TPS52 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: AGQN03003908.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003912F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 414/425 (97.41%), Postives = 414/425 (97.41%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct:     6456 AGAAATATTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGAGAAAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAAT---GATTATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGGT 6035

HSP 2 Score: 466.476 bits (252), Expect = 6.279e-129
Identity = 266/273 (97.44%), Postives = 266/273 (97.44%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:     7369 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGATACATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTACAACACCAACAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAG 7097

HSP 3 Score: 414.77 bits (224), Expect = 2.307e-113
Identity = 310/349 (88.83%), Postives = 310/349 (88.83%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT--T-ACTCT-CCAATG--T--TCTCTAA--ATCTA--A---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |   |    |||  |  |||| ||   ||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:     1850 GGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTACGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATGAGTCTAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 1502

HSP 4 Score: 414.77 bits (224), Expect = 2.307e-113
Identity = 246/257 (95.72%), Postives = 246/257 (95.72%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct:     2667 GTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACATGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGTCTTACAGATGATCTTGCAACTTCAACGG 2411

HSP 5 Score: 327.977 bits (177), Expect = 3.091e-87
Identity = 236/262 (90.08%), Postives = 236/262 (90.08%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAATAATAATAATA---CCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |  || ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:     8204 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGCTTGAATATTAATAATAATAATAACACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAA---CCATAATA-T--TAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCTACCAATAATAATAATAATATTAATAATATTATTTCTC-GA--AGATCAGCAAACTATCAACCTTCACTTTGGCATTTTGATTATGTACAATCACTTTCTAC-CCTTTCAAGG 7953

HSP 6 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.469e-70
Identity = 197/222 (88.74%), Postives = 197/222 (88.74%), Query Frame = 1

Query:      948 CAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                ||| |||||| ||| ||||  | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||
Sbjct:     5566 CAGCTGGTGGGAAAGCACTAATATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTTCAAAAGTTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTGCACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAACGCAGTTGAGAG 5345

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 715.774 bits (387), Expect = 0.000e+0
Identity = 420/434 (96.77%), Postives = 420/434 (96.77%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAAT-A--ATG---AT-A--ATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct:  1904583 AGAAATTTTTAGTACGTGGAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTGTACCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATGATTATGATTATGATTATGATTATGTTTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGACCTTAAATATGTTTTCAGGT 1904150

HSP 2 Score: 595.741 bits (322), Expect = 7.675e-168
Identity = 330/334 (98.80%), Postives = 330/334 (98.80%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1897195 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGTAAAATGCATGAAGATGGTGTATCTGAAGAAAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896862

HSP 3 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.258e-128
Identity = 255/257 (99.22%), Postives = 255/257 (99.22%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1898219 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1897963

HSP 4 Score: 392.61 bits (212), Expect = 1.081e-106
Identity = 212/212 (100.00%), Postives = 212/212 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      958 AAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1899961 AAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1899750

HSP 5 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.480e-65
Identity = 141/142 (99.30%), Postives = 141/142 (99.30%), Query Frame = 1

Query:     1168 AGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTT-GCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACG 1308
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1899018 AGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACG 1898877

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: AGQN03007638.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 007643F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 704.694 bits (381), Expect = 0.000e+0
Identity = 418/434 (96.31%), Postives = 418/434 (96.31%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGAT----A--ATG---ATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct:     1646 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATGTCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGCATTTTGGAAGAGACAAGACAAACAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATAATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGGT 2079

HSP 2 Score: 438.776 bits (237), Expect = 1.369e-120
Identity = 261/273 (95.60%), Postives = 261/273 (95.60%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:     1125 AGGATGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATCTCTTATCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAACATATATATAACAACAATAATGTGTACAACACCAATAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTACGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAG 1397

HSP 3 Score: 424.003 bits (229), Expect = 3.833e-116
Identity = 312/349 (89.40%), Postives = 312/349 (89.40%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT---------------TACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||               |||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:     5224 GGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTATGAAGACGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATAAGTC---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCATACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 5569

