TPS51 | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 529.262 bits (286), Expect = 6.986e-148
Identity = 377/421 (89.55%), Postives = 377/421 (89.55%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTG 779
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Sbjct:    17986 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAA-GAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGATGATCTAAAACATATATTCAGGTG 18405

HSP 2 Score: 374.144 bits (202), Expect = 3.464e-101
Identity = 221/230 (96.09%), Postives = 221/230 (96.09%), Query Frame = 1

Query:      767 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:    18496 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 3 Score: 344.597 bits (186), Expect = 2.716e-92
Identity = 258/291 (88.66%), Postives = 258/291 (88.66%), Query Frame = 1

Query:     1390 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1680
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Sbjct:    36729 GAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTA 37007

HSP 4 Score: 326.131 bits (176), Expect = 9.838e-87
Identity = 209/225 (92.89%), Postives = 209/225 (92.89%), Query Frame = 1

Query:      771 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:    27968 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191

HSP 5 Score: 307.664 bits (166), Expect = 3.563e-81
Identity = 250/288 (86.81%), Postives = 250/288 (86.81%), Query Frame = 1

Query:     1390 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1677
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Sbjct:    20675 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAA-GTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAA-AAA-AATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 20947

HSP 6 Score: 305.817 bits (165), Expect = 1.282e-80
Identity = 237/270 (87.78%), Postives = 237/270 (87.78%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
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Sbjct:    26374 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAAT---AAT---------CCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 26631

HSP 7 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.300e-70
Identity = 234/274 (85.40%), Postives = 234/274 (85.40%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT----ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
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Sbjct:    15859 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTAAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTG-AAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATTAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 16122

HSP 8 Score: 263.345 bits (142), Expect = 7.823e-68
Identity = 231/270 (85.56%), Postives = 231/270 (85.56%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT-C--ATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1385
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Sbjct:    19805 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 20074

HSP 9 Score: 252.265 bits (136), Expect = 1.693e-64
Identity = 229/270 (84.81%), Postives = 229/270 (84.81%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT---CA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1385
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Sbjct:    36053 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTTGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAACAACATCATC 36322

HSP 10 Score: 206.098 bits (111), Expect = 1.337e-50
Identity = 133/144 (92.36%), Postives = 133/144 (92.36%), Query Frame = 1

Query:      994 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1137
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Sbjct:    19312 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 19455

[Close]

BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 523.722 bits (283), Expect = 3.250e-146
Identity = 376/421 (89.31%), Postives = 376/421 (89.31%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTG 779
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Sbjct:  2519050 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAA-GAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2519469

HSP 2 Score: 374.144 bits (202), Expect = 3.464e-101
Identity = 221/230 (96.09%), Postives = 221/230 (96.09%), Query Frame = 1

Query:      767 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:  2519559 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 3 Score: 326.131 bits (176), Expect = 9.838e-87
Identity = 209/225 (92.89%), Postives = 209/225 (92.89%), Query Frame = 1

Query:      771 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:  2529109 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

HSP 4 Score: 311.357 bits (168), Expect = 2.755e-82
Identity = 250/288 (86.81%), Postives = 250/288 (86.81%), Query Frame = 1

Query:     1390 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1677
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Sbjct:  2521803 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 2522078

HSP 5 Score: 309.511 bits (167), Expect = 9.908e-82
Identity = 238/270 (88.15%), Postives = 238/270 (88.15%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
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Sbjct:  2527515 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATAT--CAATATTAAT---AAT---------CCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2527770

HSP 6 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.291e-75
Identity = 236/273 (86.45%), Postives = 236/273 (86.45%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
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Sbjct:  2516928 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2517191

HSP 7 Score: 263.345 bits (142), Expect = 7.823e-68
Identity = 231/270 (85.56%), Postives = 231/270 (85.56%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT-C--ATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1385
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Sbjct:  2520934 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACC-GTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2521202

HSP 8 Score: 252.265 bits (136), Expect = 1.693e-64
Identity = 229/270 (84.81%), Postives = 229/270 (84.81%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT---CA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1385
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Sbjct:  2530193 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACAATGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2530462

