TPS11-like | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 760.093 bits (411), Expect = 0.000e+0
Identity = 417/420 (99.29%), Postives = 417/420 (99.29%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 812
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Sbjct:    17986 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGATGATCTAAAACATATATTCAGGTG 18405

HSP 2 Score: 503.409 bits (272), Expect = 4.334e-140
Identity = 272/272 (100.00%), Postives = 272/272 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1438
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Sbjct:    19805 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 20076

HSP 3 Score: 503.409 bits (272), Expect = 4.334e-140
Identity = 280/283 (98.94%), Postives = 280/283 (98.94%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 1719
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Sbjct:    20671 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAG-AAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAA--AAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 20950

HSP 4 Score: 472.016 bits (255), Expect = 1.222e-130
Identity = 262/265 (98.87%), Postives = 262/265 (98.87%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTA-TAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
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Sbjct:    15859 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTAAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTA-TTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATTAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 16122

HSP 5 Score: 460.936 bits (249), Expect = 2.646e-127
Identity = 364/420 (86.67%), Postives = 364/420 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 812
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Sbjct:    27470 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATCATGATATCAGAGCAAAAAAAG-T--T-ACTGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCAATTTCAACACAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 27883

HSP 6 Score: 446.163 bits (241), Expect = 7.409e-123
Identity = 267/280 (95.36%), Postives = 267/280 (95.36%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
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Sbjct:    36725 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 37004

HSP 7 Score: 383.377 bits (207), Expect = 5.892e-104
Identity = 223/230 (96.96%), Postives = 223/230 (96.96%), Query Frame = 1

Query:      800 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAG---TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
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Sbjct:    18496 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 8 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.149e-93
Identity = 244/272 (89.71%), Postives = 244/272 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1438
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Sbjct:    36053 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTTGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAACAACATCATCGG 36324

HSP 9 Score: 324.284 bits (175), Expect = 3.622e-86
Identity = 209/225 (92.89%), Postives = 209/225 (92.89%), Query Frame = 1

Query:      804 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
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Sbjct:    27968 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191

HSP 10 Score: 300.278 bits (162), Expect = 6.104e-79
Identity = 231/264 (87.50%), Postives = 231/264 (87.50%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
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Sbjct:    26374 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 26631

HSP 11 Score: 267.038 bits (144), Expect = 6.191e-69
Identity = 144/144 (100.00%), Postives = 144/144 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1024 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1167
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Sbjct:    19312 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 19455

HSP 12 Score: 246.725 bits (133), Expect = 8.065e-63
Identity = 133/133 (100.00%), Postives = 133/133 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 133
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Sbjct:    13181 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 13313

HSP 13 Score: 211.638 bits (114), Expect = 2.942e-52
Identity = 127/133 (95.49%), Postives = 127/133 (95.49%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 133
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Sbjct:    25829 TCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTT-GTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 25960

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 760.093 bits (411), Expect = 0.000e+0
Identity = 417/420 (99.29%), Postives = 417/420 (99.29%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 812
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Sbjct:  2519050 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2519469

HSP 2 Score: 523.722 bits (283), Expect = 3.327e-146
Identity = 283/283 (100.00%), Postives = 283/283 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 1719
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Sbjct:  2521799 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 2522081

HSP 3 Score: 496.022 bits (268), Expect = 7.253e-138
Identity = 271/272 (99.63%), Postives = 271/272 (99.63%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1438
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Sbjct:  2520934 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACC-GTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2521204

HSP 4 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.214e-135
Identity = 264/264 (100.00%), Postives = 264/264 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
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Sbjct:  2516928 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2517191

HSP 5 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.647e-134
Identity = 368/420 (87.62%), Postives = 368/420 (87.62%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 812
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Sbjct:  2528610 AGAAATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2529023

HSP 6 Score: 429.543 bits (232), Expect = 7.461e-118
Identity = 264/280 (94.29%), Postives = 264/280 (94.29%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2530869 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 2531148

