TPS53 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001633	EAL_dom

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.184e-135
Identity = 370/421 (87.89%), Postives = 370/421 (87.89%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTG 776
                ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||   |||||||||||| |   ||||||| || |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||
Sbjct:    17986 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAG-AAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGATGATCTAAAACATATATTCAGGTG 18405

HSP 2 Score: 361.217 bits (195), Expect = 2.692e-97
Identity = 219/230 (95.22%), Postives = 219/230 (95.22%), Query Frame = 1

Query:      764 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    18496 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 3 Score: 355.677 bits (192), Expect = 1.252e-95
Identity = 262/294 (89.12%), Postives = 262/294 (89.12%), Query Frame = 1

Query:     1384 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1677
                |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| |  | |  |||||   |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct:    36726 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTA 37007

HSP 4 Score: 318.744 bits (172), Expect = 1.643e-84
Identity = 254/291 (87.29%), Postives = 254/291 (87.29%), Query Frame = 1

Query:     1384 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1674
                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   || |  || |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct:    20672 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAA-GTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAA-AAA-AATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 20947

HSP 5 Score: 313.204 bits (169), Expect = 7.645e-83
Identity = 207/225 (92.00%), Postives = 207/225 (92.00%), Query Frame = 1

Query:      768 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAC---AACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:    27968 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191

HSP 6 Score: 305.817 bits (165), Expect = 1.279e-80
Identity = 238/271 (87.82%), Postives = 238/271 (87.82%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||   |||         |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct:    26374 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGA-GAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAAT---AAT---------CCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 26631

HSP 7 Score: 294.738 bits (159), Expect = 2.769e-77
Identity = 236/270 (87.41%), Postives = 236/270 (87.41%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1382
                ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    19805 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 20074

HSP 8 Score: 278.118 bits (150), Expect = 2.789e-72
Identity = 233/270 (86.30%), Postives = 233/270 (86.30%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1382
                |||||| |||||||||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||      |  |   |  | ||| | | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:    36053 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTTGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAACAACATCATC 36322

HSP 9 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.298e-70
Identity = 235/275 (85.45%), Postives = 235/275 (85.45%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT----ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | || || ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||    |  | |   |||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct:    15859 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGA-GATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTAAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTG-AAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATTAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 16122

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.506e-134
Identity = 369/421 (87.65%), Postives = 369/421 (87.65%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTG 776
                ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||   |||||||||||| |   ||||||| || |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||
Sbjct:  2519050 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAG-AAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2519469

HSP 2 Score: 361.217 bits (195), Expect = 2.692e-97
Identity = 219/230 (95.22%), Postives = 219/230 (95.22%), Query Frame = 1

Query:      764 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2519559 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 3 Score: 322.437 bits (174), Expect = 1.270e-85
Identity = 254/291 (87.29%), Postives = 254/291 (87.29%), Query Frame = 1

Query:     1384 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1674
                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   || |  || |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct:  2521800 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 2522078

HSP 4 Score: 313.204 bits (169), Expect = 7.645e-83
Identity = 207/225 (92.00%), Postives = 207/225 (92.00%), Query Frame = 1

Query:      768 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAC---AACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:  2529109 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

HSP 5 Score: 303.971 bits (164), Expect = 4.601e-80
Identity = 237/270 (87.78%), Postives = 237/270 (87.78%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||   |||         |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct:  2527515 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATAT--CAATATTAAT---AAT---------CCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2527770

HSP 6 Score: 292.891 bits (158), Expect = 9.960e-77
Identity = 236/270 (87.41%), Postives = 236/270 (87.41%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1382
                ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2520934 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACC-GTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2521202

HSP 7 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.288e-75
Identity = 237/274 (86.50%), Postives = 237/274 (86.50%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | || || ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    |  | |   |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct:  2516928 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGA-GATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2517191

