KY014562.1 | ICGRC

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This record has the following annotations.
Term	Name	Definition
GO:0000287	magnesium ion binding	Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. [GOC:ai]
GO:0016829	lyase activity
GO:0010333	terpene synthase activity	Catalysis of the formation of cyclic terpenes through the cyclization of linear terpenes (e.g. isopentenyl-PP, geranyl-PP, farnesyl-PP and geranylgeranyl-PP) containing varying numbers of isoprene units. [EC:4.2.3.-, GOC:tair_curators]
INTERPRO:IPR008930	Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase
INTERPRO:IPR008949	Isoprenoid_synthase_dom_sf
INTERPRO:IPR001906	Terpene_synth_N
INTERPRO:IPR005630	Terpene_synthase_metal-bd
INTERPRO:IPR036965	Terpene_synth_N_sf

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blastn of TPS CDS against pkv5 genome

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 genome
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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03003403.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 406/414 (98.07%), Postives = 406/414 (98.07%), Query Frame = 1

Query:      459 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 872
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Sbjct:    27470 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATCATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTACTGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCAATTTCAACACAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 27883

HSP 2 Score: 534.802 bits (289), Expect = 1.603e-149
Identity = 291/292 (99.66%), Postives = 291/292 (99.66%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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Sbjct:    36725 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACATAA 37016

HSP 3 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.265e-135
Identity = 369/420 (87.86%), Postives = 369/420 (87.86%), Query Frame = 1

Query:      459 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 872
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Sbjct:    17986 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGATGATCTAAAACATATATTCAGGTG 18405

HSP 4 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.551e-135
Identity = 269/272 (98.90%), Postives = 269/272 (98.90%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1501
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Sbjct:    19805 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 20076

HSP 5 Score: 453.549 bits (245), Expect = 4.616e-125
Identity = 277/292 (94.86%), Postives = 277/292 (94.86%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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Sbjct:    20671 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAA-GTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAA--AAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 20959

HSP 6 Score: 427.696 bits (231), Expect = 2.798e-117
Identity = 254/264 (96.21%), Postives = 254/264 (96.21%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
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Sbjct:    26374 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTCAATATTAATAATCCTAATTATA---A---TTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 26631

HSP 7 Score: 390.763 bits (211), Expect = 3.671e-106
Identity = 224/230 (97.39%), Postives = 224/230 (97.39%), Query Frame = 1

Query:      860 ATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:    18496 ATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 18725

HSP 8 Score: 364.91 bits (197), Expect = 2.225e-98
Identity = 247/272 (90.81%), Postives = 247/272 (90.81%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1501
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Sbjct:    36053 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGCACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTTGAATGCTTGGAACATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAACAACATCATCGG 36324

HSP 9 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.816e-95
Identity = 214/225 (95.11%), Postives = 214/225 (95.11%), Query Frame = 1

Query:      864 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:    27968 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 28191

HSP 10 Score: 333.517 bits (180), Expect = 6.274e-89
Identity = 190/195 (97.44%), Postives = 190/195 (97.44%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:    13119 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 13313

HSP 11 Score: 322.437 bits (174), Expect = 1.358e-85
Identity = 189/196 (96.43%), Postives = 189/196 (96.43%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGG-TACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:    25766 TTTTTAGACCAAAATTATATACTAATTATAATATTATTAATAATGGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTT-GTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 25960

HSP 12 Score: 283.658 bits (153), Expect = 6.409e-74
Identity = 230/267 (86.14%), Postives = 230/267 (86.14%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATAT--T-AATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
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Sbjct:    15859 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTAAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTT-GAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTATT--AATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 16122

HSP 13 Score: 255.958 bits (138), Expect = 1.397e-65
Identity = 142/144 (98.61%), Postives = 142/144 (98.61%), Query Frame = 1

Query:     1087 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1230
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Sbjct:    28326 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATCTCCATCAACATTCAATATCTTAAGAAAACG 28469

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 3.067e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1087 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1230
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Sbjct:    19312 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 19455

[Close]

BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: CM010790.2
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 721.314 bits (390), Expect = 0.000e+0
Identity = 406/414 (98.07%), Postives = 406/414 (98.07%), Query Frame = 1