HSP 7 Score: 383.377 bits (207), Expect = 5.892e-104
Identity = 228/237 (96.20%), Postives = 228/237 (96.20%), Query Frame = 1

Query:      794 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAG---TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
                |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2519552 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 8 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.149e-93
Identity = 244/272 (89.71%), Postives = 244/272 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1438
                |||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2530193 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACAATGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2530464

HSP 9 Score: 324.284 bits (175), Expect = 3.622e-86
Identity = 209/225 (92.89%), Postives = 209/225 (92.89%), Query Frame = 1

Query:      804 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
                ||| ||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:  2529109 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

HSP 10 Score: 287.351 bits (155), Expect = 4.752e-75
Identity = 229/264 (86.74%), Postives = 229/264 (86.74%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
                ||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | |||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||  | ||||| ||||| | | ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2527515 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAA-CAAAAA-ATATCAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCTATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2527770

HSP 11 Score: 268.884 bits (145), Expect = 1.721e-69
Identity = 145/145 (100.00%), Postives = 145/145 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1024 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 1168
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2520436 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 2520580

HSP 12 Score: 246.725 bits (133), Expect = 8.065e-63
Identity = 133/133 (100.00%), Postives = 133/133 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 133
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2514255 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2514387

HSP 13 Score: 219.025 bits (118), Expect = 1.758e-54
Identity = 128/133 (96.24%), Postives = 128/133 (96.24%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 133
                |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  2526969 TCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2527101

HSP 14 Score: 206.098 bits (111), Expect = 1.369e-50
Identity = 133/144 (92.36%), Postives = 133/144 (92.36%), Query Frame = 1

Query:     1024 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1167
                ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2529471 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTCTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGGAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2529614

HSP 15 Score: 156.239 bits (84), Expect = 1.398e-35
Identity = 176/221 (79.64%), Postives = 176/221 (79.64%), Query Frame = 1

Query:      808 AGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
                ||||||||||| ||||| |||||||| | | |  || ||||    |||||| |||| ||||| |||||||||||||   | ||||||  || ||||||| ||   || |||| ||||| ||   |||  | ||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||
Sbjct:  3143570 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: AGQN03000042.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 152.546 bits (82), Expect = 1.809e-34
Identity = 104/115 (90.43%), Postives = 104/115 (90.43%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTC 115
                |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||
Sbjct:   178231 TCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 178117

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: AGQN03006686.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 006691F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 56.5198 bits (30), Expect = 1.459e-5
Identity = 35/37 (94.59%), Postives = 35/37 (94.59%), Query Frame = 1

Query:      592 ATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGAT-ATC 627
                |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:    29772 ATGA-TGATAATGATAATGATTATGATTATGATGATC 29737

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: AGQN03001835.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 001837F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 56.5198 bits (30), Expect = 1.459e-5
Identity = 35/37 (94.59%), Postives = 35/37 (94.59%), Query Frame = 1

Query:      592 ATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGAT-ATC 627
                |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct:    36531 ATGA-TGATAATGATAATGATTATGATTATGATGATC 36496


Match Name	Summary
AGQN03003403.1	E-Value: 4.334e-140, PID: 99.29 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 3.327e-146, PID: 99.29 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000042.1	E-Value: 1.809e-34, PID: 90.43 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03006686.1	E-Value: 1.459e-5, PID: 94.59 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 006691F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03001835.1	E-Value: 1.459e-5, PID: 94.59 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 001837F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-70835_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 484.943 bits (262), Expect = 2.071e-135
Identity = 264/265 (99.62%), Postives = 264/265 (99.62%), Query Frame = 1

Query:      442 ATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGT 706
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 ATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGT 265

HSP 2 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.775e-109
Identity = 320/370 (86.49%), Postives = 320/370 (86.49%), Query Frame = 1

Query:      400 TTTAATCA-T-TTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACAT 767
                ||||| || | || ||||| ||||||| |||||||||||  ||||| | | || ||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct:      618 TTTAA-CACTCTTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACAT 980