HSP 9 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.718e-51
Identity = 134/145 (92.41%), Postives = 134/145 (92.41%), Query Frame = 1

Query:      994 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGT 1138
                ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||
Sbjct:  2520436 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 2520580

HSP 10 Score: 165.472 bits (89), Expect = 2.270e-38
Identity = 177/221 (80.09%), Postives = 177/221 (80.09%), Query Frame = 1

Query:      775 AGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:  3143570 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790


Match Name	Summary
AGQN03003403.1	E-Value: 6.986e-148, PID: 89.55 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 3.250e-146, PID: 89.31 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
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BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-70835_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 303.971 bits (164), Expect = 6.079e-81
Identity = 225/255 (88.24%), Postives = 225/255 (88.24%), Query Frame = 1

Query:      415 AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGA 668
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Sbjct:        7 AGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAA-GAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGA 260


Match Name	Summary
PKGMv1-70835_t	E-Value: 6.079e-81, PID: 88.24 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 730.547 bits (395), Expect = 0.000e+0
Identity = 409/416 (98.32%), Postives = 409/416 (98.32%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGT 778
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Sbjct:   197143 AGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGT 196728

HSP 2 Score: 521.875 bits (282), Expect = 1.149e-145
Identity = 289/292 (98.97%), Postives = 289/292 (98.97%), Query Frame = 1

Query:     1390 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAA-TATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1680
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Sbjct:   192998 GAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 192708

HSP 3 Score: 499.716 bits (270), Expect = 5.382e-139
Identity = 270/270 (100.00%), Postives = 270/270 (100.00%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   197696 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 197427

HSP 4 Score: 418.463 bits (226), Expect = 1.550e-114
Identity = 248/258 (96.12%), Postives = 248/258 (96.12%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT---CATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTG-AAG 1390
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Sbjct:   193681 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGTAAG 193424

HSP 5 Score: 414.77 bits (224), Expect = 2.005e-113
Identity = 231/234 (98.72%), Postives = 231/234 (98.72%), Query Frame = 1

Query:      763 AAACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:   196618 AAATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385

HSP 6 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.764e-67
Identity = 143/144 (99.31%), Postives = 143/144 (99.31%), Query Frame = 1

Query:      994 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1137
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   195279 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 195136

HSP 7 Score: 174.705 bits (94), Expect = 3.705e-41
Identity = 96/97 (98.97%), Postives = 96/97 (98.97%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCATTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGG 97
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:   198432 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGG 198336

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BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 529.262 bits (286), Expect = 6.864e-148
Identity = 377/421 (89.55%), Postives = 377/421 (89.55%), Query Frame = 1

Query:      363 AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTG 779
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Sbjct:  2020238 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAA-GAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2020657

HSP 2 Score: 363.064 bits (196), Expect = 7.367e-98
Identity = 219/230 (95.22%), Postives = 219/230 (95.22%), Query Frame = 1

Query:      767 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:  2020747 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

HSP 3 Score: 326.131 bits (176), Expect = 9.665e-87
Identity = 209/225 (92.89%), Postives = 209/225 (92.89%), Query Frame = 1

Query:      771 ATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:  2035138 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 4 Score: 316.897 bits (171), Expect = 5.817e-84
Identity = 239/270 (88.52%), Postives = 239/270 (88.52%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
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Sbjct:  2029273 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTT----GAACAA-A----AA-AT--ATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2029530

HSP 5 Score: 311.357 bits (168), Expect = 2.706e-82
Identity = 250/288 (86.81%), Postives = 250/288 (86.81%), Query Frame = 1

Query:     1390 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1677
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Sbjct:  2022994 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TG-A--TG-T--TGGA-T--TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 2023269

HSP 6 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.268e-75
Identity = 236/273 (86.45%), Postives = 236/273 (86.45%), Query Frame = 1

Query:       95 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 364
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Sbjct:  2018107 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATAT----G--A-TC--AATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2018370