Query:      459 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 872
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Sbjct:  2528610 AGAAATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2529023

HSP 2 Score: 518.182 bits (280), Expect = 1.614e-144
Identity = 288/292 (98.63%), Postives = 288/292 (98.63%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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Sbjct:  2530869 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACATAA 2531160

HSP 3 Score: 483.096 bits (261), Expect = 5.887e-134
Identity = 368/420 (87.62%), Postives = 368/420 (87.62%), Query Frame = 1

Query:      459 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 872
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Sbjct:  2519050 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2519469

HSP 4 Score: 479.403 bits (259), Expect = 7.616e-133
Identity = 268/272 (98.53%), Postives = 268/272 (98.53%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1501
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Sbjct:  2520934 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACC-GTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2521204

HSP 5 Score: 468.323 bits (253), Expect = 1.649e-129
Identity = 279/292 (95.55%), Postives = 279/292 (95.55%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
                ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2521799 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 2522090

HSP 6 Score: 403.69 bits (218), Expect = 4.715e-110
Identity = 250/264 (94.70%), Postives = 250/264 (94.70%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
                ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2527515 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATA--TCAATATTAATAATCCTAATTATA---A---TTTATATGCTATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2527770

HSP 7 Score: 392.61 bits (212), Expect = 1.021e-106
Identity = 229/237 (96.62%), Postives = 229/237 (96.62%), Query Frame = 1

Query:      854 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
                |||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct:  2519552 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAAAAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2519788

HSP 8 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.816e-95
Identity = 214/225 (95.11%), Postives = 214/225 (95.11%), Query Frame = 1

Query:      864 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
                ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2529109 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2529332

HSP 9 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.816e-95
Identity = 245/272 (90.07%), Postives = 245/272 (90.07%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1501
                |||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2530193 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACAATGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2530464

HSP 10 Score: 344.597 bits (186), Expect = 2.899e-92
Identity = 192/195 (98.46%), Postives = 192/195 (98.46%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:  2526907 TTTTTAGACCAAAATTATATACTAATTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2527101

HSP 11 Score: 320.591 bits (173), Expect = 4.885e-85
Identity = 188/195 (96.41%), Postives = 188/195 (96.41%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
                ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct:  2514195 TTTATAGACCAAAAATATATACTA--TATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2514387

HSP 12 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.378e-75
Identity = 231/267 (86.52%), Postives = 231/267 (86.52%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATAT--T-AATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
                ||| |||| |||||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||  | ||||| |||||||||    ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2516928 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTAT---AATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2517191

HSP 13 Score: 250.418 bits (135), Expect = 6.500e-64
Identity = 141/144 (97.92%), Postives = 141/144 (97.92%), Query Frame = 1

Query:     1087 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1230
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Sbjct:  2529471 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTCTTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGGAATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2529614

HSP 14 Score: 213.485 bits (115), Expect = 8.528e-53
Identity = 135/145 (93.10%), Postives = 135/145 (93.10%), Query Frame = 1

Query:     1087 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 1231
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Sbjct:  2520436 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGT 2520580

HSP 15 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.111e-46
Identity = 182/221 (82.35%), Postives = 182/221 (82.35%), Query Frame = 1

Query:      868 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:  3143570 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 3143790

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: AGQN03000042.1
Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 167.319 bits (90), Expect = 6.734e-39
Identity = 110/120 (91.67%), Postives = 110/120 (91.67%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTC 181
                ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct:   178236 GATAATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 178117


Match Name	Summary
AGQN03003403.1	E-Value: 1.603e-149, PID: 98.07 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 003407F, whole genome shotgun sequence [more]
CM010790.2	E-Value: 1.614e-144, PID: 98.07 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush chromosome 1, whole genome shotgun sequence [more]
AGQN03000042.1	E-Value: 6.734e-39, PID: 91.67 Description: Cannabis sativa cultivar Purple Kush 000041F, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

Performed on: 2020-09-04
Details: blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: PKGMv1-70835_t
Description: No definition line

HSP 1 Score: 617.901 bits (334), Expect = 2.040e-175
Identity = 348/355 (98.03%), Postives = 348/355 (98.03%), Query Frame = 1

Query:      475 TTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAG 829
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Sbjct:      628 TTGAAGGACGAGATAGAAAAAATCAAAGAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGACGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAG 982