HSP 3 Score: 324.284 bits (175), Expect = 4.777e-87
Identity = 212/230 (92.17%), Postives = 212/230 (92.17%), Query Frame = 1

Query:     1438 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGT-TCTCAAG 1666
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||
Sbjct:      982 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGGCTCTCAAG 1211


Match Name	Summary
PKGMv1-70835_t	E-Value: 2.071e-135, PID: 99.62 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 765.633 bits (414), Expect = 0.000e+0
Identity = 418/420 (99.52%), Postives = 418/420 (99.52%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 812
                |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2020238 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2020657

HSP 2 Score: 523.722 bits (283), Expect = 3.269e-146
Identity = 283/283 (100.00%), Postives = 283/283 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 1719
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2022990 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 2023272

HSP 3 Score: 503.409 bits (272), Expect = 4.258e-140
Identity = 272/272 (100.00%), Postives = 272/272 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1438
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2022123 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2022394

HSP 4 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.192e-135
Identity = 264/264 (100.00%), Postives = 264/264 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2018107 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2018370

HSP 5 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.548e-134
Identity = 368/420 (87.62%), Postives = 368/420 (87.62%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 812
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Sbjct:  2034629 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2035042

HSP 6 Score: 440.623 bits (238), Expect = 3.386e-121
Identity = 266/280 (95.00%), Postives = 266/280 (95.00%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
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Sbjct:  2036943 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 2037222

HSP 7 Score: 394.457 bits (213), Expect = 2.674e-107
Identity = 230/237 (97.05%), Postives = 230/237 (97.05%), Query Frame = 1

Query:      794 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAG---TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
                |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2020740 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

HSP 8 Score: 348.29 bits (188), Expect = 2.112e-93
Identity = 244/272 (89.71%), Postives = 244/272 (89.71%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1438
                |||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2036267 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2036538

HSP 9 Score: 324.284 bits (175), Expect = 3.558e-86
Identity = 209/225 (92.89%), Postives = 209/225 (92.89%), Query Frame = 1

Query:      804 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
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Sbjct:  2035138 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 10 Score: 316.897 bits (171), Expect = 5.954e-84
Identity = 234/264 (88.64%), Postives = 234/264 (88.64%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
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Sbjct:  2029273 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2029530

HSP 11 Score: 267.038 bits (144), Expect = 6.082e-69
Identity = 144/144 (100.00%), Postives = 144/144 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1024 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1167
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2021626 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2021769

HSP 12 Score: 246.725 bits (133), Expect = 7.924e-63
Identity = 133/133 (100.00%), Postives = 133/133 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 133
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2015418 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2015550

HSP 13 Score: 230.105 bits (124), Expect = 7.980e-58
Identity = 130/133 (97.74%), Postives = 130/133 (97.74%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 133
                |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  2028712 TCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2028844

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 2.890e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1024 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1167
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Sbjct:  2035501 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2035644

HSP 15 Score: 156.239 bits (84), Expect = 1.374e-35
Identity = 176/221 (79.64%), Postives = 176/221 (79.64%), Query Frame = 1

Query:      808 AGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
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Sbjct:  2396996 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 477.556 bits (258), Expect = 2.581e-132
Identity = 366/419 (87.35%), Postives = 366/419 (87.35%), Query Frame = 1

Query:      393 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGT 811
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Sbjct:   197143 AGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGT 196728

HSP 2 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.538e-95
Identity = 221/235 (94.04%), Postives = 221/235 (94.04%), Query Frame = 1

Query:      795 AAAACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 1025
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Sbjct:   196619 AAAATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385

HSP 3 Score: 318.744 bits (172), Expect = 1.656e-84
Identity = 255/293 (87.03%), Postives = 255/293 (87.03%), Query Frame = 1

Query:     1437 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAA-GTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
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Sbjct:   193002 GGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 192711

HSP 4 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.298e-75
Identity = 236/273 (86.45%), Postives = 236/273 (86.45%), Query Frame = 1

Query:      131 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 394
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Sbjct:   197696 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAAT---TTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 197427

