TPS11 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: CM010795.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 765.633 bits (414), Expect = 0.000e+0
Identity = 419/421 (99.52%), Postives = 419/421 (99.52%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879385 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17878965

HSP 2 Score: 699.154 bits (378), Expect = 0.000e+0
Identity = 407/421 (96.67%), Postives = 407/421 (96.67%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17858534 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17858114

HSP 3 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.135e-170
Identity = 395/427 (92.51%), Postives = 395/427 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920019 TATTTTACAGAGATTTTCAATGCCTTCAAAAACGAGCAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATATCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 17919593

HSP 4 Score: 544.035 bits (294), Expect = 2.509e-152
Identity = 294/294 (100.00%), Postives = 294/294 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17877917 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17877624

HSP 5 Score: 510.796 bits (276), Expect = 2.544e-142
Identity = 288/294 (97.96%), Postives = 288/294 (97.96%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17857131 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17856838

HSP 6 Score: 505.256 bits (273), Expect = 1.184e-140
Identity = 276/277 (99.64%), Postives = 276/277 (99.64%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879736 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 17879461

HSP 7 Score: 505.256 bits (273), Expect = 1.184e-140
Identity = 287/294 (97.62%), Postives = 287/294 (97.62%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17913510 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 17913217

HSP 8 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.581e-132
Identity = 271/277 (97.83%), Postives = 271/277 (97.83%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858882 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 17858607

HSP 9 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.009e-128
Identity = 251/251 (100.00%), Postives = 251/251 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878261 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 17878011

HSP 10 Score: 449.856 bits (243), Expect = 5.626e-124
Identity = 266/277 (96.03%), Postives = 266/277 (96.03%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 17920369 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTCATGTATCTTCAG 17920094

HSP 11 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.414e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 17857461 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17857211

HSP 12 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.414e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 17913845 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAATTCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 17913595

HSP 13 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.434e-111
Identity = 222/223 (99.55%), Postives = 222/223 (99.55%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878861 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17878639

HSP 14 Score: 383.377 bits (207), Expect = 5.787e-104
Identity = 218/223 (97.76%), Postives = 218/223 (97.76%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17919478 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGA--CAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 17919258

HSP 15 Score: 379.683 bits (205), Expect = 7.486e-103
Identity = 218/224 (97.32%), Postives = 218/224 (97.32%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAA-ATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 17858017 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAGATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTAAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 17857794

HSP 16 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.829e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17878552 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 17878412

HSP 17 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.124e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 17919173 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 17919033

HSP 18 Score: 231.952 bits (125), Expect = 2.218e-58
Identity = 136/141 (96.45%), Postives = 136/141 (96.45%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 17857707 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGG-ATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 17857568

HSP 19 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.738e-51
Identity = 112/112 (100.00%), Postives = 112/112 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17879920 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 17879809

HSP 20 Score: 180.245 bits (97), Expect = 8.149e-43
Identity = 107/112 (95.54%), Postives = 107/112 (95.54%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 17920568 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 17920457

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000461.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 638.214 bits (345), Expect = 1.119e-180
Identity = 401/427 (93.91%), Postives = 401/427 (93.91%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5016 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 4590

HSP 2 Score: 510.796 bits (276), Expect = 2.544e-142
Identity = 288/294 (97.96%), Postives = 288/294 (97.96%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     3600 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 3307

HSP 3 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.547e-134
Identity = 272/277 (98.19%), Postives = 272/277 (98.19%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5370 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 5095

HSP 4 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.349e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct:     3938 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 3688

HSP 5 Score: 394.457 bits (213), Expect = 2.673e-107
Identity = 220/223 (98.65%), Postives = 220/223 (98.65%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     4475 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATT-AAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 4254

HSP 6 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.316e-65
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 140/141 (99.29%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct:     4168 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 4028

HSP 7 Score: 180.245 bits (97), Expect = 8.149e-43
Identity = 107/112 (95.54%), Postives = 107/112 (95.54%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5551 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 5440

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004076.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.586e-129
Identity = 269/277 (97.11%), Postives = 269/277 (97.11%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:    48408 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 48133