HSP 2 Score: 396.303 bits (214), Expect = 1.040e-108
Identity = 225/230 (97.83%), Postives = 225/230 (97.83%), Query Frame = 1

Query:     1501 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGT-TCTCAAG 1729
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Sbjct:      982 GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAAGAAGCTCGTGAACATGATAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGGCTCTCAAG 1211

HSP 3 Score: 279.964 bits (151), Expect = 1.093e-73
Identity = 220/253 (86.96%), Postives = 220/253 (86.96%), Query Frame = 1

Query:      518 ATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGC 764
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Sbjct:       11 ATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATTGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGC 263


Match Name	Summary
PKGMv1-70835_t	E-Value: 2.040e-175, PID: 98.03 Description: No definition line [more]

blastn of TPS CDS against cs10 genome

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 genome
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044374.1
Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 732.394 bits (396), Expect = 0.000e+0
Identity = 408/414 (98.55%), Postives = 408/414 (98.55%), Query Frame = 1

Query:      459 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 872
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Sbjct:  2034629 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGGACGAGATAGAAAACATCAAAAAACACATAAATGGTAATGATATCATGGGAGTATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTAAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCCTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2035042

HSP 2 Score: 529.262 bits (286), Expect = 7.325e-148
Identity = 290/292 (99.32%), Postives = 290/292 (99.32%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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Sbjct:  2036943 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATGTTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCCTATATACATAA 2037234

HSP 3 Score: 488.636 bits (264), Expect = 1.243e-135
Identity = 369/420 (87.86%), Postives = 369/420 (87.86%), Query Frame = 1

Query:      459 AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTG 872
                ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| | | || ||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2020238 AGAGATTTTTAATCATTTTAAGGACGAGATAGGAAAAATCAAAACGAACATGATTAGTGATGATATTATGGAAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAGAAAAAAGGCGAAAGTATTTTAGAAGAAGTTAGAATTTTCACAACTCAATATCTAAAGAACTACATTATAATGATATCACAAGAAAGAAAGTTAATGATTGATAATGATAATGATTATGATTATGATATCGAAATAGTGAATCACGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACTACAAGAACAGAAGCTAAGTGGTTCATCGACGCGTATGAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCTAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGACGATCTAAAACATATATTCAGGTG 2020657

HSP 4 Score: 486.789 bits (263), Expect = 4.471e-135
Identity = 269/272 (98.90%), Postives = 269/272 (98.90%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1501
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct:  2022123 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTAAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTCGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCCGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2022394

HSP 5 Score: 468.323 bits (253), Expect = 1.620e-129
Identity = 279/292 (95.55%), Postives = 279/292 (95.55%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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Sbjct:  2022990 GGAGGAACTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTATATGCAAGAAAAAAAAGTATCTGAGGAGAAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAATATGGAAAGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCTACAAATTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATGTATCAGCATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 2023281

HSP 6 Score: 411.077 bits (222), Expect = 2.768e-112
Identity = 251/264 (95.08%), Postives = 251/264 (95.08%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
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Sbjct:  2029273 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAGATGTTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATGTTAATATTAATAATCCTAATTATA---A---TTTATATGCCATTGCTCTTCAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2029530

HSP 7 Score: 387.07 bits (209), Expect = 4.665e-105
Identity = 228/237 (96.20%), Postives = 228/237 (96.20%), Query Frame = 1

Query:      854 TAAA-ACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:  2020740 TAAATATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGGGAGAATTTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAATTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 2020976

HSP 8 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.732e-95
Identity = 214/225 (95.11%), Postives = 214/225 (95.11%), Query Frame = 1

Query:      864 ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:  2035138 ATT-AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAATATTGGAATAAGATTTGAGTCAAAATTCAGCTATTTTAGAACAAAAACTGCCAAATTATTTGAGCTAGTAACATTTATAGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 2035361

HSP 9 Score: 353.83 bits (191), Expect = 4.732e-95
Identity = 245/272 (90.07%), Postives = 245/272 (90.07%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 1501
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Sbjct:  2036267 GTGGGTCGATATGTGTAAAAGTTTCTTGCAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTAGGAGCACCAGTTATTCTTGTGCATGCTTATTTTTTTCACGCAAATAATAATCGTACAATTACAAATACTAAAGAGATTTTCGAATGCTTGGAATATGGTTATTATCCTGCCATTATTCGTCACAGTGCCATAATATTACGATTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGG 2036538

