TPS44 | ICGRC

Annotations

Contact

Cross Reference

Location on Map

Properties

Relationship

Publication

Sequences

Summary

Annotations

This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf

Click a tab below to view blast alignments.

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: CM010792.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 623.441 bits (337), Expect = 2.934e-176
Identity = 368/382 (96.34%), Postives = 368/382 (96.34%), Query Frame = 1

Query:      280 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT 661
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct:  8583774 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATTCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCA--AACTACCTTCTCACGA---GCTT-TTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 8583399

HSP 2 Score: 595.741 bits (322), Expect = 6.396e-168
Identity = 365/386 (94.56%), Postives = 365/386 (94.56%), Query Frame = 1

Query:      280 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT-GGT 664
                |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct:  8269935 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCTCAATTGAGCTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTTGGT 8270320

HSP 3 Score: 520.029 bits (281), Expect = 3.960e-145
Identity = 287/290 (98.97%), Postives = 287/290 (98.97%), Query Frame = 1

Query:     1295 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8272318 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 8272607

HSP 4 Score: 508.949 bits (275), Expect = 8.572e-142
Identity = 285/290 (98.28%), Postives = 285/290 (98.28%), Query Frame = 1

Query:     1295 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8580335 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 8580046

HSP 5 Score: 494.176 bits (267), Expect = 2.400e-137
Identity = 276/280 (98.57%), Postives = 276/280 (98.57%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 280
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8584387 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGA-GAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAACAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 8584109

HSP 6 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.196e-134
Identity = 339/378 (89.68%), Postives = 339/378 (89.68%), Query Frame = 1

Query:      284 TATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT 661
                |||||| ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||
Sbjct:   791680 TATTCGACAAGTACAAGAATGAAAAAGGAAAATTTAAAGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTGCACAAATGAGAGTTCATGGAGAGAAAATACTAGACGAAGCACTTATCTTTACAACTACTCATCTTGAATCCTCAGTTAAAACATGTCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTATCATCAACTACCTTCTCATGAGGAGATTCTTTTAACACTTGCTAAATTAGATTTCAACTTGCTTCAAAAACTACATCAAAAGGAACTAAGTTACATAACGAGGT 792057

HSP 7 Score: 462.783 bits (250), Expect = 6.769e-128
Identity = 254/256 (99.22%), Postives = 254/256 (99.22%), Query Frame = 1

Query:     1041 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1296
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8581980 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAAATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 8581725

HSP 8 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.465e-124
Identity = 252/256 (98.44%), Postives = 252/256 (98.44%), Query Frame = 1

Query:     1041 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1296
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8271751 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 8272006

HSP 9 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.476e-119
Identity = 270/286 (94.41%), Postives = 270/286 (94.41%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTC---ATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 280
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||
Sbjct:  8269325 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGCTATTTTATAGCATGTG 8269610

HSP 10 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.476e-119
Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 250/256 (97.66%), Query Frame = 1

Query:      658 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-----GTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAA 908
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct:  8270937 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATAAAAACATATGAA 8271192

HSP 11 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.476e-119
Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 250/256 (97.66%), Query Frame = 1

Query:      658 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-----GTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAA 908
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct:  8582769 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATAAAAACATATGAA 8582514

HSP 12 Score: 392.61 bits (212), Expect = 9.007e-107
Identity = 263/286 (91.96%), Postives = 263/286 (91.96%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAA-CAA--TCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 280
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||  |||  ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct:   790490 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATCTA-ATT--GATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 790772

HSP 13 Score: 241.185 bits (130), Expect = 3.453e-61
Identity = 132/133 (99.25%), Postives = 132/133 (99.25%), Query Frame = 1

Query:      909 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 1041
                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  8582227 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 8582095

HSP 14 Score: 191.325 bits (103), Expect = 3.527e-46
Identity = 123/133 (92.48%), Postives = 123/133 (92.48%), Query Frame = 1

Query:      909 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 1041
                ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct:  8271506 GTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 8271638

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: AGQN03009317.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 009322F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 514.489 bits (278), Expect = 1.842e-143
Identity = 286/290 (98.62%), Postives = 286/290 (98.62%), Query Frame = 1

Query:     1295 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5748 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 6037

HSP 2 Score: 457.243 bits (247), Expect = 3.149e-126
Identity = 253/256 (98.83%), Postives = 253/256 (98.83%), Query Frame = 1