HSP 2 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.349e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 777
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:    48062 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 47643

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: CM010798.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.349e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 777
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 32384505 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 32384086

HSP 2 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.349e-125
Identity = 269/280 (96.07%), Postives = 269/280 (96.07%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 32384855 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 32384577

HSP 3 Score: 156.239 bits (84), Expect = 1.373e-35
Identity = 104/114 (91.23%), Postives = 104/114 (91.23%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 11512295 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGTAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 11512408

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.344e-39
Identity = 106/114 (92.98%), Postives = 106/114 (92.98%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct: 14673360 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACAGATAAATAATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 14673247

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: AGQN03004600.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 161.779 bits (87), Expect = 2.952e-37
Identity = 105/114 (92.11%), Postives = 105/114 (92.11%), Query Frame = 1

Query:      171 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAA 284
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||
Sbjct:    20374 GAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGATTGAACATATAAATGGTTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAAATAAGACAATATTAAACCTAACATATAA 20261


Match Name	Summary
CM010795.2	E-Value: 1.135e-170, PID: 99.52 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 8, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000461.1	E-Value: 1.119e-180, PID: 93.91 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000460F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004076.1	E-Value: 5.586e-129, PID: 97.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004080F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010798.2	E-Value: 4.349e-125, PID: 86.67 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 9, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 6.344e-39, PID: 92.98 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03004600.1	E-Value: 2.952e-37, PID: 92.11 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 004604F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51512_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1472.9 bits (797), Expect = 0.000e+0
Identity = 852/874 (97.48%), Postives = 852/874 (97.48%), Query Frame = 1

Query:      816 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      429 AAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT-------------------T--GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1281

HSP 2 Score: 789.64 bits (427), Expect = 0.000e+0
Identity = 432/434 (99.54%), Postives = 432/434 (99.54%), Query Frame = 1

Query:      356 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 789
                ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGATTCAGTCCTGTATCTTC--AGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGG 432

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51510_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1014.93 bits (549), Expect = 0.000e+0
Identity = 613/642 (95.48%), Postives = 613/642 (95.48%), Query Frame = 1

Query:      111 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 752
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       27 GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCA-------ATC--C---TGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATCATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCA 656

HSP 2 Score: 950.298 bits (514), Expect = 0.000e+0
Identity = 534/544 (98.16%), Postives = 534/544 (98.16%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      765 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1308

HSP 3 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.380e-47
Identity = 106/107 (99.07%), Postives = 106/107 (99.07%), Query Frame = 1

Query:      903 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct:      657 AACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 763

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-61665_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 859.812 bits (465), Expect = 0.000e+0
Identity = 682/780 (87.44%), Postives = 682/780 (87.44%), Query Frame = 1

Query:       13 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACT---TGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 777
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |    |    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | |    |  |   ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct:       31 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACT-C----C----A-A--GAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGT-T-TTCA-ATG----C--T---TTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 783

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51517_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 654.834 bits (354), Expect = 0.000e+0
Identity = 370/378 (97.88%), Postives = 370/378 (97.88%), Query Frame = 1

Query:     1312 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTACCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 378

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-51519_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 497.869 bits (269), Expect = 2.612e-139
Identity = 322/347 (92.80%), Postives = 322/347 (92.80%), Query Frame = 1

Query:      407 AAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 747
                |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      809 AAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGAGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAAAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTC 1155

HSP 2 Score: 436.93 bits (236), Expect = 5.776e-121
Identity = 304/332 (91.57%), Postives = 304/332 (91.57%), Query Frame = 1

Query:      815 AAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct:     1156 AAAGGCTACCATTTGCT--AGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCGGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT----T-----------------GCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTGAAGAAGGCG 1464

HSP 3 Score: 388.917 bits (210), Expect = 1.640e-106
Identity = 228/237 (96.20%), Postives = 228/237 (96.20%), Query Frame = 1

Query:      131 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTC 367
                |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct:      569 GAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGACTTCTTGAGAAGGAGCGTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACACATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTTAGTC 805