HSP 10 Score: 333.517 bits (180), Expect = 6.164e-89
Identity = 190/195 (97.44%), Postives = 190/195 (97.44%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:  2015356 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCATATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGCCAATATAAGG 2015550

HSP 11 Score: 302.124 bits (163), Expect = 1.738e-79
Identity = 187/198 (94.44%), Postives = 187/198 (94.44%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 199
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Sbjct:  2028647 TTTTTAGACCAAAAGTATATACTAATTATAATATTATTAATAATAATGCTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCTGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTTGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGG 2028844

HSP 12 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.353e-75
Identity = 231/267 (86.52%), Postives = 231/267 (86.52%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATAT--T-AATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
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Sbjct:  2018107 AGGAAGAATCTTATACAGGTCGAGTCAAAGAATTGGAGATAGATGTGAAAAAGATGTTAATTGAGATGGAAAATTCTTTAATTCAACTTGAACTCATTGACACATTGCAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGGATGAAATAAATACTATTTTGAAAGAAAAATATATTAATATGATCAATAACCCTAATTAT---AATAATTTATATGTCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 2018370

HSP 13 Score: 267.038 bits (144), Expect = 6.341e-69
Identity = 144/144 (100.00%), Postives = 144/144 (100.00%), Query Frame = 1

Query:     1087 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1230
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Sbjct:  2035501 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2035644

HSP 14 Score: 211.638 bits (114), Expect = 3.014e-52
Identity = 134/144 (93.06%), Postives = 134/144 (93.06%), Query Frame = 1

Query:     1087 AGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1230
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Sbjct:  2021626 AGATGGGATATGGAAATGATAAATGAGTTACCAGAATATATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACCATTAATGAAATGGTATTTGAGGTATTAAGAGACCAACACATCTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 2021769

HSP 15 Score: 193.172 bits (104), Expect = 1.092e-46
Identity = 182/221 (82.35%), Postives = 182/221 (82.35%), Query Frame = 1

Query:      868 AGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:  2396996 AGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAG 2396776

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: NW_022060378.1
Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 366.757 bits (198), Expect = 6.078e-99
Identity = 223/235 (94.89%), Postives = 223/235 (94.89%), Query Frame = 1

Query:      855 AAAACATAT-ATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAG 1088
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Sbjct:   196619 AAAATATATAATTAAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAG 196385

HSP 2 Score: 344.597 bits (186), Expect = 2.848e-92
Identity = 263/298 (88.26%), Postives = 263/298 (88.26%), Query Frame = 1

Query:     1500 GGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAA-TGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1784
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Sbjct:   193002 GGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTATA 192706

HSP 3 Score: 294.738 bits (159), Expect = 2.909e-77
Identity = 234/270 (86.67%), Postives = 234/270 (86.67%), Query Frame = 1

Query:      197 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAAT---AATCCTAATTATTCCGATC-T--TTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAG 460
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Sbjct:   197696 AGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAG 197427

HSP 4 Score: 289.198 bits (156), Expect = 1.353e-75
Identity = 235/270 (87.04%), Postives = 235/270 (87.04%), Query Frame = 1

Query:     1230 GTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 1499
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Sbjct:   193681 GTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAAT-A-A-T-A-A---T-A-AAG-AG-A------TTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATC 193430

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: NC_044373.1
Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence

HSP 1 Score: 172.859 bits (93), Expect = 1.422e-40
Identity = 111/120 (92.50%), Postives = 111/120 (92.50%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTC 181
                ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct: 70056723 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCAGTCTC 70056604


Match Name	Summary
NC_044374.1	E-Value: 7.325e-148, PID: 98.55 Description: Cannabis sativa chromosome 5, cs10, whole genome shotgun sequence [more]
NW_022060378.1	E-Value: 6.078e-99, PID: 94.89 Description: Cannabis sativa unplaced genomic scaffold, cs10 ctgX15, whole genome shotgun sequence [more]
NC_044373.1	E-Value: 1.422e-40, PID: 92.50 Description: Cannabis sativa chromosome 4, cs10, whole genome shotgun sequence [more]