HSP 8 Score: 278.118 bits (150), Expect = 2.789e-72
Identity = 233/270 (86.30%), Postives = 233/270 (86.30%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1382
                |||||| |||||||||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||      |  |   |  | ||| | | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2530193 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACAATGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2530462

HSP 9 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.299e-39
Identity = 179/222 (80.63%), Postives = 179/222 (80.63%), Query Frame = 1

Query:      772 AGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACTGTC---AA-ATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||  || ||||||| ||   || |||| ||||| || ||||   || ||||  ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||||||
Sbjct:  3143570 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAA-TGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790


Match Name	Summary
AGQN03003403.1	E-Value: 1.184e-135, PID: 87.89 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 5.506e-134, PID: 87.65 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-70835_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.711e-71
Identity = 220/255 (86.27%), Postives = 220/255 (86.27%), Query Frame = 1

Query:      415 AGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACAT-A-A-TGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGA 665
                |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||| | | |||||||| |  ||| |||| || |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct:        7 AGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAA-GAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGA 260


Match Name	Summary
PKGMv1-70835_t	E-Value: 1.711e-71, PID: 86.27 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 408/416 (98.08%), Postives = 408/416 (98.08%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACA---TAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGT 775
                |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   197143 AGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGT 196728

HSP 2 Score: 532.955 bits (288), Expect = 5.296e-149
Identity = 293/295 (99.32%), Postives = 293/295 (99.32%), Query Frame = 1

Query:     1384 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAA-TATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1677
                |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   193001 GAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 192708

HSP 3 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.499e-137
Identity = 269/270 (99.63%), Postives = 269/270 (99.63%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   197696 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 197427

HSP 4 Score: 448.01 bits (242), Expect = 1.973e-123
Identity = 250/254 (98.43%), Postives = 250/254 (98.43%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTG 1384
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   193681 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTG 193428

HSP 5 Score: 396.303 bits (214), Expect = 7.250e-108
Identity = 228/234 (97.44%), Postives = 228/234 (97.44%), Query Frame = 1

Query:      760 AAACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAAC---TGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   196618 AAATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385

HSP 6 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.759e-67
Identity = 143/144 (99.31%), Postives = 143/144 (99.31%), Query Frame = 1

Query:      988 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1131
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   195279 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 195136

HSP 7 Score: 180.245 bits (97), Expect = 7.949e-43
Identity = 97/97 (100.00%), Postives = 97/97 (100.00%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGG 97
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   198432 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGG 198336

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.163e-135
Identity = 370/421 (87.89%), Postives = 370/421 (87.89%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTG 776
                ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||   |||||||||||| |   ||||||| || |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||
Sbjct:  2020238 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAG-AAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2020657

HSP 2 Score: 350.137 bits (189), Expect = 5.725e-94
Identity = 217/230 (94.35%), Postives = 217/230 (94.35%), Query Frame = 1

Query:      764 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2020747 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

HSP 3 Score: 322.437 bits (174), Expect = 1.248e-85
Identity = 254/291 (87.29%), Postives = 254/291 (87.29%), Query Frame = 1

Query:     1384 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1674
                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   || |  || |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct:  2022991 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 2023269

HSP 4 Score: 316.897 bits (171), Expect = 5.806e-84
Identity = 240/271 (88.56%), Postives = 240/271 (88.56%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    ||| || |    || ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct:  2029273 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGA-GAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-AT--ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2029530

HSP 5 Score: 313.204 bits (169), Expect = 7.511e-83
Identity = 207/225 (92.00%), Postives = 207/225 (92.00%), Query Frame = 1

Query:      768 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAC---AACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:  2035138 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 6 Score: 294.738 bits (159), Expect = 2.721e-77
Identity = 236/270 (87.41%), Postives = 236/270 (87.41%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1382
                ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2022123 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2022392

HSP 7 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.266e-75
Identity = 237/274 (86.50%), Postives = 237/274 (86.50%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | || || ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    |  | |   |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct:  2018107 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGA-GATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2018370

