MK801766.1 | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 741.627 bits (401), Expect = 0.000e+0
Identity = 401/401 (100.00%), Postives = 401/401 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      564 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 964
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Sbjct:  3111481 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 3111881

HSP 2 Score: 577.275 bits (312), Expect = 2.740e-162
Identity = 385/417 (92.33%), Postives = 385/417 (92.33%), Query Frame = 1

Query:      564 AGAAATTTTCAATAA-TTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGT--CAAGTAGT-A-A-TAATAATAAT---ATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCA---CTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGT---TT-ATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 964
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Sbjct:  3045714 AGAAATTTTCAATAATTTTTAAGGATGATGAGAGTGGAGAGATCGAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAGATTAATGTGTCAAGTAGTAATAGTAATAATAATAACATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACAGCTTCAATGGAGAATC-CTTGATAAGAAGCTAAATGGTCTATTAATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGGTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAATTACTCTCTAGGT 3046129

HSP 3 Score: 564.348 bits (305), Expect = 2.133e-158
Identity = 310/312 (99.36%), Postives = 310/312 (99.36%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTAT 312
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Sbjct:  3109314 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGG-TGAATTTTAT 3109624

HSP 4 Score: 551.422 bits (298), Expect = 1.661e-154
Identity = 298/298 (100.00%), Postives = 298/298 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1572 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1869
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Sbjct:  3114430 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 3114727

HSP 5 Score: 473.863 bits (256), Expect = 3.698e-131
Identity = 266/270 (98.52%), Postives = 266/270 (98.52%), Query Frame = 1

Query:      299 AGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCC---TAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 565
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Sbjct:  3110595 AGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAATCCTATTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 3110864

HSP 6 Score: 470.169 bits (254), Expect = 4.784e-130
Identity = 254/254 (100.00%), Postives = 254/254 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1320 GATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGG 1573
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Sbjct:  3114082 GATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGG 3114335

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.058e-111
Identity = 221/221 (100.00%), Postives = 221/221 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      961 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAG 1181
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Sbjct:  3112841 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAG 3113061

HSP 8 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.804e-111
Identity = 284/312 (91.03%), Postives = 284/312 (91.03%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTAT 312
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Sbjct:  3057845 ATGCAGTGCATGGCTTTTCACCAATTTGCTCCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGAATTAATAATCGTCTTACACCAAAAACTTCTATTA--T-TACTT------CTATTTCAAAAC------CAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTATTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGG-TGAATTTTAT 3058140

HSP 9 Score: 398.15 bits (215), Expect = 2.290e-108
Identity = 356/421 (84.56%), Postives = 356/421 (84.56%), Query Frame = 1

Query:      564 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAA-AGTAT-TTTGGAAGAA-GC-AA-GAAT-TTTC-A-CAACAA-AATGTCTCAAAA-AATA-CAAAT--TAAT-GTCA-AGTAGTAATAATAATA-ATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGT-T-T--ATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 964
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Sbjct:  3100321 AGAAATTTTCAATAATTTTAAGGATGATGAGAGTGGAGAGATCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCAT-GGAGAATTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTGTCAAGTAGTAATAAT-AATAATAATAATATAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATATATGACATTAATATCATTATTGGCGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTCTATTAATTGAAAAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTCGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGGTGCAATCAACATATCAAGAGAAGCTCAAATTACTCTCTAGGT 3100739

HSP 10 Score: 324.284 bits (175), Expect = 3.941e-86
Identity = 254/293 (86.69%), Postives = 254/293 (86.69%), Query Frame = 1

Query:     1572 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTT-AGGGTTGATTATTACTCCTATCCCC 1863
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Sbjct:  3117943 GGATGAAATGAAAAGAGGCGATGTTCCTACATCAATTCAATGTTACATGCATGATACTGGTATTTCTGAAGACGAAGCTCGTGAGCACATCAAGCATTTGATAAGCGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAAATGGAGATCATAATTCTTCTTTCTCGAAAGAATTTGTTCATGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTTATTTACCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAAAATACTCTATCAAAAGATCGTATTTTTAAAATT-ATTATTAATCCTTTCCCC 3118234