Query:     1041 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1296
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     5200 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 5455

HSP 3 Score: 429.543 bits (232), Expect = 6.865e-118
Identity = 249/256 (97.27%), Postives = 249/256 (97.27%), Query Frame = 1

Query:      658 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-----GTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAA 908
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct:     4414 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATC-TTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATAAAAACATATGAA 4668

HSP 4 Score: 207.945 bits (112), Expect = 3.502e-51
Identity = 133/143 (93.01%), Postives = 133/143 (93.01%), Query Frame = 1

Query:      523 CAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT-GGT 664
                ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct:     3655 CAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTTGGT 3797

HSP 5 Score: 185.785 bits (100), Expect = 1.641e-44
Identity = 122/133 (91.73%), Postives = 122/133 (91.73%), Query Frame = 1

Query:      909 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 1041
                ||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct:     4952 GTGGGATATTTTTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 5084

HSP 6 Score: 65.753 bits (35), Expect = 2.230e-8
Identity = 35/35 (100.00%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1550 TCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:        1 TCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 35


Match Name	Summary
CM010792.2	E-Value: 2.934e-176, PID: 96.34 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 2, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03009317.1	E-Value: 1.842e-143, PID: 98.62 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 009322F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-63016_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1038.94 bits (562), Expect = 0.000e+0
Identity = 713/775 (92.00%), Postives = 713/775 (92.00%), Query Frame = 1

Query:       96 GACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA 870
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:       72 GACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAACAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAA------------------GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTA--------------------CTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCA--AACTACCTTCTCACGA---GCTT-TTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACG----------AGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA 792

HSP 2 Score: 490.482 bits (265), Expect = 4.095e-137
Identity = 275/280 (98.21%), Postives = 275/280 (98.21%), Query Frame = 1

Query:     1305 AAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      804 AAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1083

HSP 3 Score: 111.919 bits (60), Expect = 3.725e-23
Identity = 65/67 (97.01%), Postives = 65/67 (97.01%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATG 67
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
Sbjct:        7 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAG-AAATTACTTCATG 72

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-22562_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 604.975 bits (327), Expect = 1.402e-171
Identity = 475/536 (88.62%), Postives = 475/536 (88.62%), Query Frame = 1

Query:      335 GTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA 870
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     | | || | | |    | |     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||      | |    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      377 GTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTACT-----C-T-CC-A-T-A----T-C-----TAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCAC-TT---------TA------C-C----AGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACG----------AGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA 861

HSP 2 Score: 431.39 bits (233), Expect = 2.518e-119
Identity = 239/242 (98.76%), Postives = 239/242 (98.76%), Query Frame = 1

Query:     1343 AGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1136 AGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1377

HSP 3 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.553e-109
Identity = 240/251 (95.62%), Postives = 240/251 (95.62%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTC---ATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCG 245
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      127 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCG 377

HSP 4 Score: 261.498 bits (141), Expect = 3.495e-68
Identity = 147/150 (98.00%), Postives = 147/150 (98.00%), Query Frame = 1

Query:     1042 TTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTT 1191
                |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct:      919 TTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTT 1068

HSP 5 Score: 130.386 bits (70), Expect = 1.028e-28
Identity = 70/70 (100.00%), Postives = 70/70 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1228 CCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGT 1297
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:     1069 CCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGT 1138

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-12839_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 366.757 bits (198), Expect = 7.201e-100
Identity = 247/269 (91.82%), Postives = 247/269 (91.82%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAA-CAA--TCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGG 263
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||  |||  ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:       10 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATCTA-ATT--GATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGG 275


Match Name	Summary
PKGMv1-63016_t	E-Value: 4.095e-137, PID: 92.00 Description: No definition line [more]
PKGMv1-22562_t	E-Value: 1.402e-171, PID: 88.62 Description: No definition line [more]
PKGMv1-12839_t	E-Value: 7.201e-100, PID: 91.82 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: NC_044377.1
Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 673.301 bits (364), Expect = 0.000e+0
Identity = 376/382 (98.43%), Postives = 376/382 (98.43%), Query Frame = 1

Query:      280 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT 661
                |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 69217682 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATTCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGT 69217301

HSP 2 Score: 590.202 bits (319), Expect = 2.924e-166
Identity = 364/386 (94.30%), Postives = 364/386 (94.30%), Query Frame = 1