HSP 5 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.307e-70
Identity = 232/270 (85.93%), Postives = 232/270 (85.93%), Query Frame = 1

Query:     1167 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1436
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Sbjct:   193681 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAAT-A-A-AG--A---G-A-T-------TTTT-GAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 193430

HSP 6 Score: 200.558 bits (108), Expect = 6.257e-49
Identity = 132/144 (91.67%), Postives = 132/144 (91.67%), Query Frame = 1

Query:     1024 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1167
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Sbjct:   195279 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 195136

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: NC_044373.1
Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 152.546 bits (82), Expect = 1.777e-34
Identity = 104/115 (90.43%), Postives = 104/115 (90.43%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTC 115
                |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||
Sbjct: 70056718 TCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 70056604


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 3.269e-146, PID: 99.52 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]
NW_022060378.1	E-Value: 2.581e-132, PID: 87.35 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044373.1	E-Value: 1.777e-34, PID: 90.43 Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 3149.66 bits (1705), Expect = 0.000e+0
Identity = 1717/1722 (99.71%), Postives = 1717/1722 (99.71%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAG---TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 1719
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Sbjct:      154 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTA 1875

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 2318.67 bits (1255), Expect = 0.000e+0
Identity = 1567/1719 (91.16%), Postives = 1567/1719 (91.16%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAG---TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
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Sbjct:      186 TCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATAT--T-AATAATCCTAATT---ATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGAT------TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1892

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 1960.42 bits (1061), Expect = 0.000e+0
Identity = 1498/1704 (87.91%), Postives = 1498/1704 (87.91%), Query Frame = 1

Query:       38 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT------ATTAA---TATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAG-TATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
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Sbjct:       97 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAAT-A-A-AG--A---G-A-T-------TTTT-GAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1775

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1945.64 bits (1053), Expect = 0.000e+0
Identity = 1498/1707 (87.76%), Postives = 1498/1707 (87.76%), Query Frame = 1

Query:       38 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT------ATTAA---TATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAG-TATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
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Sbjct:       99 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAAT-A-A-AG--A---G-A-T-------TTTT-GAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1780

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 1363.95 bits (738), Expect = 0.000e+0
Identity = 1013/1145 (88.47%), Postives = 1013/1145 (88.47%), Query Frame = 1

Query:       38 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT------ATTAA---TATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAG---TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1167
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Sbjct:      103 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1241

HSP 2 Score: 320.591 bits (173), Expect = 3.433e-86
Identity = 256/294 (87.07%), Postives = 256/294 (87.07%), Query Frame = 1

Query:     1436 CGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAA-GTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1716
                |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   || |  || |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct:     1240 CGGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1532

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 723.16 bits (391), Expect = 0.000e+0
Identity = 1174/1549 (75.79%), Postives = 1174/1549 (75.79%), Query Frame = 1

Query:       54 TATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTT--A-CAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAA-A-AGA-TGTTAATTGAGATGGAA---AATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATA-T--ATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGAAGAGAT---AGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTC-AATATCT---AAAGAAC-TA-C-ATTATAATGATATCACAAGAAAGAAA-GTTAATGATTGAT-AATGATAATGATTATGATTATGATATCG-A--AATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGG-G-G-AGTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATG-ATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACA-GTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCAT-AGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATC-ATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGA 1568
                |||| || || |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | | |||| || || | || ||  | |||  | |||||||| | | | ||||| |||||||| ||   || ||||||  |||||||||  | |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| || ||||| || |    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||||| |||||   | | ||  |||| || |  | || | | || ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||| |||  ||| | ||| || ||| |||   |||  || || | | ||| | |||   |   |||| |||   | || |||  | |||||| ||||| ||||| || ||||   |  | |||||||||| || |||||||| |||||| || |||| |  |||||| ||||||| | ||||||||| ||    ||||| ||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||| ||||||| | | |||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| |||||||| | | |  || ||||    |||||| |||| ||||| |||||||||||||   | ||||||  || ||||||| ||   || |||| ||||| ||   |||  | ||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| || |||   ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| || |||||||  || || || ||| || ||||| | || ||| ||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |  |   |||||||||||||||||||   | |||||||| | ||||||| | |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||   || |||| || |  || || |||||||||| |||| | |||||  |  | ||| | | | | | ||  ||     ||| |   ||    |||   ||||||   | | ||||||||   |||   | |||| ||  ||||||||||| |||| |||| |||||| |   || ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| | || | |   || ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||
Sbjct:      194 TATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATT---ATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAA-TCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGAT-GGA-GCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTG-AAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-A-ATTTCC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTT-ACAAAAGATGCCA-TA--AA-----TTTAC---TG----GAATTAGGTTAT--CCAC-CCATAATTTACCATGCAT-CCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAAT-GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGA 1711