HSP 11 Score: 320.591 bits (173), Expect = 5.098e-85
Identity = 205/221 (92.76%), Postives = 205/221 (92.76%), Query Frame = 1

Query:      961 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAG 1181
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Sbjct:  3116400 AGGTGGTGGAAGCATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGATGGAGTGTTTCATGTGGCAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAGAATTCAGTTACTTTAGAATAATTGCTACACAAATCTATGTTCTAATCACAATAATTGATGATATGCATGACATATATGCAACTTTGGAGGAACTACAACTTTTCGCTAATGCTCTTCAAAG 3116620

HSP 12 Score: 270.731 bits (146), Expect = 5.208e-70
Identity = 173/186 (93.01%), Postives = 173/186 (93.01%), Query Frame = 1

Query:      308 CTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATC 493
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Sbjct:  3099163 CTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGACATGGAAAAGATGCTAATTGGAGAGGAAAACTCTTTAGCTCAATTTGAGCTAATTGATACAATACAAAGACTTGAAATATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATTATTT-TATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAATC 3099347

HSP 13 Score: 263.345 bits (142), Expect = 8.714e-68
Identity = 173/187 (92.51%), Postives = 173/187 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      311 ATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGA--TGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCCT 495
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Sbjct:  3044595 ATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGACATG-GAAAA-GATGCTAATTGGAGAGG-AAACTCTTTAGCTCAATTTGAGCTAATTGATACAATACAAAGACTTGAAATATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATTATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAA-CCT 3044777

HSP 14 Score: 261.498 bits (141), Expect = 3.134e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1180 AGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTG 1320
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Sbjct:  3113478 AGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTG 3113618

HSP 15 Score: 122.999 bits (66), Expect = 1.543e-25
Identity = 78/84 (92.86%), Postives = 78/84 (92.86%), Query Frame = 1

Query:      482 ACAACCCTAATCCTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 565
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Sbjct:  3044803 ACAACCCTAACCTTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCAAATTTAGGTTTCTTCGCCAATATGGGTTTGAAGTACCTCAAG 3044886

HSP 16 Score: 122.999 bits (66), Expect = 1.543e-25
Identity = 78/84 (92.86%), Postives = 78/84 (92.86%), Query Frame = 1

Query:      482 ACAACCCTAATCCTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 565
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Sbjct:  3099405 ACAACCCTAACCTTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCAAATTTAGGTTTCTTCGCCAATATGGGTTTGAAGTACCTCAAG 3099488

HSP 17 Score: 102.686 bits (55), Expect = 2.010e-19
Identity = 63/66 (95.45%), Postives = 63/66 (95.45%), Query Frame = 1

Query:      700 AGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAA--TGTCAAGTAGTAATAATAATAATA 763
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Sbjct:  3100426 AGAA-TTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTGTCAAGTAGTAATAATAATAATA 3100490


Match Name	Summary
CM010790.2	E-Value: 2.740e-162, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-60500_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 1014.93 bits (549), Expect = 0.000e+0
Identity = 549/549 (100.00%), Postives = 549/549 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1321 ATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1869
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Sbjct:        1 ATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 549


Match Name	Summary
PKGMv1-60500_t	E-Value: 0.000e+0, PID: 100.00 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 741.627 bits (401), Expect = 0.000e+0
Identity = 401/401 (100.00%), Postives = 401/401 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      564 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 964
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Sbjct:  2429137 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 2428737

HSP 2 Score: 582.815 bits (315), Expect = 5.786e-164
Identity = 386/417 (92.57%), Postives = 386/417 (92.57%), Query Frame = 1

Query:      564 AGAAATTTTCAATAATTTT-AAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGT--CAAGTAGT-A-A-TAATAATAAT---ATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCAC---TTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGT---TT-ATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 964
                ||||||||||||||||||| ||  || |  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct:  2541692 AGAAATTTTCAATAATTTTTAAGGATGATGAGAGTGGAGAGATCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAGATTAATGTGTCAAGTAGTAATAGTAATAATAATAACATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACAGCTTCAATGGAGAATC-CTTGATAAGAAGCTAAATGGTCTATTAATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGGTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAATTACTCTCTAGGT 2541277

HSP 3 Score: 564.348 bits (305), Expect = 2.096e-158
Identity = 310/312 (99.36%), Postives = 310/312 (99.36%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTAT 312
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Sbjct:  2431305 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGG-TGAATTTTAT 2430995

HSP 4 Score: 551.422 bits (298), Expect = 1.632e-154
Identity = 298/298 (100.00%), Postives = 298/298 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1572 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1869
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2426184 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 2425887

HSP 5 Score: 473.863 bits (256), Expect = 3.633e-131
Identity = 266/270 (98.52%), Postives = 266/270 (98.52%), Query Frame = 1

Query:      299 AGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCCTA---ATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 565
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2430024 AGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAATCCTATTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 2429755

HSP 6 Score: 470.169 bits (254), Expect = 4.700e-130
Identity = 254/254 (100.00%), Postives = 254/254 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1320 GATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGG 1573
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2426535 GATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGG 2426282

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.039e-111
Identity = 221/221 (100.00%), Postives = 221/221 (100.00%), Query Frame = 1

Query:      961 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAG 1181
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Sbjct:  2427777 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAG 2427557

HSP 8 Score: 407.383 bits (220), Expect = 3.738e-111
Identity = 284/312 (91.03%), Postives = 284/312 (91.03%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTAT 312
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Sbjct:  2492686 ATGCAGTGCATGGCTTTTCACCAATTTGCTCCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGAATTAATAATCGTCTTACACCAAAAACTTCTATTA--T-TACTT------CTATTTCAAAAC------CAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTATTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGG-TGAATTTTAT 2492391

HSP 9 Score: 399.997 bits (216), Expect = 6.254e-109
Identity = 283/312 (90.71%), Postives = 283/312 (90.71%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTAT 312
                ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||      | |   ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct:  2529631 ATGCAGTGCATGGCTTTTCACCAATTTGCTCCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGAATTAATAAT-GTTTTACACCAAAAACTTCTATTA--T-TACTT------CTATTTCAAAAC------CAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCGATTTGGTCTTTTGATTTTATTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGG-TGAATTTTAT 2529337

HSP 10 Score: 340.904 bits (184), Expect = 3.845e-91
Identity = 208/219 (94.98%), Postives = 208/219 (94.98%), Query Frame = 1

Query:      750 TAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGT-T-T--ATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGT 964
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Sbjct:  2440108 TAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTGGCGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTCTATTAATTGAAAAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTCGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGGTGCAATCAACATATCAAGAGAAGCTCAAATTACTCTCTAGGT 2439890

HSP 11 Score: 324.284 bits (175), Expect = 3.872e-86
Identity = 254/293 (86.69%), Postives = 254/293 (86.69%), Query Frame = 1

Query:     1572 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTT-AGGGTTGATTATTACTCCTATCCCC 1863
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Sbjct:  2422654 GGATGAAATGAAAAGAGGCGATGTTCCTACATCAATTCAATGTTACATGCATGATACTGGTATTTCTGAAGACGAAGCTCGTGAGCACATCAAGCATTTGATAAGCGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAAATGGAGATCATAATTCTTCTTTCTCGAAAGAATTTGTTCATGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTTATTTACCAATATGGAGATGGACATGCTTCTCAAAATACTCTATCAAAAGATCGTATTTTTAAAATT-ATTATTAATCCTTTCCCC 2422363

HSP 12 Score: 320.591 bits (173), Expect = 5.009e-85
Identity = 205/221 (92.76%), Postives = 205/221 (92.76%), Query Frame = 1

Query:      961 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAG 1181
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Sbjct:  2424197 AGGTGGTGGAAGCATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGATGGAGTGTTTCATGTGGCAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAGAATTCAGTTACTTTAGAATAATTGCTACACAAATCTATGTTCTAATCACAATAATTGATGATATGCATGACATATATGCAACTTTGGAGGAACTACAACTTTTCGCTAATGCTCTTCAAAG 2423977