Query:      280 GAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT-GGT 664
                |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct: 69295517 GAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCTCAATTGAGCTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATTACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTTGGT 69295132

HSP 3 Score: 525.569 bits (284), Expect = 8.362e-147
Identity = 288/290 (99.31%), Postives = 288/290 (99.31%), Query Frame = 1

Query:     1295 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69293126 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 69292837

HSP 4 Score: 512.642 bits (277), Expect = 6.510e-143
Identity = 279/280 (99.64%), Postives = 279/280 (99.64%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 280
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69218311 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAACAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 69218032

HSP 5 Score: 508.949 bits (275), Expect = 8.422e-142
Identity = 285/290 (98.28%), Postives = 285/290 (98.28%), Query Frame = 1

Query:     1295 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69214212 AGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 69213923

HSP 6 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.141e-129
Identity = 336/378 (88.89%), Postives = 336/378 (88.89%), Query Frame = 1

Query:      284 TATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGT 661
                |||||| ||| || |||||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  || |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||
Sbjct: 77746775 TATTCGACAAGTACAAGAATGAAAATGAAAAATTTAAAGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTGCACAAATGAGAGTTCATGGAGAGAAAATACTAGACGAAGCACTTATCTTTACAACTACTCATCTTGAATCCTCAGTTAAAACATGTCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTATCATCAACTACCTTCTCATGAGGAGATTCTTTTAATACTTGCTAAACTAGATTTCAACCTGCTTCAAAAACTACATCAAAAGGAACTAAGTTACATAACGAGGT 77747152

HSP 7 Score: 462.783 bits (250), Expect = 6.650e-128
Identity = 254/256 (99.22%), Postives = 254/256 (99.22%), Query Frame = 1

Query:     1041 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1296
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69215873 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAAATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 69215618

HSP 8 Score: 451.703 bits (244), Expect = 1.439e-124
Identity = 252/256 (98.44%), Postives = 252/256 (98.44%), Query Frame = 1

Query:     1041 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 1296
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69293693 GTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAG 69293438

HSP 9 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.450e-119
Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 250/256 (97.66%), Query Frame = 1

Query:      658 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-----GTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAA 908
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 69216664 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATAAAAACATATGAA 69216409

HSP 10 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.450e-119
Identity = 250/256 (97.66%), Postives = 250/256 (97.66%), Query Frame = 1

Query:      658 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-----GTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAA 908
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 69294507 AGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCATGGATGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATAAAAACATATGAA 69294252

HSP 11 Score: 435.083 bits (235), Expect = 1.450e-119
Identity = 270/286 (94.41%), Postives = 270/286 (94.41%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAA---CAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAA---CCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 280
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||
Sbjct: 69296127 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGCTATTTTATAGCATGTG 69295842

HSP 12 Score: 392.61 bits (212), Expect = 8.849e-107
Identity = 263/286 (91.96%), Postives = 263/286 (91.96%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAA-CAA--TCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTG 280
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||  |||  ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 77745570 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATCTA-ATT--GATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGGTTATAATATTGCATGTG 77745852

HSP 13 Score: 241.185 bits (130), Expect = 3.392e-61
Identity = 132/133 (99.25%), Postives = 132/133 (99.25%), Query Frame = 1

Query:      909 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 1041
                ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69216121 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 69215989

HSP 14 Score: 191.325 bits (103), Expect = 3.465e-46
Identity = 123/133 (92.48%), Postives = 123/133 (92.48%), Query Frame = 1

Query:      909 GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGG 1041
                ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 69293938 GTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGG 69293806


Match Name	Summary
NC_044377.1	E-Value: 2.924e-166, PID: 98.43 Description: Cannabis sativa chromosome 6, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: XM_030621835.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase (LOC115694741), mRNA

HSP 1 Score: 2676.92 bits (1449), Expect = 0.000e+0
Identity = 1543/1584 (97.41%), Postives = 1543/1584 (97.41%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAAGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |   |  || |  | | | | |         |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      163 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAACAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCGGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATTCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGTTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-T--G---G--ATGT--T-AGA-A-A---------G--GTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAAATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCTGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAAAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTCTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1722

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: XM_030622484.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695419), mRNA

