KY014563.1 | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 406/414 (98.07%), Postives = 406/414 (98.07%), Query Frame = 1

Query:      453 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 866
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Sbjct:    27470 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATCATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTACTGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCAATTTCAACACAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 27883

HSP 2 Score: 529.262 bits (286), Expect = 7.430e-148
Identity = 290/292 (99.32%), Postives = 290/292 (99.32%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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Sbjct:    36725 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACATAA 37016

HSP 3 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.261e-135
Identity = 369/420 (87.86%), Postives = 369/420 (87.86%), Query Frame = 1

Query:      453 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 866
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Sbjct:    17986 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGATGATCTAAAACATATATTCAGGTG 18405

HSP 4 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.536e-135
Identity = 269/272 (98.90%), Postives = 269/272 (98.90%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1495
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Sbjct:    36053 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTTGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAACAACATCATCGG 36324

HSP 5 Score: 466.476 bits (252), Expect = 5.909e-129
Identity = 256/258 (99.22%), Postives = 256/258 (99.22%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
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Sbjct:    26374 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 26631

HSP 6 Score: 448.01 bits (242), Expect = 2.140e-123
Identity = 276/292 (94.52%), Postives = 276/292 (94.52%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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Sbjct:    20671 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAA-AGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAA--AAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 20959

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.010e-111
Identity = 224/225 (99.56%), Postives = 224/225 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      858 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:    27968 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191

HSP 8 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.800e-95
Identity = 245/272 (90.07%), Postives = 245/272 (90.07%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1495
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Sbjct:    19805 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 20076

HSP 9 Score: 340.904 bits (184), Expect = 3.737e-91
Identity = 215/230 (93.48%), Postives = 215/230 (93.48%), Query Frame = 1

Query:      854 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:    18496 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 10 Score: 333.517 bits (180), Expect = 6.253e-89
Identity = 190/195 (97.44%), Postives = 190/195 (97.44%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:    13119 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 13313

HSP 11 Score: 322.437 bits (174), Expect = 1.354e-85
Identity = 189/196 (96.43%), Postives = 189/196 (96.43%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGG-TACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:    25766 TTTTTAGACCAAAATTATATACTAATTATAATATTATTAATAATGGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTT-GTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 25960

HSP 12 Score: 283.658 bits (153), Expect = 6.387e-74
Identity = 229/265 (86.42%), Postives = 229/265 (86.42%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATAT--T-AATAATCCT-A--ATT-ATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
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Sbjct:    15859 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTAAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTT-GAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATTAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 16122

HSP 13 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.478e-64
Identity = 141/144 (97.92%), Postives = 141/144 (97.92%), Query Frame = 1

Query:     1081 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1224
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Sbjct:    28326 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATATCTTAAGAAAACG 28469

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 3.057e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1081 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1224
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Sbjct:    19312 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 19455

[Close]

BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 406/414 (98.07%), Postives = 406/414 (98.07%), Query Frame = 1

Query:      453 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 866
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Sbjct:  2528610 AGAAATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2529023

HSP 2 Score: 512.642 bits (277), Expect = 7.483e-143
Identity = 287/292 (98.29%), Postives = 287/292 (98.29%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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Sbjct:  2530869 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACATAA 2531160

HSP 3 Score: 492.329 bits (266), Expect = 9.749e-137
Identity = 270/272 (99.26%), Postives = 270/272 (99.26%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1495
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Sbjct:  2530193 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACAATGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2530464

HSP 4 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.867e-134
Identity = 368/420 (87.62%), Postives = 368/420 (87.62%), Query Frame = 1

Query:      453 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 866
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Sbjct:  2519050 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2519469

HSP 5 Score: 462.783 bits (250), Expect = 7.644e-128
Identity = 278/292 (95.21%), Postives = 278/292 (95.21%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2521799 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 2522090

HSP 6 Score: 436.93 bits (236), Expect = 4.633e-120
Identity = 251/258 (97.29%), Postives = 251/258 (97.29%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2527515 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATA--TCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2527770

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 1.010e-111
Identity = 224/225 (99.56%), Postives = 224/225 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      858 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
                ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2529109 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

