expect = 2.860e-62
Identity = 138/141 (97.87%), Postives = 138/141 (97.87%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct: 17919173 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 17919033

HSP 19 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.752e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920568 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 17920457

HSP 20 Score: 180.245 bits (97), Expect = 8.179e-43
Identity = 107/112 (95.54%), Postives = 107/112 (95.54%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879920 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 17879809

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004076.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 460.936 bits (249), Expect = 2.608e-127
Identity = 268/277 (96.75%), Postives = 268/277 (96.75%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:    48408 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 48133

HSP 2 Score: 425.85 bits (230), Expect = 9.515e-117
Identity = 362/424 (85.38%), Postives = 362/424 (85.38%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 783
                ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:    48062 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 47643

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: CM010798.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.031e-123
Identity = 268/280 (95.71%), Postives = 268/280 (95.71%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 32384855 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 32384577

HSP 2 Score: 425.85 bits (230), Expect = 9.515e-117
Identity = 362/424 (85.38%), Postives = 362/424 (85.38%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 783
                ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 32384505 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 32384086

HSP 3 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.367e-39
Identity = 106/114 (92.98%), Postives = 106/114 (92.98%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 11512295 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGTAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 11512408

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 178.399 bits (96), Expect = 2.942e-42
Identity = 108/114 (94.74%), Postives = 108/114 (94.74%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 14673360 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACAGATAAATAATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 14673247

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004600.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 172.859 bits (93), Expect = 1.369e-40
Identity = 107/114 (93.86%), Postives = 107/114 (93.86%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct:    20374 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 20261


Match Name	Summary
AGQN03000461.1	E-Value: 1.171e-150, PID: 99.30 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010795.2	E-Value: 5.223e-179, PID: 98.36 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004076.1	E-Value: 2.608e-127, PID: 96.75 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010798.2	E-Value: 2.031e-123, PID: 95.71 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 2.942e-42, PID: 94.74 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004600.1	E-Value: 1.369e-40, PID: 93.86 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51512_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1406.42 bits (761), Expect = 0.000e+0
Identity = 840/874 (96.11%), Postives = 840/874 (96.11%), Query Frame = 1

Query:      822 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      429 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT-------------------T--GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1281

HSP 2 Score: 656.681 bits (355), Expect = 0.000e+0
Identity = 413/440 (93.86%), Postives = 413/440 (93.86%), Query Frame = 1

Query:      356 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 795
                ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTC--AGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 432

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51510_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 977.998 bits (529), Expect = 0.000e+0
Identity = 539/544 (99.08%), Postives = 539/544 (99.08%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      765 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1308

HSP 2 Score: 942.912 bits (510), Expect = 0.000e+0
Identity = 605/648 (93.36%), Postives = 605/648 (93.36%), Query Frame = 1

Query:      111 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 758
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||  |    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     |||||||      |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       27 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCA-------ATC--C---TGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACC------ATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 656

HSP 3 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.385e-47
Identity = 106/107 (99.07%), Postives = 106/107 (99.07%), Query Frame = 1

Query:      909 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:      657 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 763

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-61665_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 837.653 bits (453), Expect = 0.000e+0
Identity = 681/784 (86.86%), Postives = 681/784 (86.86%), Query Frame = 1

Query:       13 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 783
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| | |    |  |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:       31 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAA------------GAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGT-T-TTCA-ATG----C--T---TTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 783

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51517_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 688.074 bits (372), Expect = 0.000e+0
Identity = 376/378 (99.47%), Postives = 376/378 (99.47%), Query Frame = 1

Query:     1318 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 378

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51519_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 630.828 bits (341), Expect = 2.478e-179
Identity = 345/347 (99.42%), Postives = 345/347 (99.42%), Query Frame = 1

Query:      407 AAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 753
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      809 AAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 1155

HSP 2 Score: 442.47 bits (239), Expect = 1.246e-122
Identity = 305/332 (91.87%), Postives = 305/332 (91.87%), Query Frame = 1

Query:      821 AAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct:     1156 AAAGGCTACCATTTGCT--AGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT----T-----------------GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1464

HSP 3 Score: 405.537 bits (219), Expect = 1.635e-111
Identity = 231/237 (97.47%), Postives = 231/237 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      131 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTC 367
                |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct:      569 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTC 805


Match Name	Summary
PKGMv1-51512_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 96.11 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51510_t	E-Value: 1.385e-47, PID: 99.08 Description: No definition line [more]
PKGMv1-61665_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 86.86 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51517_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.47 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51519_t	E-Value: 2.478e-179, PID: 99.42 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: NC_044376.1
Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 765.633 bits (414), Expect = 0.000e+0
Identity = 423/427 (99.06%), Postives = 423/427 (99.06%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664319 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23663893

HSP 2 Score: 647.448 bits (350), Expect = 0.000e+0
Identity = 402/427 (94.15%), Postives = 402/427 (94.15%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641323 TATTTTGCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23640900

HSP 3 Score: 632.674 bits (342), Expect = 5.132e-179
Identity = 400/427 (93.68%), Postives = 400/427 (93.68%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 796
                ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||||||| |  |||||||||   |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23623988 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCAT-A--ATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23623568

HSP 4 Score: 538.495 bits (291), Expect = 1.151e-150
Identity = 293/294 (99.66%), Postives = 293/294 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23662905 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23662612

HSP 5 Score: 532.955 bits (288), Expect = 5.354e-149
Identity = 292/294 (99.32%), Postives = 292/294 (99.32%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23622580 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23622287

HSP 6 Score: 505.256 bits (273), Expect = 1.167e-140
Identity = 287/294 (97.62%), Postives = 287/294 (97.62%), Query Frame = 1

Query:     1402 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23639848 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23639555