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

Performed on: 2020-09-05
Details: blastn of TPS CDS against cs10 mRNA
Display provided by the neXtProt Feature Viewer

Show Results Table

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030645439.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA

HSP 1 Score: 2915.13 bits (1578), Expect = 0.000e+0
Identity = 1721/1790 (96.15%), Postives = 1721/1790 (96.15%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTAT---TAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030645438.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA

HSP 1 Score: 2625.21 bits (1421), Expect = 0.000e+0
Identity = 1673/1796 (93.15%), Postives = 1673/1796 (93.15%), Query Frame = 1

Query:        5 TTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGGTACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATAT--T-AATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTT-A--A-TGAT--TGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA 1791
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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030629489.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 1982.58 bits (1073), Expect = 0.000e+0
Identity = 1507/1710 (88.13%), Postives = 1507/1710 (88.13%), Query Frame = 1

Query:      104 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAAT---AATCCTAATTATTCCGA-TCT--TTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1784
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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030629488.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 1969.65 bits (1066), Expect = 0.000e+0
Identity = 1507/1713 (87.97%), Postives = 1507/1713 (87.97%), Query Frame = 1

Query:      104 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAAT---AATCCTAATTATTCCGA-TCT--TTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1784
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Sbjct:       99 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGG---TGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCAT---CG-ATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGATGTTTTCTACAAGAAGCAAAATGGTACTACAGTGGATACACACCAACATTGGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCAGTCCTTATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATTCAAAT-A-A-T-A-A---T-A-AAG-AG-A------TTTTTGAATGTTTGGAACATGGTTATTATCCTACCATAATTCGTCACAGTTCCATAATAATACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCTGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTATA 1785

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BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030629490.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA

HSP 1 Score: 1345.48 bits (728), Expect = 0.000e+0
Identity = 1011/1146 (88.22%), Postives = 1011/1146 (88.22%), Query Frame = 1

Query:      104 ATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAATATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAAT---AATCCTAATTATTCCGA-TCT--TTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCA---AGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAAAAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTAT------GATATCGAAGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATG--C--GAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACG 1230
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Sbjct:      103 ATAGTTCTGTTACTAATATTGTTCGAAGATCAGCCAACTTTGAACCATCCATTTGGTCTTTTGATTTCGTTCAGTCTCTTTCAAGCAAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTAAAAAAACTCGAGGAAGATGTGAAAAGGATGCTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGACACGTTACAAAGACTTGGAGTATCTTATCGTTTTGAGAATGAAATAAATACTATTTTAAAAGAAAAATATGTCAATATTAATGGTAATATTAATAACCCTAATTATAATTTATATGCCACTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGTTATGCTGTACCTCAAGCAGAGACTTTTAATTATTTCAAGGACGAGACAGGAAAATTCAAAACAAACATAAGTGG---TGATATCATGGGAGTATTGGCCTTATATGAAGCTTCATTCTATGAAAAAAAAGGCGAAAGCATTTTAGAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAACGTCTCAAAAACTACACAATAATGATATCAGAGCAAAATAAATTGATGATTAATAATAATTATGATTATTATTACAATATTGAAGTAGTGAATCATGCTTTGGAGCTCCCACTTCATCGAAGGACCACAAGAATAGAAGCTAAGTGGTTCAT---CG-ATATGTACAAGAAAAAACAAGACATGAATCCTATTTTGCTTGAGTTTGCCAAACTCGATTTCAACATGATACAATCAACACATCATGAAGATTTGAAACATATATTCAGGTGGTGGAGGCATACTAAACTTGGTGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTTTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAACAACAACTGTCAAATTACTTGAGCTAATAACATTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTAGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTATTGAGAGATGGGATGTGGAAATGATAAATGAATTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATATTGTTTTACACAATACAATAAATGAAATGGTATTTGAGATATTAAGAGATCAACAAATCACCATCAAAATTCAATACTTAAAGAAAACG 1241

HSP 2 Score: 346.444 bits (187), Expect = 5.905e-94
Identity = 264/299 (88.29%), Postives = 264/299 (88.29%), Query Frame = 1