HSP 13 Score: 311.357 bits (168), Expect = 3.015e-82
Identity = 191/202 (94.55%), Postives = 191/202 (94.55%), Query Frame = 1

Query:      564 AGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGT--CAAGTAGTAATAATAATAATA 763
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Sbjct:  2440341 AGAAATTTTCAATAATTTTAAGGATGATGAGAGTGGAGAGATCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAAATTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTGTCAAGTAGTAATAATAATAATA 2440140

HSP 14 Score: 272.578 bits (147), Expect = 1.423e-70
Identity = 173/186 (93.01%), Postives = 173/186 (93.01%), Query Frame = 1

Query:      308 CTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATC 493
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Sbjct:  2441505 CTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGACATGGAAAAGATGCTAATTGGAGAGGAAAACTCTTTAGCTCAATTTGAGCTAATTGATACAATACAAAGACTTGAAATATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATTATTTTTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAATC 2441320

HSP 15 Score: 263.345 bits (142), Expect = 8.561e-68
Identity = 173/187 (92.51%), Postives = 173/187 (92.51%), Query Frame = 1

Query:      311 ATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGA--TGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCCT 495
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Sbjct:  2542815 ATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGACATG-GAAAA-GATGCTAATTGGAGAGGAAA-CTCTTTAGCTCAATTTGAGCTAATTGATACAATACAAAGACTTGAAATATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATTATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAA-CCT 2542633

HSP 16 Score: 261.498 bits (141), Expect = 3.079e-67
Identity = 141/141 (100.00%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1180 AGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTG 1320
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2427139 AGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTG 2426999

HSP 17 Score: 122.999 bits (66), Expect = 1.516e-25
Identity = 78/84 (92.86%), Postives = 78/84 (92.86%), Query Frame = 1

Query:      482 ACAACCCTAATCCTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 565
                |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct:  2441261 ACAACCCTAACCTTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCAAATTTAGGTTTCTTCGCCAATATGGGTTTGAAGTACCTCAAG 2441178

HSP 18 Score: 122.999 bits (66), Expect = 1.516e-25
Identity = 78/84 (92.86%), Postives = 78/84 (92.86%), Query Frame = 1

Query:      482 ACAACCCTAATCCTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAG 565
                |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct:  2542606 ACAACCCTAACCTTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCAAATTTAGGTTTCTTCGCCAATATGGGTTTGAAGTACCTCAAG 2542523

HSP 19 Score: 91.6061 bits (49), Expect = 4.275e-16
Identity = 95/118 (80.51%), Postives = 95/118 (80.51%), Query Frame = 1

Query:     1572 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAG 1689
                ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| | ||   ||||   |||||||| ||||||||| | |  || || |  |||||||||||| ||||||||
Sbjct:  1318315 GGATGAATTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATCCAATGCAAAATGTATGAAGATGGTATATCTGAAGAGGAAGCTCGTCAACGTATTAAGTTATTAATAAGTGAAACATGGAAG 1318432


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 5.786e-164, PID: 100.00 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644768.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-limonene synthase, chloroplastic-like (LOC115716064), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 3432.2 bits (1858), Expect = 0.000e+0
Identity = 1868/1872 (99.79%), Postives = 1868/1872 (99.79%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCC---TAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTGATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1869
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Sbjct:       66 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAATCCTATTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTGATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1937

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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644769.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-limonene synthase, chloroplastic-like (LOC115716064), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 2420.23 bits (1310), Expect = 0.000e+0
Identity = 1322/1327 (99.62%), Postives = 1322/1327 (99.62%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCC---TAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTG-ATG 1323
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Sbjct:       66 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATAACAACCCTAATCCTATTAATTATGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGAGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGTAATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTGGATG 1392

HSP 2 Score: 551.422 bits (298), Expect = 1.217e-155
Identity = 298/298 (100.00%), Postives = 298/298 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1572 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1869
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Sbjct:     1388 GGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCCTATCCCCATGTAA 1685

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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030645191.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716405), mRNA

HSP 1 Score: 1155.28 bits (625), Expect = 0.000e+0
Identity = 1503/1919 (78.32%), Postives = 1503/1919 (78.32%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAA---AACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAAT-A-ATGA-CAACCCTA--AT-----C---C--TAATTATG---ATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGG-AGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACA---A-AT--T--A-A-TGTC-AAGTAGTAATAA-TAATA--AT-A--TGACA-T--TA--A-TA-TCAT----TATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCT-CAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAG-AATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTAC-TTT-ACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTGATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATG-T--CTA--A-AAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGA--CTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTA-ACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCC 1856
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Sbjct:       68 ATGCAGTGCATGGCTTTTCACCAATTTGCTCCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGAATTAATAATNGTTTTACACCAAAAACTTCTATTA--T-TACTT------CTATTTCAAAAC------CAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCGATTTGGTCTTTTGATTTTATTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGAGAATCCTATACAAGGCAATTAAATAAGTTGAAGAAAGAAGTGACAAGAATGCTCCTTGGACTGGAAATTAACTCTTTAGCCCTACTTGAGCTAATTGATACATTGCAAAGGCTTGGAATATCTTACCATTTTAAGAATGAAATAAACACTATTTTGAAGAAAAAATACACTGATAATTATATTAACAATAATATTATTATTACTAACCCTAATTATAATAATTTATATGCCATTGCTCTCGAATTTAGGCTTCTACGCCAACATGGCTATACAGTACCTCAAGAAATTTTTAATGCTTTCAAGGAT-A-A-GAGAGGGAAATTTAAAA-CATGCTTGAGTGATGATATTATGGGAGTATTGTGTTTATATGAAGCTTCATTCTATGCTATGAAACATGAAAATATTTTGGAGGAAGCAAGAATTTTTTCAACTAAATGTCTTAAAAAATACATGGAGAAAATGGAGAATGAGGAAG-AGAAAAAAATATTATTATTAGATGATAATAATATTAATAGTAATTTGCTATTAATTAATCACGCTTTCGAGCTTCCGCTTCATTGGAGAATAACAAGATCGGAAGCTAGGTGGTTCATTGACGAAATATATGAGAAAAAACAAGACATGAATTCGACTTTGTTCGAGTTTGCGAAATTAGATTTTAATATAGTGCAATCAACACACCAAGAAGATTTACAACATT-TATCGAGGTGGTGGAGGGATTGTAAACTTGGTGGGAAATTGAATTTTGCTAGAGATAGATTGATGGAAGCTTTCTTATGGGATGTTGGACTAAAATTCGAGGGAGAATTCAGCTATTTTAGAAGAATAAATGCAAGATTATTTGTGCTTATAACAATAATTGATGATATTTATGATGTATATGGAACTTTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAGTGCTGTTGAAAGATGGGATGTGAAATTAATCA-ATGAGTTACCAGATTACATGAAGATGCCTTTCTTTGTTTTAC--ACAATACCATAAATGAGATGGGGTTCGATGTATTAGTACAACAAAACTTTGTCAACATTGAATACCTTAAGAAATCGTGGGTAGATTTATGTAAATGTTATTTACAAGAAGCAAAATGGTATTATAGTGGATACCAACCAACATTGGAAGAATACACTGAGTTGGGTTGGCTTTCAATAGGAGCATCAGTAATTCTTATGCATGCTTATTTTTGTTTCACAAATCCTATAACAAAACAAGACTTGAAAAGCTTGCAATTACAACATCATTATCCCAACATAATTAAACAAGCAT-GCTTG-ATTACAAGGCTTGCAGATGATTTAGGAACATCTTCGGATGAATTGAATAGAGGCGACGTTCCTAAATCGATTCAATGTTACATGTACGATAATAATGCTACCGAAGACGAAGCTCGTGAACACATCAAGTTCTTGATAAGTGAAACATGGAAGGATATGAATAAGAAAGATG-AAG-ATGAGAGT-TGTTTA-TCAGAAAATTTTGTTGAAGTTTGCAAAAATATGGCTAGAACAGCACTATTCATATATGAGAATGGAGATGGACATGGTTCTCAGAATAGTTTATCAAAAGAACGTATTTCAACCTTGATTATTACTCC 1956