HSP 8 Score: 351.984 bits (190), Expect = 1.726e-94
Identity = 245/272 (90.07%), Postives = 245/272 (90.07%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1495
                |||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2520934 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACC-GTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2521204

HSP 9 Score: 344.597 bits (186), Expect = 2.889e-92
Identity = 192/195 (98.46%), Postives = 192/195 (98.46%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
                ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2526907 TTTTTAGACCAAAATTATATACTAATTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2527101

HSP 10 Score: 342.75 bits (185), Expect = 1.039e-91
Identity = 220/237 (92.83%), Postives = 220/237 (92.83%), Query Frame = 1

Query:      848 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
                |||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:  2519552 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 11 Score: 320.591 bits (173), Expect = 4.868e-85
Identity = 188/195 (96.41%), Postives = 188/195 (96.41%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
                ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  2514195 TTTATAGACCAAAAATATATACTA--TATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2514387

HSP 12 Score: 300.278 bits (162), Expect = 6.342e-79
Identity = 231/264 (87.50%), Postives = 231/264 (87.50%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
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Sbjct:  2516928 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2517191

HSP 13 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.478e-64
Identity = 141/144 (97.92%), Postives = 141/144 (97.92%), Query Frame = 1

Query:     1081 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1224
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2529471 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTCTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGGAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2529614

HSP 14 Score: 213.485 bits (115), Expect = 8.499e-53
Identity = 135/145 (93.10%), Postives = 135/145 (93.10%), Query Frame = 1

Query:     1081 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 1225
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Sbjct:  2520436 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 2520580

HSP 15 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.115e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      862 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:  3143570 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000042.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.711e-39
Identity = 110/120 (91.67%), Postives = 110/120 (91.67%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTC 181
                ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct:   178236 GATAATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 178117


Match Name	Summary
AGQN03003403.1	E-Value: 7.430e-148, PID: 98.07 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 7.483e-143, PID: 98.07 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000042.1	E-Value: 6.711e-39, PID: 91.67 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-70835_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 617.901 bits (334), Expect = 2.033e-175
Identity = 348/355 (98.03%), Postives = 348/355 (98.03%), Query Frame = 1

Query:      469 TTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAG 823
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Sbjct:      628 TTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAG 982

HSP 2 Score: 390.763 bits (211), Expect = 4.825e-107
Identity = 224/230 (97.39%), Postives = 224/230 (97.39%), Query Frame = 1

Query:     1495 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGT-TCTCAAG 1723
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Sbjct:      982 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGGCTCTCAAG 1211

HSP 3 Score: 279.964 bits (151), Expect = 1.090e-73
Identity = 220/253 (86.96%), Postives = 220/253 (86.96%), Query Frame = 1

Query:      512 ATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGC 758
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Sbjct:       11 ATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGC 263


Match Name	Summary
PKGMv1-70835_t	E-Value: 2.033e-175, PID: 98.03 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 732.394 bits (396), Expect = 0.000e+0
Identity = 408/414 (98.55%), Postives = 408/414 (98.55%), Query Frame = 1

Query:      453 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 866
                |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2034629 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2035042

HSP 2 Score: 523.722 bits (283), Expect = 3.396e-146
Identity = 289/292 (98.97%), Postives = 289/292 (98.97%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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Sbjct:  2036943 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACATAA 2037234

HSP 3 Score: 497.869 bits (269), Expect = 2.059e-138
Identity = 271/272 (99.63%), Postives = 271/272 (99.63%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1495
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2036267 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2036538

HSP 4 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.239e-135
Identity = 369/420 (87.86%), Postives = 369/420 (87.86%), Query Frame = 1

Query:      453 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 866
                ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | | || ||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2020238 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2020657

HSP 5 Score: 462.783 bits (250), Expect = 7.510e-128
Identity = 278/292 (95.21%), Postives = 278/292 (95.21%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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Sbjct:  2022990 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 2023281

HSP 6 Score: 449.856 bits (243), Expect = 5.847e-124
Identity = 253/258 (98.06%), Postives = 253/258 (98.06%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
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Sbjct:  2029273 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2029530

HSP 7 Score: 409.23 bits (221), Expect = 9.923e-112
Identity = 224/225 (99.56%), Postives = 224/225 (99.56%), Query Frame = 1