Query:     1499 CGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAG-AAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAA---TGA-T--G-T--TGGAT---TATATCCAATCTCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATATCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAATTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATA 1784
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Sbjct:     1240 CGGAGGAACT-AAAAGAGGTGATGCTCCGACGTCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAAATATATGTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAGTGAAGCGTGGAAGGAGATGAATAACAGTGAATCTGATGATGGATTAATATATCCAATCTCATTGATTGAAGATGCGAGAAACTTTGCTAGGATAGGATTATTCATGTATCAACATGGTGATGGTCACAGTTCTCAGGATAATCTATCCAAAGAAAGAATTTCATCCTTTATTATTAAACCTATTCCCCTATA 1537

[Close]

BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030644559.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 782.253 bits (423), Expect = 0.000e+0
Identity = 1189/1553 (76.56%), Postives = 1189/1553 (76.56%), Query Frame = 1

Query:      120 TATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTT--A-CAAGTCAATATAAGGGAGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAA-A-A-AATATTAGTTGAGATGGAA---AACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACATTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTATTTTGAACAAAAAATATCT-C---AATATTA---ATAATCCTAATTATTCCGATCTTTTATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCAGTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGAT-AGAA--AACATCAAAAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAGCTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATTTTCACAACTGAATGTCTC-AAAA--AC-TA-C-ACTATAATGATATCAGAGC-AAA-AAA--A--GTTA--A-TGATTGATAATGATTATGATTATGATATCG-A--AGTAGTGAATCATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAGTGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCTTGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAGATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAATTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGGAATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAATTATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAAAATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTG-TTTTACACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATTTCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGGTTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAGAAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATTGTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACA-GTTACAAGTAGTAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTCGTCAT-AGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATC-ATCGGAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCAAGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAATAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGA 1631
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Sbjct:      194 TATTCATAGAAGATCAGCCAATTATGAACCTCCCATTTGGTCTTTTGATTACATTCAATCTCTTTCATCAAGCCAATATAAGGGAGAAACATGTACAAGTAGATTGAATGAGCTAGAGGCAAATGTGAAAGAGATATTGTTAGTTGAGATGAAATCTAACTCTTTAGCTCAACTTGAGTTTATTGATGCATTGCAAAGACTTGGATTATCTTACCGTTTCGAGACTGAAATAAACACTATTTTAAATGAAAAGTA-CTCCGGTAATATTATCGATAACCCTAATTAT----A--ATTTGTACGCCACAGCTCTCGAATTCAGGCTTCTACGCCATCATGGTTATGATGTATCTCAAGAAATTTTCAATGTGTTTAAGGATGAGATTACAAGCAAGTTCAAGGCAAGAACGAGTGGCGAAGATATAATTGGAGTATTGGCTTTATACGAAGCTTCATTCTATGGCAAAAAAAGTGAAAGTATTTTGGAAGAAGCTAGGGTTTCCTCAATCGAATGTCTCGAAAATTACGTAGCAACTATGACG--AT-GGAGCGAAACAAACCATCATTATTAGTCAATGATTATGATGATGATAATAATATGTTATTATTAGTGAATCATGCCTTGGAGCTTCCACTTTATTGGAGAATAACAAGATCAGAAGCAAGGTGGTTCATTGATTTATATGAAAAAAATCATAACATGAATTCTACTTTGCTTGAATTTGCCAAATTGGATTACAACATGGTACAATCCATATATCAAGAAGATCTAAAACATCTCTCAAGGTGGTGGAGCCATACAAAACTTGGAGAGAAAATGGATTTCTTTAGAGATAGATTAATGGAGTGTTTCTTATGGACTGTGGGAATAGCATGTGAGCCAGAAAAAAGCTATTATAGAAGAATGTCTGGAAGATTATATGTTCTAATAACAACAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACATTGGAGGAATTAGAGCTTTTCACTAATGCAGTTGAGAGATGGGATGTGAAAGCAATGGATGATTTACCAGAATATATGAGGATGCCTT-TCTTTCTTTTACACAATACCATAAACGAAATGGCTTTCGATGTGTTAGGACACCAA-AA-TTTCC-TCAACGTTAAATTCCTTAAGAGGACGTGGGTAGATTTCTGTAAACATCAATTACAAGAGGCAAAATGGTTTCACAGTGGATACAAACCAACATTCGAAGAATACATTAACAATGCATGGATTTCGGTATCAGGACCGATTATTCTTATGGATGCTTATTTCTCTCTTACAAATCCTGTT-ACAAAAGATGCCA-TA--AA-----TTT---ACTG----GAATTAGG---TTATCCACCCATAATTTACCATGCAT-CCATGATTCTACGACTTACAGATGATCTAGGAACATCGAAT-GATGAAATGAAAAGAGGTGATATTCCGAAATCAATTCAATGTTACATGAACGATACAGGTGTTTCTGAAGATGAAGCTCGAGATCATATGAAGTTTCTAATAAGTGAATTATGGAAGGAAATAAATAATGA 1711