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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644766.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716063), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1153.43 bits (624), Expect = 0.000e+0
Identity = 1503/1919 (78.32%), Postives = 1503/1919 (78.32%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAA---AACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAAT-A-ATGA-CAACCCTA--AT-----C---C--TAATTATG---ATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGG-AGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACA---A-AT--T--A-A-TGTC-AAGTAGTAATAA-TAATA--AT-A--TGACA-T--TA--A-TA-TCAT----TATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCT-CAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAG-AATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTAC-TTT-ACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTGATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAA--G-ACGGTC---ATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGA--CTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTA-ACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTATTACTCC 1856
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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644770.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-limonene synthase, chloroplastic-like (LOC115716066), mRNA

HSP 1 Score: 992.771 bits (537), Expect = 0.000e+0
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Query:      961 AGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTC-TACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAACTGATGG-TAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCATATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAA-GAGGCATTGGAATGTCTAAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAATGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTTGCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGACATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTT-AGGGTTGATTATTACTCCTATCCCC 1863
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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644767.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716063), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 887.512 bits (480), Expect = 0.000e+0
Identity = 1092/1378 (79.25%), Postives = 1092/1378 (79.25%), Query Frame = 1

Query:        1 ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTATTTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTATTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGATCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCCTAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAGGGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAGGATGCTAATTGGAGTGGAA---AACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATACAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCTATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAAT-A-ATGA-CAACCCTA--AT-----C---C--TAATTATG---ATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGATTTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGG-AGAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATATGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAAGAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACA---A-AT--T--A-A-TGTC-AAGTAGTAATAA-TAATA--AT-A--TGACA-T--TA--A-TA-TCAT----TATTAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCT-CAAAGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAG-AATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTAC-TTT-ACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACATTGAATACTTCAAGAAA-CTGATG 1323
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BLAST of MK801766.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644482.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10 (LOC115715811), mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.433e-40
Identity = 680/964 (70.54%), Postives = 680/964 (70.54%), Query Frame = 1

Query:      751 AATAATAATAA-TATGA-CATTAATATCATTAT----TAGTGAATCATGCTTTGGAGATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGA-AGCTAAATGGTTTATTGAAGAAATATATGA-AAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTTGCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCT-CAA-A-GTACTCTCTAGGTGGT-GGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTTTCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGATTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGTTCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGGAACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTAGATAAGTTACCAGATTATATGAAGACA-GCTTTC-TACTTTACATACAATTTCACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTA-CA--AGAACATGG-TTTTGTTCACATTGAA-TACTTCAAGAAACTGATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAAGAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAA-CATTGCAAGAATATGTTGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTAT-GCATGCATATTTCGCTTTTA-CAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGT-C-T-AAAAGACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGCAGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTAAATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCTCGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAG 1689
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XM_030644766.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 78.32 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716063), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030644770.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 86.55 Description: PREDICTED: Cannabis sativa (-)-limonene synthase, chloroplastic-like (LOC115716066), mRNA [more]
XM_030644767.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 79.25 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716063), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030644482.1	E-Value: 1.433e-40, PID: 70.54 Description: PREDICTED: Cannabis sativa terpene synthase 10 (LOC115715811), mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
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IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 123..292 e-value: 2.4E-195 score: 651.7
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 84..292

Cannabis sativa isolate CsTPS14CT (-)limonene synthase mRNA
complete cds

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, FN-clones109 (TMM50 minvalue)

Reanalysis of 21 trichome RNA-Seq samples, PK-clones109 (TMM50 minvalue)