HSP 1 Score: 2471.94 bits (1338), Expect = 0.000e+0
Identity = 1511/1590 (95.03%), Postives = 1511/1590 (95.03%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTC---ATAATAATAACAATCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAACATATGAAGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1584
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |   |  || |  | | | | |         |  ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:      127 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAAGAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAATCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAATAACAATCTTCATCGTGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGCTATTTTATAGCATGTGAGGTATTTGCCAAATATAAGAATGAGAAAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTCGCAGAGAAGAAATACTAGATGAAGCTCTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCTCAATTGAGCTCTCCATATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATCCGAAAGAGCTTTCAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATTACTTTACCGTAAACTACCTTCTCACGAAGAGCTTCTTTTAACCCTCGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAGGAATTGAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCA-T--G---G--ATGT--T-AGA-A-A---------G--GTGGGATATATCTGCTACTGACAACTTGCCAGAGTACATGAAAGTATGTTACAAAAAATGTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTACAAAGGAAAATTCATACTGCGCGAGTTATATTAAGAAAGGGTTGCAATGTATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGTCCAATGGTTACACAATAAATATATGCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTGAAGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAGATGTTGTAACAAAAGAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAGCCCCAACCTAAGATTATACGAACTATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGGATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTACATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGAACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAATCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTGAACCATGAGATGTACAGAGAAGGTGACGGTTTTACACAACCAACATTGCTCAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC 1692

[Close]

BLAST of TPS44 vs. Genbank
Match Name: XM_030622624.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695567), mRNA

HSP 1 Score: 1037.09 bits (561), Expect = 0.000e+0
Identity = 780/887 (87.94%), Postives = 780/887 (87.94%), Query Frame = 1

Query:        1 AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAAAATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAAT-A--ACAATCTTCATCACGATTTTGGTG---ATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGCTTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAGAATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATACTAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAAACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCCAAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTATATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTTCAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTTGAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTTGCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGCTAAGGCCTTTTACTGAAGCAGTTAGAAAGGT 881
                ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |  | |||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| || |||||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  || |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||| ||  | |||  ||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| ||  | || || ||||| || ||| || | || || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||||||||
Sbjct:      133 AATAACAAAGAGAGTTATGAGAAGATTATTGAGATGAAGGAACAAGTGAAGAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTGGAGACACTTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTGTCTTATTATTTTGAAAATGAAATTGAACAAAATTTGGAGCAATTTCATAATAATTATCAAAATC-TAAT--TGATTTTGGTGATAATAACCTTTATGCTGATGCTCTTTGCTTTCGGTTGCTTAGGCAACAAGGTTATAATATTGCATGTGACATATTCGACAAGTACAAGAATGAAAATGAAAAATTTAAAGAATCAATTTCGAGTGACATTCGAGGAATGTTGAACTTGTATGAAGCTGCACAAATGAGAGTTCATGGAGAGAAAATACTAGACGAAGCACTTATCTTTACAACTACTCATCTTGAATCCTCAGTTAAAACATGTCAATTGAGCTCTCCTTATCTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAATGCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATATCACTTTATCATCAACTACCTTCTCATGAGGAGATTCTTTTAATACTTGCTAAACTAGATTTCAACCTGCTTCAAAAACTACATCAAAAGGAACTAAGTTACATAACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGATTACAAAAGTAAGCATTCATTTATAAAAGACAGAATAGTGGAGTGCTATTTCTGGGTTTATGGAGTGTTTTTTGAGGCAGAAACTTCCCAAATCAGACTAATAATCACCAAATTAATTGCTATTCTCACAATAATTGATGATGCTTATGATAGCTTTGGTACACTTGAAGAACTAGAGCCTTTTACTCAAGCAAT-AGAAAGGT 1015


Match Name	Summary
XM_030621835.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 97.41 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase (LOC115694741), mRNA [more]
XM_030622484.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 95.03 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695419), mRNA [more]
XM_030622624.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.94 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-germacrene D synthase-like (LOC115695567), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..24
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 25..35
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 36..59
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 60..63
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF42		coord: 3..528
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 3..528
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 28..53
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..27
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 5..27
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 207..528 e-value: 4.6E-106 score: 356.4
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 192..528
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 4..166 e-value: 4.1E-46 score: 157.1
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 197..475 e-value: 1.8E-93 score: 312.7
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 6..206 e-value: 3.0E-63 score: 214.8
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 11..190