HSP 4 Score: 420.31 bits (227), Expect = 4.958e-115
Identity = 266/283 (93.99%), Postives = 266/283 (93.99%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAAT---GTGTATGC-----C--AATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||     |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    12157 AGGAAGGAGCATATGCAAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGATACATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTACAACACCAACAAAAATAATGTGTATGCAAATTCTGAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTACGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 12439

HSP 5 Score: 387.07 bits (209), Expect = 5.029e-105
Identity = 241/257 (93.77%), Postives = 241/257 (93.77%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |  ||||||||||
Sbjct:     4154 GTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGCTTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAATCAAGGAAGATACCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGACTTAAAGATGATATGGGAACTTCAACGG 4410

HSP 6 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.459e-75
Identity = 200/222 (90.09%), Postives = 200/222 (90.09%), Query Frame = 1

Query:      948 CAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                ||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||
Sbjct:     2617 CAGCTGGTGGGAAAGCACTGGTATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTACAAAAATTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATTACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2838

HSP 7 Score: 132.232 bits (71), Expect = 2.602e-28
Identity = 89/97 (91.75%), Postives = 89/97 (91.75%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                ||||||| ||||| || |  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    10000 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 10093

HSP 8 Score: 115.613 bits (62), Expect = 2.620e-23
Identity = 86/97 (88.66%), Postives = 86/97 (88.66%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      658 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCAATTTGATTATGTACAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 751

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: AGQN03001075.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 001075F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 704.694 bits (381), Expect = 0.000e+0
Identity = 418/434 (96.31%), Postives = 418/434 (96.31%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAAT---G---AT-A--ATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct:    27818 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTACCAATAATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGGCAAACAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATTATGTTTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGACCTTAAATATGTTTTCAGGT 28251

HSP 2 Score: 606.821 bits (328), Expect = 3.546e-171
Identity = 332/334 (99.40%), Postives = 332/334 (99.40%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    39033 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATGGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATAAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 39366

HSP 3 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.880e-137
Identity = 271/273 (99.27%), Postives = 271/273 (99.27%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    26391 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTCTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 26663

HSP 4 Score: 464.629 bits (251), Expect = 2.258e-128
Identity = 255/257 (99.22%), Postives = 255/257 (99.22%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    38011 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 38267

HSP 5 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.073e-111
Identity = 221/221 (100.00%), Postives = 221/221 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      949 AGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    29746 AGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 29966

HSP 6 Score: 305.817 bits (165), Expect = 1.449e-80
Identity = 217/241 (90.04%), Postives = 217/241 (90.04%), Query Frame = 1

Query:       19 ACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAATAATAATAATACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |  || ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:    25607 ACT-TAAGTAGTATTATTAGCTTGAA-AGTAATAATAATAATGCCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAA---ACCATAATAATTATAATATTATTCATAATAAAACTGTATTAATGTCTACCAATAATAATAATAATATTAATAATATTATTTCTC-GA--AGATCAGCAAACTATCAACCTTCACTTTGGCATTTTGATTATGTACAATCACTTTCTACCCCTTTCAAGG 25839

HSP 7 Score: 154.392 bits (83), Expect = 5.552e-35
Identity = 83/83 (100.00%), Postives = 83/83 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1226 CTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACG 1308
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    37266 CTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACG 37348

HSP 8 Score: 76.8329 bits (41), Expect = 1.236e-11
Identity = 41/41 (100.00%), Postives = 41/41 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1168 AGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATAT 1208
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:    30709 AGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATAT 30749


Match Name	Summary
AGQN03003908.1	E-Value: 6.279e-129, PID: 97.41 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003912F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 7.675e-168, PID: 96.77 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03007638.1	E-Value: 1.369e-120, PID: 96.31 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 007643F, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03001075.1	E-Value: 3.546e-171, PID: 96.31 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 001075F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table


Match Name	Summary
There are no matches against Genbank for this mRNA.