Match Name	Summary
PKGMv1-51512_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.48 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51510_t	E-Value: 1.380e-47, PID: 95.48 Description: No definition line [more]
PKGMv1-61665_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.44 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51517_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.88 Description: No definition line [more]
PKGMv1-51519_t	E-Value: 2.612e-139, PID: 92.80 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: NC_044376.1
Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 736.087 bits (398), Expect = 0.000e+0
Identity = 416/424 (98.11%), Postives = 416/424 (98.11%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGAT---CTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641323 TATTTTGCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23640900

HSP 2 Score: 693.614 bits (375), Expect = 0.000e+0
Identity = 406/421 (96.44%), Postives = 406/421 (96.44%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23623988 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATAATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23623568

HSP 3 Score: 632.674 bits (342), Expect = 5.113e-179
Identity = 400/427 (93.68%), Postives = 400/427 (93.68%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATGAT---GATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 790
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664319 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGT 23663893

HSP 4 Score: 521.875 bits (282), Expect = 1.155e-145
Identity = 290/294 (98.64%), Postives = 290/294 (98.64%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23639848 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23639555

HSP 5 Score: 510.796 bits (276), Expect = 2.500e-142
Identity = 288/294 (97.96%), Postives = 288/294 (97.96%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23662905 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23662612

HSP 6 Score: 505.256 bits (273), Expect = 1.163e-140
Identity = 287/294 (97.62%), Postives = 287/294 (97.62%), Query Frame = 1

Query:     1396 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23622580 GATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 23622287

HSP 7 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.517e-137
Identity = 274/277 (98.92%), Postives = 274/277 (98.92%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641678 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23641403

HSP 8 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.535e-132
Identity = 271/277 (97.83%), Postives = 271/277 (97.83%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23624336 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23624061

HSP 9 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.180e-130
Identity = 270/277 (97.47%), Postives = 270/277 (97.47%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664673 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 23664398

HSP 10 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.273e-125
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      371 TATCTT-CAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA---CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAA 777
                ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || |||
Sbjct: 23502420 TATTTTACAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAA 23502001

HSP 11 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.273e-125
Identity = 269/280 (96.07%), Postives = 269/280 (96.07%), Query Frame = 1

Query:      103 ATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAG 379
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23502770 ATATATA-GGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAG 23502492

HSP 12 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.273e-125
Identity = 249/251 (99.20%), Postives = 249/251 (99.20%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640192 GTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 23639942

HSP 13 Score: 442.47 bits (239), Expect = 9.249e-122
Identity = 247/251 (98.41%), Postives = 247/251 (98.41%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23663239 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23662989

HSP 14 Score: 436.93 bits (236), Expect = 4.303e-120
Identity = 246/251 (98.01%), Postives = 246/251 (98.01%), Query Frame = 1

Query:     1146 GTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAG 1396
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 23622915 GTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAG 23622665

HSP 15 Score: 412.923 bits (223), Expect = 7.251e-113
Identity = 223/223 (100.00%), Postives = 223/223 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640785 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23640563

HSP 16 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.374e-111
Identity = 222/223 (99.55%), Postives = 222/223 (99.55%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23663778 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 23663556

HSP 17 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.398e-106
Identity = 219/223 (98.21%), Postives = 219/223 (98.21%), Query Frame = 1

Query:      787 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGT 1009
                |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 23623471 AGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGT 23623249

HSP 18 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.780e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23640476 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 23640336

HSP 19 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.017e-64
Identity = 139/141 (98.58%), Postives = 139/141 (98.58%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct: 23663470 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCG 23663330

HSP 20 Score: 239.338 bits (129), Expect = 1.302e-60
Identity = 137/141 (97.16%), Postives = 137/141 (97.16%), Query Frame = 1

Query:     1006 AGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCG 1146
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct: 23623162 AGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCG 23623022

HSP 21 Score: 191.325 bits (103), Expect = 3.699e-46
Identity = 109/112 (97.32%), Postives = 109/112 (97.32%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23641872 AGTACTACAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 23641761