HSP 7 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.175e-135
Identity = 273/277 (98.56%), Postives = 273/277 (98.56%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664673 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23664398

HSP 8 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.184e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23624336 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23624061

HSP 9 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.508e-129
Identity = 269/277 (97.11%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641678 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23641403

HSP 10 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.288e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23663239 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23662989

HSP 11 Score: 448.01 bits (242), Expect = 1.995e-123
Identity = 268/280 (95.71%), Postives = 268/280 (95.71%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23502770 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23502492

HSP 12 Score: 448.01 bits (242), Expect = 1.995e-123
Identity = 248/251 (98.80%), Postives = 248/251 (98.80%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23622915 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23622665

HSP 13 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.282e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1152 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 1402
                |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23640192 GTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 23639942

HSP 14 Score: 425.85 bits (230), Expect = 9.348e-117
Identity = 362/424 (85.38%), Postives = 362/424 (85.38%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 783
                ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 23502420 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 23502001

HSP 15 Score: 401.843 bits (217), Expect = 1.575e-109
Identity = 221/223 (99.10%), Postives = 221/223 (99.10%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23623471 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 23623249

HSP 16 Score: 401.843 bits (217), Expect = 1.575e-109
Identity = 221/223 (99.10%), Postives = 221/223 (99.10%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640785 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23640563

HSP 17 Score: 396.303 bits (214), Expect = 7.329e-108
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      793 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1015
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23663778 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23663556

HSP 18 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.298e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23623162 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 23623022

HSP 19 Score: 244.878 bits (132), Expect = 2.809e-62
Identity = 138/141 (97.87%), Postives = 138/141 (97.87%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 23640476 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 23640336

HSP 20 Score: 244.878 bits (132), Expect = 2.809e-62
Identity = 138/141 (97.87%), Postives = 138/141 (97.87%), Query Frame = 1

Query:     1012 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 1152
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 23663470 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCG 23663330

HSP 21 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.686e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664855 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 23664744

HSP 22 Score: 185.785 bits (100), Expect = 1.727e-44
Identity = 108/112 (96.43%), Postives = 108/112 (96.43%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641872 AGTACTACAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 23641761


Match Name	Summary
NC_044376.1	E-Value: 5.132e-179, PID: 99.06 Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: XM_030652513.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA

HSP 1 Score: 3053.63 bits (1653), Expect = 0.000e+0
Identity = 1681/1695 (99.17%), Postives = 1681/1695 (99.17%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      107 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1801

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: XM_030652515.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA

HSP 1 Score: 2865.27 bits (1551), Expect = 0.000e+0
Identity = 1648/1695 (97.23%), Postives = 1648/1695 (97.23%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||||||| |  |||||||||   |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AGTACTACAATATTCAAAGAACAACCGGAAGCAATTGTCCGACGATCAGGAAACTACAAACCCACGTTGTGGGATGCTCATTTTTTCAAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCAT-A--ATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1816

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: XM_030652514.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA

HSP 1 Score: 2850.5 bits (1543), Expect = 0.000e+0
Identity = 1645/1695 (97.05%), Postives = 1645/1695 (97.05%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1695
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      110 AGTACTACAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1801

[Close]

BLAST of TPS38 vs. Genbank
Match Name: XM_030652072.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA

HSP 1 Score: 1397.19 bits (756), Expect = 0.000e+0
Identity = 1359/1651 (82.31%), Postives = 1359/1651 (82.31%), Query Frame = 1

Query:       13 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGTATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGAC-A--AGGCAAAGTCAATTTACTAGA-GTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCA--GTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGAT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTA-TCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGA--AAATGAAA-GCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1638
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||  || ||   ||||||||| ||||| || |||||  | ||   |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||  |||| |  || |  |||| | | |||| |||| || | ||| ||| |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||| ||| | || |||||| ||||||||    | || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| |  |||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  |  || || ||| ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||   ||  |||| || | |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| ||| || ||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |  ||      | |||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||   |||||||  ||| ||||| |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      160 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTA-TATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATT-TAATG--GTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1797


Match Name	Summary
XM_030652513.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.17 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA [more]
XM_030652515.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.23 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA [more]
XM_030652514.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.05 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA [more]
XM_030652072.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 82.31 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 24..210 e-value: 1.8E-47 score: 161.5
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 23..547 e-value: 2.8E-190 score: 635.0
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 237..563
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 60..236 e-value: 2.8E-190 score: 635.0
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 242..507 e-value: 1.4E-94 score: 316.4
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 13..564
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 13..564
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 20..233

TPS38

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGG AAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAG TCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAA GATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCT TGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAG ATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTG TGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCG ACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAA ACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATG GTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATT AGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA CAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCAT GATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAG ATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA ATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAAC TTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTG GAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAG TGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGA TTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGA CGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAG AGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTAC ATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTA TTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAG CGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCAC AGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATC AATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTT CAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTA CGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATC AGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGC GTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTA ATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCC ATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAA TGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATAT CTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT
Sequence Length	1695
Sequence Checksum	9f62e94e31a8ea8003e62b44c5cd323a

Sequence

AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGG
AAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAG
TCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAA
GATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCT
TGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAG
ATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGTATTG
TGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCG
ACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAA
ACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATG
GTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATT
AGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA
CAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCAT
GATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAG
ATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA
ATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAAC
TTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTG
GAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAG
TGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGA
TTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGA
CGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAG
AGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTAC
ATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTA
TTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAG
CGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCAC
AGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATC
AATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTT
CAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTA
CGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATC
AGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGC
GTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTA
ATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCC
ATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAA
TGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATAT
CTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT

Sequence Length

1695

Sequence Checksum

9f62e94e31a8ea8003e62b44c5cd323a

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS38
Identifier	TPS38
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 10:06
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 10:06