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 747.167 bits (404), Expect = 0.000e+0
Identity = 418/425 (98.35%), Postives = 418/425 (98.35%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct:  1327308 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATGTCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGCATTTTGGAAGAGACAAGACAAACAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGGT 1327732

HSP 2 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 414/425 (97.41%), Postives = 414/425 (97.41%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct:  1279548 AGAAATATTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGAGAAAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAA---AATAATAATAATGATTATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGGT 1279969

HSP 3 Score: 719.467 bits (389), Expect = 0.000e+0
Identity = 413/425 (97.18%), Postives = 413/425 (97.18%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct:  1313166 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTGTACCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGAGAAAAAACAAAAAAATACCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATTATGATTATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTGAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGGT 1313590

HSP 4 Score: 669.607 bits (362), Expect = 0.000e+0
Identity = 414/437 (94.74%), Postives = 414/437 (94.74%), Query Frame = 1

Query:      528 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATA------------ATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 952
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1337353 AGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTACCAATAATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGGCAAACAACAAAGAAATATCTTGAAGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACAAGACATGAACCCTACTCTACTTATGTTAGCTAAGCTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGT 1337789

HSP 5 Score: 612.361 bits (331), Expect = 7.488e-173
Identity = 333/334 (99.70%), Postives = 333/334 (99.70%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1341353 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATGGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1341686

HSP 6 Score: 466.476 bits (252), Expect = 6.169e-129
Identity = 266/273 (97.44%), Postives = 266/273 (97.44%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  1278638 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGATACATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTACAACACCAACAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAG 1278910

HSP 7 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.727e-124
Identity = 266/276 (96.38%), Postives = 266/276 (96.38%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATAT---ATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1335858 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAATATATATATAATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 1336133

HSP 8 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.235e-123
Identity = 252/257 (98.05%), Postives = 252/257 (98.05%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1340331 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCGAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCTAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGTTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1340587

HSP 9 Score: 414.77 bits (224), Expect = 2.266e-113
Identity = 246/257 (95.72%), Postives = 246/257 (95.72%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct:  1283346 GTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACATGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGTCTTACAGATGATCTTGCAACTTCAACGG 1283602

HSP 10 Score: 414.77 bits (224), Expect = 2.266e-113
Identity = 310/349 (88.83%), Postives = 310/349 (88.83%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT--TACT-CT-CCAATG--T--TCTCTAA--ATCTA--A---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |  |    |||  |  |||| ||   ||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  1284164 GGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTACGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATGAGTCTAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 1284512

HSP 11 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.054e-111
Identity = 312/352 (88.64%), Postives = 312/352 (88.64%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT------------------TACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||                  |||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct:  1318315 GGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATCCAATGCAAAATGTATGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGGTGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATAAGTC---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACTCAA 1318663

HSP 12 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.054e-111
Identity = 312/352 (88.64%), Postives = 312/352 (88.64%), Query Frame = 1

Query:     1563 GGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT------------------TACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||                  |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  1330870 GGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTATGAAGACGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATAAGTC---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAATCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCATACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 1331218

HSP 13 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.054e-111
Identity = 221/221 (100.00%), Postives = 221/221 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      949 AGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1338569 AGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1338789

HSP 14 Score: 392.61 bits (212), Expect = 1.062e-106
Identity = 242/257 (94.16%), Postives = 242/257 (94.16%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |  ||||||||||
Sbjct:  1317242 GTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGCTTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACAAGGAAAATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGACTTAAAGATGATATGGGAACTTCAACGG 1317498

HSP 15 Score: 381.53 bits (206), Expect = 2.299e-103
Identity = 240/257 (93.39%), Postives = 240/257 (93.39%), Query Frame = 1