HSP 22 Score: 180.245 bits (97), Expect = 8.006e-43
Identity = 107/112 (95.54%), Postives = 107/112 (95.54%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGG 112
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23664855 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGG 23664744


Match Name	Summary
NC_044376.1	E-Value: 5.113e-179, PID: 98.11 Description: Cannabis sativa chromosome 9, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: XM_030652514.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA

HSP 1 Score: 3027.78 bits (1639), Expect = 0.000e+0
Identity = 1675/1692 (99.00%), Postives = 1675/1692 (99.00%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACC---ATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      110 AGTACTACAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAACATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTAAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACGAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTATGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATTTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGTCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTACAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTTCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1801

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: XM_030652515.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA

HSP 1 Score: 2865.27 bits (1551), Expect = 0.000e+0
Identity = 1643/1689 (97.28%), Postives = 1643/1689 (97.28%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AGTACTACAATATTCAAAGAACAACCGGAAGCAATTGTCCGACGATCAGGAAACTACAAACCCACGTTGTGGGATGCTCATTTTTTCAAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAGAATCCTTTAGTTAAACTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCCTTCAAAGACCAGAAAAAAGAGTTCAAAGAAAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTGAAACAATACTTGATGACGAGGCAAGGTCAAACTAAATCTGTTGACCATAATGATGATGATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTCATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTCGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGGTTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCATTGAAATATGAGGCAGAATTTGGATTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGGGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAATTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTTAAAGAAAATGGGATTCACATCATCAAATATCTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTTATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTATTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTATCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1816

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: XM_030652513.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA

HSP 1 Score: 2854.19 bits (1545), Expect = 0.000e+0
Identity = 1646/1695 (97.11%), Postives = 1646/1695 (97.11%), Query Frame = 1

Query:        1 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGA-C--CATGATGATGATG---ATGATCTTGTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1689
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||     ||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      107 AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATCGTCCGCCGATCAGGAAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAGTGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGACAATATTAAACCTGACTTTTAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATTTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTCGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGACTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGACAAGGCAAAGTCAATTTACTAGAGTTGACCATCATGATGATGATGATCATGATCTTGTGAAATTGGTAGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCAGTGGCACTAAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATTTGAAGAAAGCGTTGGGGGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACTATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTCTTTCGATTTATAGATGATTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATTAGTGAAGGATGGAAGGAAATTAATGAAGTCAAAGCTTCAAACTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGACCGATATCTTAAGACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT 1801

[Close]

BLAST of TPS11 vs. Genbank
Match Name: XM_030652072.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA

HSP 1 Score: 1386.11 bits (750), Expect = 0.000e+0
Identity = 1354/1647 (82.21%), Postives = 1354/1647 (82.21%), Query Frame = 1