TPS44

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAA GAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACAC TTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAA AATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAACAATCTTCA TCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGC TTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAG AATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAAT GTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATAC TAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAA ACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAAT GCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATAT CACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCC AAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTA TATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTT CAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTT GAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTT GCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGC TAAGGCCTTTTACTGAAGCAGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAA CATATGAAGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAA AGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTA CAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGGTTGCAATGT ATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATAT GCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTG ATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAA GAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAAC TATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGG ATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTAC ATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGA ACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAA TCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTG AACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCT CAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC
Sequence Length	1584
Sequence Checksum	e290100fa964b16e78da1e177715177f

Sequence

AATAACAAAGAGAGTTATGTGAAGATTATTGAGCTGAAGGAACAAGTGAA
GAATAAATTACTTCATGGTCTTCATCCTTTGGAAAACCCTTTAGAGACAC
TTGAATATATTGATGATATTCAACGATTGGGGTTATCTTATTATTTCGAA
AATGAAATTGAACAAGTTTTGAAGCAATTTCATAATAATAACAATCTTCA
TCACGATTTTGGTGATAACCTTTATGCTGATGCTCTTCGCTTTCGGTTGC
TTAGGGAACAAGGTTATAATAGTGCATGTGAGGTATTCGCCAAATATAAG
AATGAGAGAGGAAAATTTAAGGAATCAATTTTGAGTGACATTCGAGGAAT
GTTGAACTTGTATGAAGCTTCACAAATGAGAGTTTGCAGAGAAAAAATAC
TAGATGAAGCACTTATCTTCACAACTACTCATCTTCAGTCCTTAGTGGAA
ACATCCCAATTGAGCTCTCCTTATTTAGACCTAGTGAAACATGCCCTAAT
GCACCCTATTCGAAAGAGCTTACAAAGAAGAGAGGCAAGACTTTACATAT
CACGTTACCACCAACTACCTTCTCACGAAAAGCTTCTTTTAACTCTTGCC
AAACTAGATTTCAACTTGCTTCAACAACTACATCAAAAAGAATTAAATTA
TATTACGAGGTGGTGGAAGGAGTTTGACTTCAAAAGTAAGCAATCTTTTT
CAAGAGACAGAATAGTGGAGTGTTACATTTGGAATTATGGAGTATATTTT
GAAGCTCAAACTTCCCAAATTAGGTTGATGATGACCAAGTTGATTTCTTT
GCTTACTATTATTGATGATTCTTATGATAGCTATGGTACACTTGAAGAGC
TAAGGCCTTTTACTGAAGCAGTTAGAAAGGTATTTAATTATATATACAAA
CATATGAAGTGGGATATATCTGCTACTGAAAATTTACTAGAGTACATGAA
AGTATGTTACAAGAAATTTTTAGAATTTTTCAATGAAATTGAAGAATTTA
CAAAGGAAAATCCATACTGTGCGAGCTATGTTAAGAAAGGGTTGCAATGT
ATGGTTAGAGCTTATAGTAAGGAAGCCCAATGGTTACACAATAAATATAT
GCCAACATTTGATGAATATTATCCAATTGGACTTGATAATGCTGGATCTG
ATGAGCTAATATCAATGGCCTTTTGTGGAATGGGAAATGTTGTAACAAAA
GAATCTATGGATTGGATATTTTCTCAACCCCAACCTAAGATTATACGAAC
TATGTCAATTGTTGGAAGACTTATGAATGACATTGGCTACCACAAGTCGG
ATCGAAGAAAATTATCAAAAGATGTAGTGGCTTCCGCTGTGGAGTGTTAC
ATCAAACAATATGGTGTAACAGATGAAGAAGCTATAGAGAAACTTAACGA
ACAAGTTAATGATTCATGGAAGGATCTCAATGAAGATCTTCTTTATCCAA
TCGCTATTCCTAGACCACTCTTAATGAGAGTTCTCAATCTTGTACGAGTG
AACCATGAGATGTATAGAGAAGGCGACGGTTTTACACAACCAACATTGCT
CAAGAATTTGATTGATACTCTCATCATCAATCCC

Sequence Length

1584

Sequence Checksum

e290100fa964b16e78da1e177715177f

Summary

Resource Type	mRNA
Organism	Cannabis sativa L.
Name	TPS44
Identifier	TPS44
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:44
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:44