Query:      858 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:  2035138 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 8 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.716e-95
Identity = 245/272 (90.07%), Postives = 245/272 (90.07%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1495
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Sbjct:  2022123 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2022394

HSP 9 Score: 342.75 bits (185), Expect = 1.021e-91
Identity = 220/237 (92.83%), Postives = 220/237 (92.83%), Query Frame = 1

Query:      848 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:  2020740 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

HSP 10 Score: 333.517 bits (180), Expect = 6.143e-89
Identity = 190/195 (97.44%), Postives = 190/195 (97.44%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:  2015356 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2015550

HSP 11 Score: 302.124 bits (163), Expect = 1.732e-79
Identity = 187/198 (94.44%), Postives = 187/198 (94.44%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:  2028647 TTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2028844

HSP 12 Score: 300.278 bits (162), Expect = 6.231e-79
Identity = 231/264 (87.50%), Postives = 231/264 (87.50%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
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Sbjct:  2018107 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2018370

HSP 13 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.365e-64
Identity = 141/144 (97.92%), Postives = 141/144 (97.92%), Query Frame = 1

Query:     1081 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1224
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Sbjct:  2035501 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2035644

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 3.003e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1081 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1224
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Sbjct:  2021626 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2021769

HSP 15 Score: 176.552 bits (95), Expect = 1.096e-41
Identity = 179/221 (81.00%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 1

Query:      862 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:  2396996 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 339.057 bits (183), Expect = 1.320e-90
Identity = 262/298 (87.92%), Postives = 262/298 (87.92%), Query Frame = 1

Query:     1494 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAA-TTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1778
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Sbjct:   193002 GGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTATA 192706

HSP 2 Score: 333.517 bits (180), Expect = 6.143e-89
Identity = 217/235 (92.34%), Postives = 217/235 (92.34%), Query Frame = 1

Query:      849 AAAACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1082
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Sbjct:   196619 AAAATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385

HSP 3 Score: 305.817 bits (165), Expect = 1.339e-80
Identity = 237/270 (87.78%), Postives = 237/270 (87.78%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAAT---AAT---------CCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 454
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Sbjct:   197696 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 197427

HSP 4 Score: 261.498 bits (141), Expect = 2.940e-67
Identity = 230/270 (85.19%), Postives = 230/270 (85.19%), Query Frame = 1

Query:     1224 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1493
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Sbjct:   193681 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 193430

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044373.1
Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 172.859 bits (93), Expect = 1.417e-40
Identity = 111/120 (92.50%), Postives = 111/120 (92.50%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTC 181
                ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct: 70056723 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 70056604


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 3.396e-146, PID: 98.55 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]
NW_022060378.1	E-Value: 1.320e-90, PID: 87.92 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044373.1	E-Value: 1.417e-40, PID: 92.50 Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 3131.19 bits (1695), Expect = 0.000e+0
Identity = 1755/1784 (98.37%), Postives = 1755/1784 (98.37%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 2453.47 bits (1328), Expect = 0.000e+0
Identity = 1640/1793 (91.47%), Postives = 1640/1793 (91.47%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATAT--T-AATAATCCTAA-T-T-ATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1785
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Sbjct:       92 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATAATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1884

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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 1927.18 bits (1043), Expect = 0.000e+0
Identity = 1498/1710 (87.60%), Postives = 1498/1710 (87.60%), Query Frame = 1

Query:      104 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTC-A-A-T-AT--T-A-A-TAAT---CCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAT-TGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1778
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BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1914.25 bits (1036), Expect = 0.000e+0
Identity = 1498/1713 (87.45%), Postives = 1498/1713 (87.45%), Query Frame = 1

Query:      104 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTC-A-A-T-AT--T-A-A-TAAT---CCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAT-TGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1778
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Sbjct:       99 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGG---TGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCAT---CG-ATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCA------T--T---C--A-AAT-A-ATA-A-TAAAGAGATTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTATA 1785

[Close]

BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 1323.32 bits (716), Expect = 0.000e+0
Identity = 1008/1146 (87.96%), Postives = 1008/1146 (87.96%), Query Frame = 1

Query:      104 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTC-A-A-T-AT--T-A-A-TAAT---CCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1224
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Sbjct:      103 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGG---TGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCAT---CG-ATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1241