Query:       13 TTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGGCAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAAATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACAT-T--TAACAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACT---TGATGACGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCT--TG-TGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCCAAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGA---AT--T-ATGATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTTCAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGGTTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAATTTTCTATTCTGCA--GTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGT-TTGTTAGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTC-ATGGACGATATATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTT-TTTCTAGAGGCAATTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAGATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGTCCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGGGTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGACACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTACAATACCTCTTTGTCTTA-TCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTACAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTCTCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGAACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAAAGGGTGTTAGTGA--AAATGAAA-GCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGTGAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTCTCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGATGTACCACAAGG-GT--GATGGTTTTGGTACTAAT 1632
                |||||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||  | || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| || | |||| | || || ||| |||||||| |||| || ||| ||  |  |||||||||||    | ||||  |   ||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||  |||| |  || |  |||| | | |||| |||| || | ||| | | |||   |||   || | ||||| || ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||  ||| | |||| ||| ||| | || |||||| ||||||||    | || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||    |||||||| ||  | ||| | || || ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| |   ||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| |||  |  || || ||| ||||||| | || || | | |||| | |||| | ||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||   ||  |||| || | ||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||| ||| || ||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| |  ||        |||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||   |||||||  ||| ||||| |||| |   |||||  |||||||||||
Sbjct:      160 TTCAAAGAACAAC---CAGCAATAGTCCGTCGATCAGGAAACTACAAACCCCCATTGTGGGATGCTCATTTTATCCAATCACTCCAAGTCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAAGATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCTTGAACAGATTAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAGATCAAATTAAGGCAATATTAAACCTGACATATAATAATAATAATAATGCATTGTGGAAGAAAAATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAGACAATATGGATTCAATCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGCTTTCAAAGACGAGAAAAAGGAGTTCAAAGAGAGTTTGAGTAAGGATGTGAAAGGAATGGTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATTAGATGAAGCAAGAGATTTCACAACAAAACATCTCAAACAATACTTGATGATGACGAGGCAAGGTAAAACTATATCTGTTGACCATGATGATAATAATGATTTAATGGTGAAATTAGTGGAGCATGCTTTGGAGCTTCCAGTGCATTGGAGAATGAAAAGGTTGGAGGCAAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAATGTCTCATCATCATCATATGAATTCAACTTTTCTTCAACTTGCTAAACTAGATTTTAACGTTGTACAATCAACATACCAAGAAGACCTTAAACATGCTGTAAGGTGGTGGAAAACTACTAGTCTAGGAGAAAGGTTACCCTTTGCAAGAGATAGGATAGTTGAAACGTTCT-TA-TGGACTGTGGGAGTTAAATTTGAGCCACAGTTTAGATATTGCC-GAAAAATGCTCACAAAGATGGGTCAATTGGTAAC-CTCAATGGACGATATATTTGACGTGTATGGTACGCTTGATGAGCTA-AGCCTCTTTCAAGACGCATTGGAAAGGTGGGATATAAATACGATAGACCAACTTCCAGATTACATGAAGATATTTTTTTTGGCTGCTTATAATGTGGTGAATGAAATGGCGTATGACGTGCTAAAACAAAATGGGATTCTCATTATCAAATATTTAAAGAAAACGTGGACGGATTTATGTAAATGTTACATGTTGGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGATACACACCAAGCTTGGAAGAATACATTAAAAATGGATGGATATCAATTGCAGAACC-CTTAATTCTAGTCAATCTTTATTGCCTTATAACCAATCCAATAAAAGAAGATGACATGGACTGCTTGCTTCAATATCCCACCTTTATTCGTATCTCAGGAATCATTGCTCGACTTGTTGATGATTTAGGAACTTCATCGGATGAACTGAAAAGAGGAGACAATCCTAAATCGATTCAATGCTATATGAAAGAAAATGGTATTTGTGATGAAAAGAATGGCCGTGAACACATAAGGAATTTAATCAGTGAAACATGGAAGGAAATGAATGAAGCTCGAGTGGGTGAGTCTCCATTTTCTCAAGCTTTTATTGAAACTGCCATAGATTTCGTTAGGACAGCAATGATGATATACCAAAAGGAGCAAGATGGGGTTGGTACTAAT 1797


Match Name	Summary
XM_030652514.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.00 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723096), mRNA [more]
XM_030652515.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.28 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723097), mRNA [more]
XM_030652513.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.11 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115723095), mRNA [more]
XM_030652072.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 82.21 Description: PREDICTED: Cannabis sativa probable monoterpene synthase MTS1, chloroplastic (LOC115722765), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 60..234 e-value: 7.5E-190 score: 633.6
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 23..545 e-value: 7.5E-190 score: 633.6
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 235..561
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 240..505 e-value: 3.0E-94 score: 315.3
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 24..208 e-value: 3.7E-48 score: 163.8
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 13..562
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 13..562
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 20..231

TPS11

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGG CAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAG TCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAA GATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCT TGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAA ATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTG TGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAG ACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAG ACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATG GTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATT AGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTT GTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCC AAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATG ATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTT CAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGG TTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAA TTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTT AGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATAT ATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAA TTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAG ATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGT CCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGG GTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGA CACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTAC AATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTA CAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTC TCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGA ACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAA AGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGT GAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTC TCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGA TGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAG ACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT
Sequence Length	1689
Sequence Checksum	7d38ac3fd1557ec1e0f034a62b91ce86