HSP 7 Score: 263.345 bits (142), Expect = 7.686e-68
Identity = 231/270 (85.56%), Postives = 231/270 (85.56%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT-C--ATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1385
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Sbjct:  2022123 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2022392

HSP 8 Score: 257.805 bits (139), Expect = 3.576e-66
Identity = 230/270 (85.19%), Postives = 230/270 (85.19%), Query Frame = 1

Query:     1137 GTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT---CA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1385
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Sbjct:  2036267 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 2036536

HSP 9 Score: 206.098 bits (111), Expect = 1.314e-50
Identity = 133/144 (92.36%), Postives = 133/144 (92.36%), Query Frame = 1

Query:      994 AGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1137
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Sbjct:  2021626 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2021769

HSP 10 Score: 165.472 bits (89), Expect = 2.230e-38
Identity = 177/221 (80.09%), Postives = 177/221 (80.09%), Query Frame = 1

Query:      775 AGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 995
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Sbjct:  2396996 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776


Match Name	Summary
NW_022060378.1	E-Value: 1.149e-145, PID: 98.32 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044374.1	E-Value: 6.864e-148, PID: 89.55 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 2983.46 bits (1615), Expect = 0.000e+0
Identity = 1662/1684 (98.69%), Postives = 1662/1684 (98.69%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCATTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTT---TCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAAGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1680
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Sbjct:       96 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1778

[Close]

BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 2970.53 bits (1608), Expect = 0.000e+0
Identity = 1662/1687 (98.52%), Postives = 1662/1687 (98.52%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCATTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCA---AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTT---TCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAAGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1680
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Sbjct:       98 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAATAATAATAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1783

[Close]

BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 2036.13 bits (1102), Expect = 0.000e+0
Identity = 1128/1140 (98.95%), Postives = 1128/1140 (98.95%), Query Frame = 1

Query:        1 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCATTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCA---AGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1137
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Sbjct:      102 GATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1241

HSP 2 Score: 521.875 bits (282), Expect = 8.567e-147
Identity = 289/292 (98.97%), Postives = 289/292 (98.97%), Query Frame = 1

Query:     1390 GAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1680
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Sbjct:     1245 GAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1535

[Close]

BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 2021.36 bits (1094), Expect = 0.000e+0
Identity = 1509/1704 (88.56%), Postives = 1509/1704 (88.56%), Query Frame = 1

Query:        2 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCATTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATT---ATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACAT-A--AGTGGTGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAA-TTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT-C--ATTCAAAT-A-A-T-A-A-------------TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAAGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCC 1677
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Sbjct:      191 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATAT------ATTAA---TATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAA-GAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCC 1872

[Close]

BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 1965.96 bits (1064), Expect = 0.000e+0
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Query:        2 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCATTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGAGACTTTTAATTATTTTAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGG---TGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAAGAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACGATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCATCGATACGTATAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACACATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATCTGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTATTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTTCTTATTGTGCATGCTTATTTT---CA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTGCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAAGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATACATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTA 1680
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[Close]

BLAST of TPS51 vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 795.18 bits (430), Expect = 0.000e+0
Identity = 1169/1525 (76.66%), Postives = 1169/1525 (76.66%), Query Frame = 1

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Match Name	Summary
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XM_030629488.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.52 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030629490.1	E-Value: 8.567e-147, PID: 98.95 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030645438.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.56 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA [more]
XM_030645439.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.02 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA [more]
XM_030644559.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 76.66 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
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None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 30..48
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None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 12..30
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None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 7..29
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IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 236..502 e-value: 1.9E-96 score: 322.5
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 18..543 e-value: 7.1E-190 score: 633.7
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 231..558
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TPS51

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, FN-clones109 (TMM50 minvalue)

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, PK-clones109 (TMM50 minvalue)

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

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Sequence Checksum	9f8cd609b1abadef7a52db292830f42b

Sequence

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Sequence Length

1680

Sequence Checksum

9f8cd609b1abadef7a52db292830f42b

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS51
Identifier	TPS51
Time Accessioned	Saturday, April 20, 2024 - 10:16
Time Last Modified	Saturday, April 20, 2024 - 10:16