HSP 8 Score: 283.658 bits (153), Expect = 5.889e-74
Identity = 234/270 (86.67%), Postives = 234/270 (86.67%), Query Frame = 1

Query:     1131 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1382
                |||||| |||||||||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||      |  |   |  | ||| | | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2036267 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2036536

HSP 9 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.188e-39
Identity = 179/222 (80.63%), Postives = 179/222 (80.63%), Query Frame = 1

Query:      772 AGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACTGTC---AA-ATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 989
                ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||  || ||||||| ||   || |||| ||||| || ||||   || ||||  ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||||||
Sbjct:  2396996 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAA-TGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776


Match Name	Summary
NW_022060378.1	E-Value: 5.296e-149, PID: 98.08 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044374.1	E-Value: 1.163e-135, PID: 87.89 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 2998.23 bits (1623), Expect = 0.000e+0
Identity = 1665/1684 (98.87%), Postives = 1665/1684 (98.87%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       96 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1778

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 2983.46 bits (1615), Expect = 0.000e+0
Identity = 1665/1687 (98.70%), Postives = 1665/1687 (98.70%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCA---AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1677
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       98 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1783

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 2008.43 bits (1087), Expect = 0.000e+0
Identity = 1124/1140 (98.60%), Postives = 1124/1140 (98.60%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCA---AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1131
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      102 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1241

HSP 2 Score: 532.955 bits (288), Expect = 3.950e-150
Identity = 293/295 (99.32%), Postives = 293/295 (99.32%), Query Frame = 1

Query:     1384 GAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1677
                |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1242 GAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1535

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 1989.96 bits (1077), Expect = 0.000e+0
Identity = 1505/1705 (88.27%), Postives = 1505/1705 (88.27%), Query Frame = 1

Query:        2 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAG---AACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1674
                ||||||||  | | | ||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | || || ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||   ||  || |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||   |||||||||||| |   ||||||| || |||||| ||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   ||| |  | |  |||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct:      191 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGA-GATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT------ATTAA---TATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAG-AAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1872

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 1934.56 bits (1047), Expect = 0.000e+0
Identity = 1499/1708 (87.76%), Postives = 1499/1708 (87.76%), Query Frame = 1

Query:        2 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGA-AGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGG---TGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTAC---ATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCAT---CG-ATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAC---AACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1677
                ||||||||  | | | ||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    ||| || |    || | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||| || |||  |||||| | |||||| |||   ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||      ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||      |  |   |  | ||| | | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| |  | |  |||||   |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct:      223 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGA-GAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-A-T-ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTA 1895

[Close]

BLAST of TPS53 vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 774.866 bits (419), Expect = 0.000e+0
Identity = 1279/1692 (75.59%), Postives = 1279/1692 (75.59%), Query Frame = 1

Query:       26 GAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTT---TCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAA-AG-GA-TGCTAGTTGAGATGGAA---AACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAG---ACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGT-G-G-TGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTC-AAAA--AC-TA-C-ATAATGA-TATCAGAGCAAAAGAAA--TTGATGATTAAT-AATAATTATGATTATTATTACGATAT-TGA--AGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAG-AAAAAA-CAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACTGTC---AA-ATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATG-ATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATA-AAGAGATTTTCGAA-TG-CTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCA--CAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGAT--GGA-T-TAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCC 1673
                ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||   |||||| |||||||||||||| | | ||||||| || | ||  | || || | | |||||||| ||  | || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||  | |||||  | || |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||     |||   || |||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| | ||| |||   |||||||| |||   ||| | || |||||  |||  |  ||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||  ||||| || ||||||||  ||| | |||  ||| ||||| ||||  || || | |  ||||  ||  |||| ||| |||   | || |||| | ||| |||||||| || || |  |||| | |  | ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |  ||||||  |||||| | ||||||||| ||| | || | | |||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||| | | |||| |||||| | |||||| | |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||  || ||||||| ||   || |||| ||||| || ||||   || ||||  ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||   ||  |||| ||||||||||| ||||  |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||||  || ||  | ||| || | ||| || |  || ||||  || ||| | | ||||  |||||||||||| | |||| |  |    ||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||  |||||||| ||   || |||  || || || || |||||||||| |||| | |||||  |  || || ||||     || |    |||||   ||||||   ||  ||||||||   ||  || | |||| ||  ||||||||||| |||| |||| ||||||   ||| ||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| | || | |  | | | |||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||   |||||||| || |||||   ||||  |||  ||  ||| | |  | | || || |  |||  || || ||   | |||  ||||||| |||  |  ||| || |||||| |||| ||||| ||   ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||   || || ||||| | ||||||
Sbjct:      202 GAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTA-CTC--CGGTAA---TATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACGAT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGAT-T-TATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAA-TGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTG-AAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTTTCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AATTT-CC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTTACAAAAGATGCCATAAATTTACTGGAATTAGGTTAT---CCACCCATAATTTACCATGCA-T-CCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAATGATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAA---TGAAGATGAAAATATGGACTCTCCTTTCTCAAAACA-ATTTCTTCAAAATTGTAAAAATCTTGCTAGAATATCACAATTTATATATCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAGGATAGTTTATCAAAACAAAGAATTTCAGAATTGATAATTAATCATATTCC 1870