[Close]

BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030640479.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.372e-40
Identity = 107/115 (93.04%), Postives = 107/115 (93.04%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCA 176
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[Close]

BLAST of KY014562.1 vs. Genbank
Match Name: XM_030640478.1
Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA

HSP 1 Score: 169.165 bits (91), Expect = 1.372e-40
Identity = 107/115 (93.04%), Postives = 107/115 (93.04%), Query Frame = 1

Query:       62 GATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCCTCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCA 176
                ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct:      116 GATTATCAAGTACTTGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGGTCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTAGAACCATCCATTTCGTCTTTTGATTATAGTCA 2


Match Name	Summary
XM_030645439.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 96.15 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716605), mRNA [more]
XM_030645438.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 93.15 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115716604), mRNA [more]
XM_030629489.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 88.13 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030629488.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 87.97 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030629490.1	E-Value: 5.905e-94, PID: 88.22 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115702029), transcript variant X3, mRNA [more]
XM_030644559.1	E-Value: 0.000e+0, PID: 76.56 Description: PREDICTED: Cannabis sativa myrcene synthase, chloroplastic (LOC115715884), transcript variant X1, mRNA [more]
XM_030640479.1	E-Value: 1.372e-40, PID: 93.04 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X2, mRNA [more]
XM_030640478.1	E-Value: 1.372e-40, PID: 93.04 Description: PREDICTED: Cannabis sativa pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13600 (LOC115712221), transcript variant X1, mRNA [more]

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

Performed on: 2021-09-02
Display provided by the neXtProt Feature Viewer


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 10..32
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 74..94
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None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 25..45
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None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 17..39
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..16
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 17..39
None	No IPR available	PHOBIUS	NON_CYTOPLASMIC_DOMAIN	Non cytoplasmic domain	coord: 1..5
None	No IPR available	PHOBIUS	CYTOPLASMIC_DOMAIN	Cytoplasmic domain	coord: 28..40
None	No IPR available	PHOBIUS	TRANSMEMBRANE	Transmembrane region	coord: 6..27
None	No IPR available	TMHMM	TMhelix		coord: 4..26
IPR036965	Terpene synthase, N-terminal domain superfamily	GENE3D	1.50.10.130		coord: 89..261 e-value: 2.7E-183 score: 611.9
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IPR001906	Terpene synthase, N-terminal domain	PFAM	PF01397	Terpene_synth	coord: 53..212 e-value: 1.3E-42 score: 145.7
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	GENE3D	1.10.600.10		coord: 52..578 e-value: 2.7E-183 score: 611.9
IPR008949	Isoprenoid synthase domain superfamily	SUPERFAMILY	48576	Terpenoid synthases	coord: 262..592
IPR008930	Terpenoid cyclases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid	SUPERFAMILY	48239	Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases	coord: 50..262