Query:     1308 GTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGG 1564
                ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||| | |  ||||||||||
Sbjct:  1329794 GTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGCTTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAATCAAGGAAGATACCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCCATGATTTTACGACTTAAAGATGATATGGGAACTTCAACGG 1330050

HSP 16 Score: 368.604 bits (199), Expect = 1.790e-99
Identity = 245/266 (92.11%), Postives = 245/266 (92.11%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAG------TAATAATAATAATACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT-CAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct:  1309291 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAATAATAATAATAATAATAACTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGTATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAATAGTTCTCGA-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCAATTTGATTATGTACAATCACTTTCTTCTCCTTTCAAGG 1309555

HSP 17 Score: 342.75 bits (185), Expect = 1.085e-91
Identity = 238/262 (90.84%), Postives = 238/262 (90.84%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAATAATAATAAT---ACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |  || ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  1277798 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGCTTGAATATTAATAATAATAATAACACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAA---ACCATAATAATTATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCTACCAATAATAATAATAATATTAATAATATTATTTCTC-GA--AGATCAGCAAACTATCAACCTTCACTTTGGCATTTTGATTATGTACAATCACTTTCTACCCCTTTCAAGG 1278053

HSP 18 Score: 294.738 bits (159), Expect = 3.081e-77
Identity = 250/291 (85.91%), Postives = 250/291 (85.91%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAA------------CAATAATG-TG-TGC-AACACCAACAA-A--AATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||            |||||||  |  |   || |  || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  1323975 AGGATGGAGCATATGTCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAAGTAAGAGTGATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTATCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAACATATATATAAAAATAAAAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTACGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAG 1324265

HSP 19 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.433e-75
Identity = 200/222 (90.09%), Postives = 200/222 (90.09%), Query Frame = 1

Query:      948 CAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                ||| |||||| ||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||
Sbjct:  1314149 CAGCTGGTGGGAAAGCACTGATATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTTCAAAAGTTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1314370

HSP 20 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.433e-75
Identity = 200/222 (90.09%), Postives = 200/222 (90.09%), Query Frame = 1

Query:      948 CAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                ||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||
Sbjct:  1328269 CAGCTGGTGGGAAAGCACTGGTATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTACAAAAATTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATTACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGCAGTTGAGAG 1328490

HSP 21 Score: 283.658 bits (153), Expect = 6.668e-74
Identity = 248/291 (85.22%), Postives = 248/291 (85.22%), Query Frame = 1

Query:      257 AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAA------------CAACAATAAT-GT-GT-GCAACACCAA-CA-AA-AATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAG 529
                |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||  |  |   || |  ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  1309980 AGGATGAAGCATATGTCAAAAGAGTTGAGAAACTAAAGGAAGAAGTAAGAGTGATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATCAAATTAATGATATATTGAAAGATATATATAAAAATAAAAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTACGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAG 1310270

HSP 22 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.443e-70
Identity = 197/222 (88.74%), Postives = 197/222 (88.74%), Query Frame = 1

Query:      948 CAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAG 1169
                ||| |||||| ||| ||||  | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||
Sbjct:  1280438 CAGCTGGTGGGAAAGCACTAATATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTTCAAAAGTTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTGCACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAACGCAGTTGAGAG 1280659

HSP 23 Score: 261.498 bits (141), Expect = 3.124e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1168 AGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACG 1308
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1339525 AGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACG 1339665

HSP 24 Score: 132.232 bits (71), Expect = 2.556e-28
Identity = 89/97 (91.75%), Postives = 89/97 (91.75%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                ||||||| ||||| || |  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1334968 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 1335061

HSP 25 Score: 110.073 bits (59), Expect = 1.198e-21
Identity = 85/97 (87.63%), Postives = 85/97 (87.63%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGG 259
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct:  1323499 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCAATTTGATTATGTACAATCACTTTCTTCTCCTTTCAAGG 1323592