Match Name	Summary
XM_030629489.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.87 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030629488.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.70 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030629490.1	E-Value: 3.950e-150, PID: 98.60 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030645438.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.27 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA [more]
XM_030645439.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.76 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA [more]
XM_030644559.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 75.59 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR001633	EAL domain	PROSITE	PS50883	EAL	coord: 1..57 score: 8.906
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 40..40
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 17..39
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..16
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 17..39
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 40..60
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF74	TRICYCLENE SYNTHASE, CHLOROPLASTIC	coord: 6..558
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 6..558
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 66..66
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 45..65
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..44
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 46..65
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 12..30
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 31..46
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..11
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 13..35
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..31
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 50..63
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 32..49
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 27..49
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 18..542 e-value: 2.4E-188 score: 628.6
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 231..559
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 235..501 e-value: 2.0E-94 score: 315.9
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 18..181 e-value: 1.6E-48 score: 165.0
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 55..229 e-value: 2.4E-188 score: 628.6
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 16..230

TPS53

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, FN-clones109 (TMM50 minvalue)

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, PK-clones109 (TMM50 minvalue)

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATC CATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAG AACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATG CTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTT ACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTT TAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTAT AATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTA TGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAAT TCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAA GCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAAT TTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACATAATGATATCAGAGCAAAAGA AATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTG AATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGC TAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTT TGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCAT GAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGA GAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAG TTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACTGTCAAA TTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAAC ATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGG AAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTA CACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAAT CACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAT GTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTG GAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTAT TGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAAT GCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATA ATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGG TGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTG AAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAG GAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATT GATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAAC ATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCA TCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA
Sequence Length	1677
Sequence Checksum	e3e7007caad6481caa2aa83ecde55755

Sequence

GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATC
CATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAG
AACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGACGAAGATGTGAAAAGGATG
CTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTT
ACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTT
TAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTAT
AATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTA
TGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAAT
TCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATTGGAGTATTGGCCTTATATGAA
GCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAACATTTTAGAGGAAGCTAGAAT
TTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACATAATGATATCAGAGCAAAAGA
AATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTG
AATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGC
TAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTT
TGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCAT
GAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGA
GAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAG
TTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACTGTCAAA
TTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAAC
ATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGG
AAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAAATGCCTTATATTGTTTTA
CACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAAT
CACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAT
GTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTG
GAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTAT
TGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAAT
GCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATA
ATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACTGAAAAGAGG
TGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTG
AAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAG
GAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATT
GATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAAC
ATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCA
TCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA

Sequence Length

1677

Sequence Checksum

e3e7007caad6481caa2aa83ecde55755

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS53
Identifier	TPS53
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:29
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:29