Sequence

AGTACTCCAATATTCAAAGATCAACCAGCAGCAATTGTCCGGCGATCAGG
CAACTACAAACCCACATTGTGGGATGCTCATTTTTTCAATTCACTCCAAG
TCATATATACGGAGGAAAGCTATGGGAAAAGAATCAATGAGCTGAAAGAA
GATGTGAGAAGAATTCTTGAGAAGGAGGCTGAAAATCCTTTAGTTAAGCT
TGAACAGATCAATGATTTGAGCAGACTTGGAATATCTTATCACTTTGAAA
ATCAAATTAAAACAATATTAAACCTGACATTTAACAATAATAATGCATTG
TGGAAGAAAGATAATCTGTATGCCACTGCTCTTCATTTCAAACTCCTTAG
ACAATATGGATTCAGTCCTGTATCTTCAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAG
ACGAGAAAAATGAGTTCAAGGAGAATTTAAGTAAGGATGTGAAAGGAATG
GTATGTCTATATGAGGCTTCATTCTATTCATTTAGGGGTGAACCCATATT
AGATGAAGCAAGAGATTTCACAACCAAACATCTCAAACAATACTTGATGA
CGAGGCAATGTCAAACTAAATCTGTTGACCATGATGATGATGATGATCTT
GTGAAACTTGTGGAGCATGCCTTGGATCTTCCACTCCATTGGAGATTGCC
AAGATTGGAGGCTAGGTGGTTTATTGATATGTATGCTGAAAGGAATTATG
ATATGAATCCAACTTTTCTTGACTTTGCTAAACTTGACTATAACTTCGTT
CAGTCAGCATACCAAAAAGAGCTCAAATATATTTCAAGGTGGTGGAGTGG
TTCTAGATTGACAGAAAGGCTACCATTTGCTAGAGACAGAGTAGTGGAAA
TTTTCTATTCTGCAGTGGCACTGAAATATGAGGCAGAATTTGGGTTTGTT
AGAACTGTGATGACAAAAATTGGTCTCTTGCTAACACTCATGGACGATAT
ATATGATGTGTATGGTACACTAGATGAGCTTCAGCTTTTTCTAGAGGCAA
TTGAGAGGTGGAATATAAATGAACTGGATCAGCTACCCGATTACATGAAG
ATATTGTTTGTTGCTTTTTATAACAATGTGAATGAGATATCTTATTATGT
CCTCAAAGAAAATGGGATTCACACCATCAAATATCTAAAGAAAGCGTTGG
GTGATCTGTGTAAATGCTATATGGAGGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGA
CACATACCAAGTTTAGAAGAATTCATTGAGAATGGATGGAAATCAATTAC
AATACCTCTTTGTCTTATCTATCATTATTGCTTAATTACAACTTCAATTA
CAGAACAAGACATGGAACACTTGCTTCAATATCCAACCATTTTACGTGTC
TCAGGAACTGTTTTTCGATTTATAGATGACTTGGGAACCTCATCAGATGA
ACTTGAAAGAGGAGATAATCCTTCATCAATTCAATGCTACATGCGTGAAA
AGGGTGTTAGTGAAAATGAAAGCCGTGAACACATATGGAATTTAATAAGT
GAAGGATGGAAAGAAATTAATGAAGTTAAAGCTTCAACCTCTCCATACTC
TCAAGTGTTTATTGAATCTGCCATTGATTTTGTTAGAGGAGCAATGGAGA
TGTACCACAAGGGTGATGGTTTTGGTACTAATCAAGATCGGTATCTTAAG
ACCAAAGTTGTCAACATGTTCTTCGATCCAATTCCAATT

Sequence Length

1689

Sequence Checksum

7d38ac3fd1557ec1e0f034a62b91ce86

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS11
Identifier	TPS11
Time Accessioned	Wednesday, April 24, 2024 - 10:25
Time Last Modified	Wednesday, April 24, 2024 - 10:25