HSP 26 Score: 104.533 bits (56), Expect = 5.572e-20
Identity = 64/68 (94.12%), Postives = 64/68 (94.12%), Query Frame = 1

Query:     1649 ATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT 1716
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||
Sbjct:  1345529 ATATTAACTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTATATAAATTTGAATGATGAT 1345596

HSP 27 Score: 52.8265 bits (28), Expect = 2.047e-4
Identity = 28/28 (100.00%), Postives = 28/28 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1760 CTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGG 1787
                ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  1345607 CTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGG 1345634


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 7.488e-173, PID: 98.35 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030645710.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 2953.91 bits (1599), Expect = 0.000e+0
Identity = 1702/1749 (97.31%), Postives = 1702/1749 (97.31%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAA--GATATAT-ATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATA------------ATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAATATATATATAATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTACCAATAATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGGCAAACAACAAAGAAATATCTTGAAGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACAAGACATGAACCCTACTCTACTTATGTTAGCTAAGCTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCGAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCTAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGTTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATGGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1873

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030645713.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X4, mRNA

HSP 1 Score: 2881.89 bits (1560), Expect = 0.000e+0
Identity = 1663/1710 (97.25%), Postives = 1663/1710 (97.25%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAA--GATATAT-ATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATA------------ATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCAT 1857
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAATATATATATAATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTACCAATAATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGGCAAACAACAAAGAAATATCTTGAAGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACAAGACATGAACCCTACTCTACTTATGTTAGCTAAGCTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCGAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCTAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGTTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATGGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCAT 1834

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030645712.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 2881.89 bits (1560), Expect = 0.000e+0
Identity = 1663/1710 (97.25%), Postives = 1663/1710 (97.25%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAA--GATATAT-ATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATA------------ATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCAT 1857
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAATATATATATAATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTACCAATAATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGGCAAACAACAAAGAAATATCTTGAAGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACAAGACATGAACCCTACTCTACTTATGTTAGCTAAGCTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCGAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCTAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGTTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATGGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCAT 1834

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030645711.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 2881.89 bits (1560), Expect = 0.000e+0
Identity = 1663/1710 (97.25%), Postives = 1663/1710 (97.25%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAA--GATATAT-ATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATA------------ATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCAT 1857
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      128 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAATATATATATAATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTACCAATAATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGGCAAACAACAAAGAAATATCTTGAAGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATTATGATTATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACAAGACATGAACCCTACTCTACTTATGTTAGCTAAGCTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCGAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCTAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGTTTTGATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATGGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCAT 1834

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030644589.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115715915), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 2643.68 bits (1431), Expect = 0.000e+0
Identity = 1703/1832 (92.96%), Postives = 1703/1832 (92.96%), Query Frame = 1

Query:       83 CATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGA-AA-AA-GCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT--TACTC-TCCA-ATGT-T-CTCTA-AAT---CTA--A---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |  || | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||  | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |  |    |||  | ||||  |||   |||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:        1 CATGTTTAAGTTCAA---ACCATAATAATTATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCTACCAATAATAATAATAATATTAATAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCTTCACTTTGGCATTTTGATTATGTACAATCACTTTCTACCCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGATACATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTACAACACCAACAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAGAAATATTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGAGAAAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATGAT--T-ATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGCTGGTGGGAAAGCACTAATATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTTCAAAAGTTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTGCACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAACGCAGTTGAGAGATGGGATATTAGTGCTATGGATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGACATGTTTTCTTGCTTTATACAATTTCATAAATGATCTTCCATTTGATGTGTTAAAAGGGGAAGAAGGCCTCCATGTAATAAAATTCCTTCAGAAATCGTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACATGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGTCTTACAGATGATCTTGCAACTTCAACGGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTACGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATGAGTCTAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 1823

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030644482.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10 (LOC115715811), mRNA