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BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030640479.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 148.852 bits (80), Expect = 1.714e-34
Identity = 100/110 (90.91%), Postives = 100/110 (90.91%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCA 110
                |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct:      111 TCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCA 2

[Close]

BLAST of TPS11-like vs. Genbank
Match Name: XM_030640478.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 148.852 bits (80), Expect = 1.714e-34
Identity = 100/110 (90.91%), Postives = 100/110 (90.91%), Query Frame = 1

Query:        1 TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCA 110
                |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct:      111 TCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCA 2


Match Name	Summary
XM_030645438.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 99.71 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA [more]
XM_030645439.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 91.16 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA [more]
XM_030629489.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.91 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030629488.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.76 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030629490.1	E-Value: 3.433e-86, PID: 88.47 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030644559.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 75.79 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030640479.1	E-Value: 1.714e-34, PID: 90.91 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030640478.1	E-Value: 1.714e-34, PID: 90.91 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 45..60
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 61..61
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..44
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..25
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 26..43
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 44..56
None	No IPR available	SIGNALP_EUK	SignalP-noTM	SignalP-noTM	coord: 1..12 score: 0.494
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 20..39
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 40..40
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 17..39
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..16
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 17..39
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 24..61
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..23
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None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 20..572
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 20..572
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
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None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..27
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 5..27
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 10..32
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 30..557 e-value: 9.1E-182 score: 606.9
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 242..571
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 30..188 e-value: 2.0E-43 score: 148.3
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 247..519 e-value: 1.7E-95 score: 319.4
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 67..241 e-value: 9.1E-182 score: 606.9
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 28..242

TPS11-like

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGC AATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTG ATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGT CGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGA AAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAG TATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT ATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCT TGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTT TTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGT GATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAA AAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATC TAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGAT AATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGA GCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCG ACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCT AAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACA TATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGTTGAATTTTGCAA GAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAG CCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAAT AACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAG AGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAG TTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAA TGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTC AATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAG GCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAA AAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATT TTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTC GAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCAT AATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAA GAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTA TCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATG GAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAG ATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGAT GGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGAT TATTGAACCTATTCCCTTA
Sequence Length	1719
Sequence Checksum	cd04137c72105ae00d308d98ee784615

Sequence

TCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGC
AATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTG
ATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGT
CGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGA
AAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAG
TATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT
ATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCT
TGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTT
TTAATCATTTTAAGGAAGAGATAGGAAAAATCAAAGCGAACATGATTAGT
GATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAA
AAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATC
TAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGAT
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GCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCG
ACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCT
AAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACA
TATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGTTGAATTTTGCAA
GAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAG
CCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAAT
AACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAG
AGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAG
TTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAA
TGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTC
AATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAG
GCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAA
AAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATT
TTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTC
GAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCAT
AATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAA
GAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTA
TCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATG
GAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAG
ATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGAT
GGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGAT
TATTGAACCTATTCCCTTA

Sequence Length

1719

Sequence Checksum

cd04137c72105ae00d308d98ee784615

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS11-like
Identifier	TPS11-like
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 10:02
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 10:02