HSP 2 Score: 340.904 bits (184), Expect = 2.738e-92
Identity = 263/299 (87.96%), Postives = 263/299 (87.96%), Query Frame = 1

Query:     1493 CGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1778
                |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| |  | |  |||||   |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||
Sbjct:     1240 CGGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTATA 1537

[Close]

BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 821.033 bits (444), Expect = 0.000e+0
Identity = 1190/1546 (76.97%), Postives = 1190/1546 (76.97%), Query Frame = 1

Query:      120 TATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTT--A-CAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAA-A-A-AATATTAGTTGAGATGGAA---AACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATA-T--GTCAATATTA---ATAATCCTAATTATAATTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGAT-AGAA--AACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTC-AAAA--AC-TA-C-ACTATAATGATATCAGAGC-AAA-AAA--A--GTTA--A-TGATTGATAATGATTATGATTATGATATCG-A--AGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTG-TTTTACACAATACCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCA--CAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATC-ATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGA 1625
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Sbjct:      194 TATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTACTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTATAATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACG--AT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTT-TCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AATT-TCC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTT---ACAA--A-AGATGCCATA-A-ATTT---A---CT-GGAATTAGG---TTATCCACCCATAATTTACCATGCA-T-CCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAAT-GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGA 1711

[Close]

BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030640479.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.367e-40
Identity = 107/115 (93.04%), Postives = 107/115 (93.04%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCA 176
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[Close]

BLAST of KY014563.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030640478.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.367e-40
Identity = 107/115 (93.04%), Postives = 107/115 (93.04%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCA 176
                ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct:      116 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCA 2


Match Name	Summary
XM_030645439.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 98.37 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA [more]
XM_030645438.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 91.47 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA [more]
XM_030629489.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.60 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030629488.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.45 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030629490.1	E-Value: 2.738e-92, PID: 87.96 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030644559.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 76.97 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030640479.1	E-Value: 1.367e-40, PID: 93.04 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030640478.1	E-Value: 1.367e-40, PID: 93.04 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_C_REGION	Signal peptide C-region	coord: 14..18
None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE	Signal Peptide	coord: 1..18
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None	No IPR available	PHOBIUS	SIGNAL_PEPTIDE_N_REGION	Signal peptide N-region	coord: 1..3
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 4..23
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 34..46
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..11
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 12..33
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 11..33
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None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225:SF9		coord: 42..591
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31225	FAMILY NOT NAMED	coord: 42..591
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 34..40
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..11
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 12..33
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 10..32
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 40..40
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 17..39
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None	No IPR available	SIGNALP_EUK	SignalP-noTM	SignalP-noTM	coord: 1..23 score: 0.472
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 53..274 e-value: 7.6E-64 score: 217.1
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 275..592 e-value: 6.1E-115 score: 385.5
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 260..590
IPR005630	Terpene synthase, metal-binding domain	PFAM	PF03936	Terpene_synth_C	coord: 265..538 e-value: 3.9E-95 score: 318.2
IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 53..210 e-value: 3.6E-43 score: 147.5
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 50..260

Cannabis sativa isolate Finola_CsTPS6 terpene synthase mRNA
complete cds

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGCTTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGG TACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGG TCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCC TCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGG AGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAA TATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACA TTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTAT TTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATG CTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCT CAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAA CATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTT TTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACA ACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT AATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTT TAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTC ATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTT AGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAA AACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAAT TTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAG ATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTG AGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAT GAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGAT AAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATA CCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATC AACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTT GCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAAT ATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCAT GCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGA GATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACA GTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAA TTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAA AATTGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATG AAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTG ACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACA TGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCAT CCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA
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Sequence Checksum	451d3bea2ed57b58a5bad41b6efa99a0

Sequence

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TTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATAATTTATATG
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CAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAA
CATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTT
TTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACA
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AATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTT
TAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTC
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GAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGAT
AAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATA
CCATAAATGACATGGTTTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATC
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GCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGA
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AAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTG
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Sequence Length

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Sequence Checksum

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Summary

Resource Type	mRNA
Accession	KY014563.1
Organism	Cannabis sativa L.
Name	KY014563.1
Identifier	KY014563.1
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 10:17
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 10:17