HSP 1 Score: 2593.82 bits (1404), Expect = 0.000e+0
Identity = 1771/1942 (91.19%), Postives = 1771/1942 (91.19%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAG------TAATAATAATAATACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA-ATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAA------------CAACAATAAT-GT-GT-GCAACACCAA-CA-AA-AATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGA-AA-AA-GCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT------------------TACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||  |  |   || |  ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||                  |||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct:      113 ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAATAATAATAATAATAATAACTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATTACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGTATTAATGTCCACCAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAATAGTTCTCGA-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCAATTTGATTATGTACAATCACTTTCTTCTCCTTTCAAGGATGAAGCATATGTCAAAAGAGTTGAGAAACTAAAGGAAGAAGTAAGAGTGATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTACCACTTTGAGGATCAAATTAATGATATATTGAAAGATATATATAAAAATAAAAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTACGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTGTACCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGAGAAAAAACAAAAAAATACCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATTATGATTATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTGAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGCTGGTGGGAAAGCACTGATATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTTCAAAAGTTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATATTAGTGCTATGGATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGACATGTTTTCTTGCTTTATACAATTTCATAAATGATCTTCCATTTGATGTGTTAAAAGGAGAAGAAGGCCTCCATATAATAAAATTCCTTCAGAAATCGTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGCTTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACAAGGAAAATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGACTTAAAGATGATATGGGAACTTCAACGGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATCCAATGCAAAATGTATGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGGTGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATAAGTC---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACTCAA 2050

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030644590.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115715915), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 2436.85 bits (1319), Expect = 0.000e+0
Identity = 1609/1744 (92.26%), Postives = 1609/1744 (92.26%), Query Frame = 1

Query:      190 AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCA-------------------AGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGA-AA-AA-GCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT--TACTC-TCCA-ATGT-T-CTCTA-AAT---CTA--A---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||  | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |  |    |||  | ||||  |||   |||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:        4 AGATCAGCAAACTATCAACCTTCACTTTGGCATTTTGATTATGTACAATCACTTTCTACCCCTTTCAAGATATGTGTTTGTGTGGTAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTTATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGATACATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTGTACAACACCAACAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAGAAATATTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGAGAAAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATGAT--T-ATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAACTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGCTGGTGGGAAAGCACTAATATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTTCAAAAGTTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTGCACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAACGCAGTTGAGAGATGGGATATTAGTGCTATGGATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGACATGTTTTCTTGCTTTATACAATTTCATAAATGATCTTCCATTTGATGTGTTAAAAGGGGAAGAAGGCCTCCATGTAATAAAATTCCTTCAGAAATCGTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAAACATGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCGATGATTTTACGTCTTACAGATGATCTTGCAACTTCAACGGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTACGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATGAGTCTAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGGCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 1744

[Close]

BLAST of TPS52 vs. Genbank
Match Name: XM_030645709.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10 (LOC115716805), mRNA

HSP 1 Score: 2362.99 bits (1279), Expect = 0.000e+0
Identity = 1616/1773 (91.14%), Postives = 1616/1773 (91.14%), Query Frame = 1