Cannabis sativa isolate Finola_TPS11 terpene synthase mRNA
complete cds

Interpro result TPS-TSA-THC Csativa

blastn of TPS CDS against cs10 mRNA

blastn of TPS CDS against cs10 genome

blastn of TPS CDS against pkv5 mRNA

blastn of TPS CDS against pkv5 genome

NCBI Download

Sequences

Sequence	ATGCTTTATAGACCAAAAATATATACTAACTATAATATTATTAATGGTGG TACAAAATCAAGATTATCAAGTGCATGCTACCCCATCCAATGTGCTGTGG TCAATAGTTCTAATGCAATTATTGATCGACGATCAGCCAACTTTGAGCCC TCCATTTGGTCTTTCGATTATATTCAATCTCTTACAAGTCAATATAAGGG AGAACCTTATACAAGTCGAGTGAAAAAACTTGAGAGAGATGTGAAAAAAA TATTAGTTGAGATGGAAAACTCTTTAGCTCAACTTGAACTCATTGATACA TTGCAAAGACTTGGAATATCTTACCGTTTTGAGAATGAAATAAATTCTAT TTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAATAATCCTAATTATTCCGATCTTT TATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCA GTACCTCAAGAGATTTTTAATCAGTTGAAGAACGAGATAGAAAACATCAA AAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAG CTTCTTTTTATGAGAAAAAATGCGAAAGTATTTTAAAGGAAGCTAGAATT TTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAA AAAGTTAATGATTGATAATGATTATGATTATGATATCGAAGTAGTGAATC ATGCTTTAGAGCTCCCACTTCATCGGAGGACCACAAGAACAGAAGCAAAG TGGTTCATTGACGCATATGCGAAAAAACAAGACATGAATCCTATGTTGCT TGAGTTAGCCAAACTCGATTTCAACATAGTACAATCAACACATCATGAAG ATCTAAAACATATATTCAGGTGGTGGAGACATACTAAACTTGGAGAGAAA TTGAATTTTGCAAGAGATCGATTGATGGAATGTTTCTTATGGAAAGTTGG AATAAGATTTGAGCCAAAATTCAGTTATTTTAGAATAACAACTGCCAAAT TATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACA TTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAA AATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTAC ACAATACCATAAATGATATGGTATTTGAGGTGTTAAGAGACCAAGAAATT TCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGG TTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAG AAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATT GTGCATGCTTATTTTTCTCATGCAAATTATAATCACACAGTTACAAGTAG TAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTC GTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCG GAGGAATTGAAAAGAGGTGATGCTCCGACATCAATTCAATGTTACATGCA AGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAA TAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATC TCATTGACTGAAGATGCTACAAACTTTGCTAAGATGGGATTTTTCATATA TCAACATGGTGATGGTCATAGTTCTCAAGATAATCAATCCAAACAAAAAA TTTCATCCTTGATTATTGAACCTATTCCCTTATATACATAA
Sequence Length	1791
Sequence Checksum	f72196743bbe2ee841b1541a7ec15ae7

Sequence

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TTTGAACAAAAAATATCTCAATATTAATAATCCTAATTATTCCGATCTTT
TATATGCTATTGCTCTTGAATTTAGGCTTCTACGTCAACATGGCTATGCA
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AAAAAACATAAATGGTAATGATATCATGGGAATATTAGCCTTATACGAAG
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TTCACAACTGAATGTCTCAAAAACTACACTATAATGATATCAGAGCAAAA
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TATTTGAGCTAATAACAGTAATTGATGATATATATGATGTTTATGGAACA
TTGGATGAATTAGAGCTTTTCACCAAAGCTGTTGAGAGATGGGATGTGAA
AATGATAAATGAGTTACCAGAATACATGAAGATGCCTTATCTTGTTTTAC
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TCCATCAACATTCAATACCTTAAGAAAACGTGGGTAGATATGTGTAGAGG
TTTTTTACAAGAGGCAAAATGGTACTATAGTGGATATACACCAACACTAG
AAGAATATATTGAAAATGGTTGGATTTCAGTGGGAGCACCGGTTCTAATT
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TAAAGAGATTTTTGAATGCTTTGAACATGGTTATTATCCTGCCATAATTC
GTCATAGTGCCATAATATTACGACTTACAAATGACCTAGCAACATCATCG
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AGAAAAAAATGTATCTGAAGAGGAAGCTCGTGAACATATTAAGTTTTTAA
TAAATGAAGCATGGAAGGAGATGAATAATGATGTTGGATTATATCCAATC
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Sequence Length

1791

Sequence Checksum

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Summary

Resource Type	mRNA
Accession	KY014562.1
Organism	Cannabis sativa L.
Name	KY014562.1
Identifier	KY014562.1
Time Accessioned	Thursday, November 21, 2024 - 09:59
Time Last Modified	Thursday, November 21, 2024 - 09:59