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

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Sequences

Sequence	ATGCAGTGCATAGCTTTTCACCAATTTGCTTCATCATCATCCCTCCCTAT TTGGAGTAGTATTGATAATCGTTTTACACCAAAAACTTCTATTACTTCTA TTTCAAAACCAAAACCAAAACTAAAATCAAAATCAAACTTGAAATCGAGA TCGAGATCAAGTACTTGCTACCCCATACAATGTACTGTGGTCGATAACCC TAGTTCTACGATTACTAATAATAGTGATCGAAGATCAGCCAACTATGGAC CTCCCATTTGGTCTTTTGATTTTGTTCAATCTCTTCCAATCCAATATAAG GGTGAATCTTATACAAGTCGATTAAATAAGTTGGAGAAAGATGTGAAAAG GATGCTAATTGGAGTGGAAAACTCTTTAGCCCAACTTGAACTAATTGATA CAATACAAAGACTTGGAATATCTTATCGTTTTGAAAATGAAATCATTTCT ATTTTGAAAGAAAAATTCACCAATAATAATGACAACCCTAATCCTAATTA TGATTTATATGCTACTGCTCTCCAATTTAGGCTTCTACGCCAATATGGAT TTGAAGTACCTCAAGAAATTTTCAATAATTTTAAAAATCACAAGACAGGA GAGTTCAAGGCAAATATAAGTAATGATATTATGGGAGCATTGGGCTTATA TGAAGCTTCATTCCATGGGAAAAAGGGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCAA GAATTTTCACAACAAAATGTCTCAAAAAATACAAATTAATGTCAAGTAGT AATAATAATAATATGACATTAATATCATTATTAGTGAATCATGCTTTGGA GATGCCACTTCAATGGAGAATCACAAGATCAGAAGCTAAATGGTTTATTG AAGAAATATATGAAAGAAAACAAGACATGAATCCAACTTTACTTGAGTTT GCCAAATTGGATTTCAATATGCTGCAATCAACATATCAAGAGGAGCTCAA AGTACTCTCTAGGTGGTGGAAGGATTCTAAACTTGGAGAGAAATTGCCTT TCGTTAGAGATAGATTGGTGGAGTGTTTCTTATGGCAAGTTGGAGTAAGA TTTGAGCCACAATTCAGTTACTTTAGAATAATGGATACAAAACTCTATGT TCTATTAACAATAATTGATGATATGCATGACATTTATGGAACATTGGAGG AACTACAACTTTTCACTAATGCTCTTCAAAGATGGGATTTGAAAGAATTA GATAAGTTACCAGATTATATGAAGACAGCTTTCTACTTTACATACAATTT CACAAATGAATTGGCATTTGATGTATTACAAGAACATGGTTTTGTTCACA TTGAATACTTCAAGAAACTGATGGTAGAGTTGTGTAAACATCATTTGCAA GAGGCAAAATGGTTTTATAGTGGATACAAACCAACATTGCAAGAATATGT TGAGAATGGATGGTTGTCTGTGGGAGGACAAGTTATTCTTATGCATGCAT ATTTCGCTTTTACAAATCCTGTTACCAAAGAGGCATTGGAATGTCTAAAA GACGGTCATCCTAACATAGTTCGCCATGCATCGATAATATTACGACTTGC AGATGATCTAGGAACATTGTCGGATGAACTGAAAAGAGGCGATGTTCCTA AATCAATTCAATGTTATATGCACGATACTGGTGCTTCTGAAGATGAAGCT CGTGAGCACATAAAATATTTAATAAGTGAATCATGGAAGGAGATGAATAA TGAAGATGGAAATATTAACTCTTTTTTCTCAAATGAATTTGTTCAAGTTT GCAAAAATCTTGGTAGAGCGTCACAATTCATGTATCAGTATGGCGATGGA CATGCTTCTCAGAATAATCTATCGAAAGAGCGCGTTTTAGGGTTGATTAT TACTCCTATCCCCATGTAA
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Sequence Checksum

163aab1f9b5b00dc6d7bf70bd66613b3

Summary

Resource Type	mRNA
Accession	MK801766.1
Organism	Cannabis sativa L.
Name	MK801766.1
Identifier	MK801766.1
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 10:10
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 10:10