Query:      163 AATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTCCTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAGGTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTGAGAATGAAATTAATGACATATTGAAA----GATAT----AT----ATAACAACAATAAT-GT-GT-GCAACACCAA-CA-AA-AATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTAAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTTGGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAGGTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATAGAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACACTACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAATAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTTTGCATTTGATGTGTTAAAAGGA-AA-AA-GCCTCCATGTAAAAAAATACCTTCAAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATACCCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCTCGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTCAATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACATATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCATAAATTTGGATGATGAT------------------TACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA 1896
                ||||||| ||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||     ||||    ||    |||| |||||||||  |  |   || |  ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||                  |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:      148 AATAATAGTAATATTATTTCTC-G-A-AGATCAGCAAACTATCAACCCCCACTTTGGCAATTTGATTATGTACAATCACTTTCTTCTCCTTTCAAGGATGGAGCATATGTCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAGGAAGAAGTAAGAGTGATGGTGAAGAGAGCAAGAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCAACTTGAGCTAATTGATGTATTGCAAAGACTTGGAATTTCTTATCACTTTGAGGATGAAATTAATGATATATTGAAACATATATATAAAAATAAAAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCTACGACAACATGGTTATCCGGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAGATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATGTCAAAGGAATGTTATCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGCATTTTGGAAGAGACAAGACAAACAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCATGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAATGATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACTTCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATGAGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGATTTCAACATTGTCCAATCAATATACCAAGATGATCTTAAACATGTCTTCAGCTGGTGGGAAAGCACTGGTATGGGAAAGAAGTTGGAATTTGCAAGAGATAGAACAATGGTGAATTTCTTATGGACAGTAGGAGTTGCATTTGAGCCACATTACAAAAATTTTAGAAGAATGATTACAAAAGTAAATGCTTTAATTACAGTAATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTAGATGAATTGGAGCTCTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATATTAGTGCTATGGATGGGCTCCCTGAGTATATGAAGACATGTTTTCTTGCTTTATACAATTTCATAAATGATCTTCCATTTGATGTGTTAAAAGGAGAAGAAGGCCTCCATATAATAAAATTCCTTCAGAAATCGTGGGCAGATCTTTGCAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGGTATTATAATGGATACACACCAAGCTTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATGGATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAGTGAATCCAATCAAGGAAGATACCTTATTAAGTACTTGCTTTGATGGATACCCTACCATAATACGACATTCATCCATGATTTTACGACTTAAAGATGATATGGGAACTTCAACGGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCCAAATCAATCCAATGCAAAATGTATGAAGACGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAGCTTATTAATAAAGATTACATAAATTTGGATGATGATGATGATGATGGTGATGACTACTCTCCAATGTTCTATAAGTC---TAATAATATTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAATCTTGGTAGAATGTCACATTGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCATACAAAAGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCCTCTTACCCAA 1914


Match Name	Summary
XM_030645710.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.31 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030645713.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.25 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X4, mRNA [more]
XM_030645712.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.25 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030645711.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.25 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115716806), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030644589.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 92.96 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115715915), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030644482.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 91.19 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10 (LOC115715811), mRNA [more]
XM_030644590.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 92.26 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10-like (LOC115715915), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030645709.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 91.14 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10 (LOC115716805), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 7..29
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 30..46
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 1..6
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 7..29
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..21
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 22..40
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 41..41
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 13..35
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 91..111
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 45..629
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF74	TRICYCLENE SYNTHASE, CHLOROPLASTIC	coord: 45..629
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 50..51
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 1..27
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 28..49
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 28..50
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 294..560 e-value: 1.8E-97 score: 325.9
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 78..233 e-value: 4.7E-46 score: 156.9
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 304..631 e-value: 9.0E-126 score: 421.0
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 289..628
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 73..303 e-value: 6.0E-71 score: 240.4
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 69..286

TPS52

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAA TAATAATAATACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATT ACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACC AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAA CTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTC CTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAG GTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCA ACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTG AGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTG TGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCT AAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAG ATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTA TCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTT GGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCA TGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAAT GATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACT TCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATG AGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGAT TTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAG GTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATA GAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACAC TACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAAT AATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCT TCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCT GAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTT TGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTC AAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGG TATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATG GATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAG TAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATAC CCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCT CGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTC AATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACAT ATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCAT AAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATA TTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACAT TGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAA AGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA
Sequence Length	1896
Sequence Checksum	6765e873bda85a6ce7f60233545e9434

Sequence

ATGGCTGCATTAGTGTCCACTGTAAGTAGTATTATTAGGTGGAATAGTAA
TAATAATAATACCTTCACTAGATCTGTGAAATCATGTTTAAGTTCAAATT
ACCATAATAATAATAATATTATTCATAATAAAACTGCATTAATGTCCACC
AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCAGAAGAGATCAGCAAA
CTATCAACCCCCACTTTGGCATTTTGACTATGTTCAATCACTTTCTACTC
CTTTCAAGGAAGGAGCATATGCCAAAAGAGTTGAGAAAGTAAAAGAAGAG
GTAAGAGTAATGGTGAAGAGAGCAAAAGAGGAGGAGAAGCCTTTATCTCA
ACTTGAGCTAATTGATGTAATGCAAAGACTTGGAATCTCTTACCACTTTG
AGAATGAAATTAATGACATATTGAAAGATATATATAACAACAATAATGTG
TGCAACACCAACAAAAATGTGTATGCCAATTCTCTTGAATTTAGACTCCT
AAGACAACATGGTTATCCAGTGTCTCAAGAAATTTTTAGTACGTGCAAAG
ATGAAAGAGGCAATTTTATGGTGTCTTCCAATGATATCAAAGGAATGTTA
TCTTTATATGAAGCTTCATTCTATTTGGTAGAAAATGAAGATGGTATTTT
GGAAGAGACAAGACACAAAACAAAGAAATATCTTGAGGAATACATAATCA
TGATCATGGAAAAACAACAATCATTATTAGATCAAAATAATAATAATAAT
GATAATGATTATGATTATGAACTAGTGAGCCATGCATTGGAGCTTCCACT
TCATTGGAGAATGTTAAGATTGGAGAGTAGGTGGTTTATTGATGTGTATG
AGAAGAGACTAGACATGAACCCTACTCTACTTACCTTAGCTAAACTAGAT
TTCAACATTGTCCAATCAACATACCAAGATGATCTTAAATATGTTTTCAG
GTGGTGGAAAAACACTGGTTTGGGAGAAAAGTTGAAATTTGCAAGAGATA
GAATGATGGTGAATTTTTTATGGACAATAGGAGTTTCATTTGAGCCACAC
TACAAAAGTTTAAGAAGAATGGCTACAAAAGTAAATGCTTTAATAACAAT
AATAGATGACATATATGATGTTTATGGTACACTTGATGAATTGGAGCTCT
TCACTAATGTGGTTGAGAGATGGGATGTTAGTGCTATGAATGGGCTCCCT
GAGTATATGAAGTCATGTTTCCTTGCTTTGCACAATTTTATAAATGACTT
TGCATTTGATGTGTTAAAAGGAAAAAGCCTCCATGTAAAAAAATACCTTC
AAAAAACGTGGGCAGATCTTTGTAAATCTTATTTAAGAGAAGCAAGATGG
TATTATGATGGATACACACCAAGATTTGAAGAGTACATTGAGAATGCATG
GATATCAATATCAGGACCTGTTATACTATCACATTTATACTTTTTTGTAG
TAAATCCAAACGAGGAAGATGCCTTATTAAGTACTTGCTTTAATGGATAC
CCTACCATAATACGCCATTCGTCGATGATTTTACGACTTACAAATGATCT
CGCCACTTCAACGGATGAGTTGAAAAGAGGTGATGTTCCCAAATCAATTC
AATGCAAAATGCATGAAGATCGTGTATGTGAAGAGAAAGCTCGTCAACAT
ATTAAGTTATTAATAAATGAAACATGGAAGTTTCTTAATAAAGATTGCAT
AAATTTGGATGATGATTACTCTCCAATGTTCTCTAAATCTAATAATAATA
TTAATAAGGCTTTCATTGAAATGTGTTTAAACCTTGGTAGAATGTCACAT
TGCATTTATCAATATGGAGATGGACATGGAATTCAAGATCGCCAAACAAA
AGATCATGTACTATCATTACTTATTCACCCTATTCTTCTTACCCAA

Sequence Length

1896

Sequence Checksum

6765e873bda85a6ce7f60233545e9434

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS52
Identifier	TPS52
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:53
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:53